Taxonomia, clades

Vida | Arbre de la vida | Llista espècies |

Linneu va proposar el Systema naturae (1758), basant-se en les semblances i diferències morfològiques. A partir de la teoria de l’evolució de Darwin (1859), tenia més sentit ordenar la vida segons la diversificació al llarg de l’evolució, com les branques d’un arbre. Així, per exemple, es va assenyalar que les aus procedien dels dinosaures. Haeckel (1834-1919), que va fer tants estudis sobre protistes, els proposà com a tercer reialme. (Kunstformen der Natur ). El 1957 Julian Huxley proposà els cladogrames (del grec klados=branca). (El concepte també s’aplica a l’evolució de les llengües). Abans de la teoria de l’evolució, en una concepció “estàtica” de les espècies, es pensava en termes d’una escala, amb l’home dalt de tot. El 1969 els fongs se separen de les plantes.

Arbre de la vida de Darwin (1859)

Arbre de la vida de Haeckel (1879)

SI podem definir un grup que inclogui tots els descendents d’un mateix antecessor comú, aquest és monofilètic . Si fem una agrupació on s’exclouen algun dels grups descents, aquesta és parafilètica. Per exemple els rèptils no inclouen les aus. (El grup verd no inclou el blau que té el mateix antecessor).

Inicialment els criteris per dibuixar el cladograma eren morfològics (el crani sinàpsid, sang freda o calenta, notocorda). Amb la possibilitat de les seqüències de DNA, es poden tenir en compte les semblances de codi, que poden arribar a ser sorprenents: el DNA que compartim amb altres espècies).

Del punt de vista dels gens, la diversitat més gran és en les formes de vida més bàsiques:

Open Tree of Life: web navegable per nodes

Catalogue of Life : projecte d’aplegar totes les espècies conegudes

Una visió general seguint la Encyclopedia of life (Smithsonian):

[Procariotes]

[Eucariotes]

Proposta de Shipunov (2007), 11 phylums de Monera, 23 de Protista (inclouen bolets i algues),

Regnum Monera
Superphylum Archebacteria
Phylum 1. Archebacteria [ 6Methanobacterium ]
Superphylum Bacteria [ 6.2Bacillus ]3
Phylum 2. Firmicutes [ 6Bacillus ]4
Phylum 3. Actinobacteria [ 6Actynomyces ]]
Phylum 4. Hadobacteria [ 6Deinococcus ]
Phylum 5. Chlorobacteria [ 6Chloroflexus ]7
Phylum 6. Cyanobacteria [ 6Nostoc ]
Phylum 7. Bacteroidetes [ 6Bacteroides ]10
Phylum 8. Spirochaetes [ 6Spirochaeta ]]
Phylum 9. Planctobacteria [ 6Planctomyces ]12
Phylum 10. Proteobacteria [ 6Rhodospirillum ]
Phylum 11. Endomicrobia [ 6Endomicrobium ]

Regnum Protista

Superphylum Opistokontha [ 6.2Agaricus ]
Phylum 12. Choanozoa [ 6Sphaeroeca ]
Phylum 13. Eomycota* [ 6Mucor ]
Phylum 14. Microsporidia [ 6Microsporidium ]
[Bolets 15 i 16]
Phylum 15. Basidiomycetes [ 6Agaricus ]
Phylum 16. Ascomycetes [ 6Ascomyces ]
Phylum 17. Amoebozoa sed.m. [ 6Amoeba ]33
Phylum 18. Apusozoa sed.m. [ 6Apusomonas ]39
Phylum 19. Cercozoa [Subphylum Retaria amb Foraminifera, i Radiolaria Superphylum Excavata [ 6.2Euglena ]
Phylum 20. Metamonada [ 6Trichomonas ]
Phylum 21. Euglenozoa [ 6Euglena ]
Superphylum Alveolata [ 6.2Paramecium ]
Phylum 22. Dinozoa [ 6Peridinium ]
Phylum 23. Ciliophora [ 6Paramecium ] (3, 13, 14)
Superphylum Chromista [ 6.2Fucus ]
Phylum 24. Labyrinthomorpha [ 6Labyrinthula ]
Phylum 25. Bicoecea [ 6Bicosoeca ] ]72
Phylum 26. Opalozoa [ 6Opalina ]
Phylum 27. Oomycota [ 6Saprolegnia ]
Phylum 28. Chromophyta [ 6Fucus ]
Superphylum Chloronta [ 6.2Volvox ] algues
Phylum 29. Haptophyta [ 6Prymnesium ]
Phylum 30. Centrohelida [ 6Raphidiophrys ]
Phylum 31. Cryptista [ 6Crypromonas ]
Phylum 32. Glaucophyta [ 6Glaucocystis ]
Phylum 33. Rhodophyta [ 6Bangia ]
Phylum 34. Chlorophyta* [ 6Volvox ]

Regnum Vegetabilia [ 7Magnolia ]

Phylum 35. Bryophyta* [ 6Bryum ]
Phylum 36. Pteridophyta* [ 6Pteris ]
Phylum 37. Spermatophyta [ 6Magnolia ]

- Classis 1(170). Cycadopsida [ 5Cycas ]
- 2(171). Ginkgoopsida [ 5Ginkgo ]
- 3(172). Gnetopsida [ 5Gnetum ]
- 4(173). Pinopsida [ 5Pinus ]97
- 5(174). Angiospermae [ 5Magnolia

Regnum Animalia [ 7Felis ]
Subregnum Parazoa
Phylum 39. Spongia, esponges
Subregnum Eumetazoa
Infraregnum Anephrozoa* [ 6.5Felis ]
Phylum 40. Ctenophora
Phylum 41. Cnidaria, meduses
Phylum 42. Acoelomorpha [ 6Convoluta ]
Phylum 42. Acoelomorpha [ 6Convoluta ]
Infraregnum Deuterostomia
Phylum 43. Xenoturbellida [ 6Xenoturbella ]
Phylum 44. Echinodermata [ 6Echinus ] /Classis 1(192). Crinoidea [ 5Metacrinus ]/2(193). Ophiuroidea [ 5Ophiura ]/3(194). Asteroidea [ 5Asterias ]101/4(195). Echinoidea [ 5Echinus ]
Phylum 45. Hemichordata [ 6Balanoglossus ]102

Phylum 46. Chordata [ 6Felis ]

- Subphylum Cephalochordata [ 5.8Branchiostoma ] / Classis 1(199).
  - Cephalochordata [ 5Branchiostoma ]
- Subphylum Vertebrata [ 5.8Felis ]
  - Classis 2(200). Cyclostomata stat.m. [ 5Myxine ]
  - 3(201). Chondrichtyes [ 5Squalus ]
  - 4(202). Actinopterygii [ 5Perca ]
  - 5(203). Dipnoi [ 5Peripatus ]103
  - 6(204). Amphibia [ 5Rana ]
  - 7(205). Reptilia* [ 5Gecko ]
  - 8(206). Aves [ 5Gallus ]
  - 9(207). Mammalia [ 5Felis ]
- Subphylum Tunicata [ 5.8Ciona ]/ Classis 10(208). Ascidiacea [ 5Ciona ]104

Infraregnum Protostomia [ 6.5Araneus ]
Superphylum Chaetognatha [ 6.2Sagitta ]
Phylum 47. Chaetognatha sed.m. [ 6Sagitta ]
Superphylum Spiralia [ 6.2Scarabaeus ]
Phylum 48. Gastrotricha [ 6Macrodasys ]
Phylum 49. Gnathifera [ 6Rotifer ]
Phylum 50. Platyhelminthes [ 6Planaria ]
Phylum 51. Dicyemida sed.m. [ 6Dicyema ]
Phylum 52. Nemertini [ 6Nemertes ]
Phylum 53. Bryozoa [ 6Plumatella ]
Phylum 54. Mollusca [ 6Trochus ]
Phylum 55. Brachiopoda [ 6Lingula ]
Phylum 56. Annelida [ 6Nereis ]
Phylum 57. Orthonecta sed.m. [ 6Rhopalura ]
Superphylum Ecdysozoa [ 6.2Scarabaeus ]
Phylum 58. Cycloneuralia*
Phylum 59. Tardigrada [ 6Macrobiotus ]s ]
Phylum 60. Arthropoda [ 6Araneus ]

- Subphylum Onychophora [ 5.8Peripatus ]
  - Classis 1(242). Onychophora [ 5Peripatus ]
- Subphylum Cheliceromorpha [ 5.8Araneus ]
  - Classis 2(243). Chelicerata [ 5Araneus ]115 (Haeckel 66)
  - 3(244). Pantopoda [ 5Pycnogonum ]
- Subphylum Myriapoda [ 5.8Lithobius ]
  - Classis 4(245). Chilopoda [ 5Scolopendra ]
  - 5(246). Progoneata stat.m. [ 5Julus ]116
- Subphylum Pancrustacea [ 5.8Scarabaeus ] agrupa crustacis i insectes
  - Classis 6(247). Ichthyostraca [ 5Argulus ]117
  - 7(248). Ostracoda stat.m. [ 5Cypris ] haeckel 47, 56)
  - 8(249). Maxillopoda [ 5Balanus ]118
  - 9(250). Malacostraca [ 5Cancer ]119
  - 10(251). Remipedia [ 5Speleonectes ]
  - 11(252). Cephalocarida [ 5Hutchinsoniella ]
  - 12(253). Branchiopoda [ 5Daphnia ]
  - 13(254). Hexapoda [ 5Scarabaeus ]120 haeckel 58

Dificultats

la classificació segueix essent discutida: contested world taxonomy (link)