La vida. Contemplació

La vida

La contínua restauració de l’ordre, el cos en constant reconstrucció. La diversitat del món viu. La meva continuïtat amb tot el vivent. Art i natura


La contínua restauració de l’ordre, el cos en constant reconstrucció.

La vida, doncs, és un procés que contínuament està restaurant les estructures que de manera natural es desintegren, com un mur de sorra que es va desfent per les onades i contínuament refem. Això passa (1) a nivell intracel·lular, fabricant noves molècules i mantenint la cèl·lula, un procés de metabolisme cel·lular que dura unes hores. (2) A nivell cel·lular quan les cèl·lules es reprodueixen per mitosi mantenint els teixits de l’organisme (setmanes a mesos, el cos en constant reconstrucció). (3) A nivell d’espècie, quan els organismes es reprodueixen, mesos a anys. I potser (4) a nivell global quan les espècies es modifiquen al llarg de l’evolució.  (milers d’anys) [a cada hàbitat les espècies s’ajusten les unes a les altres en un conjunt de relacions complexes i es modifiquen en l’evolució per mantenir la vida global]. Així, reconstruim per mantenir la cèl·lula, l’organisme, l’espècie i la vida global. Ontològicament és com un vaixell de Teseu, les peces van canviant contínuament, però la forma és un invariant.


El món viu

Les ciències de la vida, ens classifiquen les espècies, descriuen els òrgans i els seus processos, entren a mirar dins de la cèl·lula. Quina és la mirada global?

Que sapiguem, en un sol planeta a l’univers es van començar a donar uns processos complexos de creixement i reproducció (Pensar la vida ) que han anat evolucionant i trobant múltiples maneres d’existir (Espècies)  , a l’aigua, fora, com a planta, forma oberta, quietes fent la fotosíntesi, com a  animal, forma tancada, trobant nutrients. Amb esquelet els vertebrats, amb exoesquelet uns altres, invertebrats tous. Els fongs que digereixen fora. Cadascun trobant el seu nínxol en diferents hàbitats i comunitats, adaptant-se al clima de diferents regions. (  La vida que tenim al voltant).

Quina seria la demografia dels éssers vivents? Quines llavors han germinat avui, quantes parelles d’espècies s’han acoblat? Quantes cries han sortit de l’ou? Les fulles miren al sol, les arrels beuen aigua, uns busquen pastures, herbes a mastegar, altres preses a caçar, els paràsits troben hostes on passar una temporada. Uns busquen parella, els ocells emprenen viatges migratoris. Digestions, excrecions.


La meva continuïtat amb tot el vivent

L’evidència del dna que compartim amb altres espècies, la universalitat del codi genètic, la torxa de la vida (Lucreci, De la natura) ha anat passant d’un organisme a un altre, al llarg de l’evolució. Si féssim una galeria dels avantpassats recorreríem les generacions de la història, els homínids, els primats i mamífers , els amfibis sortint de l’aigua, un peix que va ser el nostre rebesavi.


La natura en les il·lustracions científiques, l’art, fotografia i vídeo.

L’exposició biomorfisme sobre art i natura (Caixaforum 2023) pretenia, suposo, posar costat per costat, obres d’artistes inspirades en la naturalesa, i formes de la naturalesa que semblen art abstracte. Kandinsky, Klee, Penone i una sorprenent escultura que era una bassa d’un líquid agitat, com una vida primària a punt d’emergir, de Pamela Rosenkranz. Pensava que hi podria afegir els dibuixos de Gemma Anderson, les il·lustracions de Kunstformen der Natur, de Haeckel, les fotografies de Feininger, els animals imaginaris de Paul Klee, una mirada a la diversitat de formes de la naturalesa, les fulles, les diferents mides, de les molses les sequoies, de la formiga a la balena, l’anatomia comparada de Cuvier amb els esquelets dels vertebrats, enllaços als concursos de macrofotografia, el microscopi, les formes dels teixits, l’arquitectura de l’interior dels ossos. I si tinc una exposició sobre la imatge de la natura, també en podria tenir una dels sons? i enllaçar amb el llenguatge dels animals? I les olors?

Tinc descarregats:

  • 1554. Gessner. Historia Animalium.
  • 1576. Lobel. Plantarum
  • 1580. Herbari de Brunfels
  • 1665 Robert Hooke. Micrographia
  • 1679-1717 Cartes de Leeuwenhoek
  • 1705 Metamorphosis insectorum Surinamensium de Maria Sibylla Meriam

I la sèrie de vídeos de Planet Earth de la BBC.


Animals petits

(Article Guardian)


Brookesia nana, camaleó Madagascar, 20mm


Musaranya Suncus etruscus, de 2g. També hi ha un ratpenat de 30 mm


Colibrí, Mellisuga helenae, Cuba, 50-60mm


L’amfibi més petit, la granota Paedophryne amauensis de Papua Nova Guinea


L’insecte més petit, vespa paràsita Dicopomorpha echmepterygis, 0.139mm


Mycena subcyanocephala, bolet fotografiat a Taiwan.

Wolffia globosa, la planta amb flor més petita.

La Vida. Qüestions

La vida

Limitacions. Frontera animals i éssers humans, Drets. Biodiversitat.


Limitacions

No tenim una explicació prou bona quant a l’origen de la vida, tots els detalls de l’evolució, o el desenvolupament de l’embrió. Tampoc sabem per a què serveix cada fragment de DNA.

El 1993 va començar el projecte del Genoma humà, completat el 2003. Hi havia l’expectativa que, disposant del “plànol”, podríem modificar els “plànols  defectuosos”, és a dir, eliminar les malalties hereditàries, i fins i tot introduir millores. El problema és que no sabem interpretar els plànols. (Wired 30/12/2020), Quanta Magazin 08/09/2021). Molta part del genoma no sembla codificar proteïnes (Genome Dark Matter, BBC 12/4/2023).


Frontera animals persones.

Durant segles hem tingut una visió del món antropocèntrica, l’home amb l’ànima racional, i els animals amb l’ànima sensitiva. L’home pot tenir drets i els animals poden ser caçats i explotats.

La diferència no és tan gran.

DNA. Compartim un 88% de DNA amb els ratolins ( Dna que compartim amb altres espècies), [l’exposició sobre els avantpassats ens mostra els esquirols amb rebesavis i els llargandaixs com cosins].

Intel·ligència. Hi ha indicis de comportament intel·ligent en els animals. Organització social en els insectes. Llenguatge (New Yorker 13/06/2022 The strange and Secret ways that animals perceive the world ). Comportament dels ocells revelat a l’hospital dels Jain a la Índia (que van introduir les primeres lleis de respecte als animals) (Atlantic 2029).
El comportament  intel·ligent dels pops  (BBC 12/2021), que tenen només 86 vegades menys neurones que els humans, fa qüestionar-se si és lícit criar-los per menjar (sistema nerviós). No ho acceptem amb gats i gossos.

Emocions. Darwin va suggerir que les emocions tenien un paper en l’adaptació i que es donaven en animals a The Expression of the Emotions in Man and Animals. D’altres científics van alertar de projectar estats anímics humans a animals amb determinada expressió. [Però és evident que senten dolor]. Hi ha estudis amb diferents animals, gossos, cavalls, ocells, ratolins (wiki). 2024: Evidències de conducta intel·ligent, capacitat per jugar i estratègies per evitar el dolor (BBC). Emocions dels primats (Greater Good). Emocions als insectes ( BBC). Les mosques busquen aliment més intensament si pateixen gana. Hi ha indicis que poden patir dolor.

I alguns defensen l’existència de consciència en animals, no només mamífers (Vox).


Drets dels animals

Advocats pels drets dels animals van plantejar un judici per reclamar l’estatus de persona, amb tots els drets que comporta, a un elefant. (New Yorker 7/3/2022).

L’explotació ramadera manté els animals, pollastres, porcs, vedells, en unes condicions de patiment. Els limita l’espai i els moviment i els alimenta de manera antinatural. Alhora, la selecció i modificació genètica els altera per augmentar la producció. Els tracta com a fàbriques químiques i no com a éssers vius que senten. El 1944 a Anglaterra es van conscienciar que ser vegetarià no era suficient per evitar el patiment animal. La producció d’ous i làctics, no implica la mort de l’animal però sí unes condicions de vida inacceptables. El 1949 Leslie J Cross formula el veganisme com el “principi d’emancipació dels animals envers l’explotació dels humans.” The Vegan Society.

2024. Condicions cruels del transport de bestiar per mar (BBC)


Biodiversitat

L’explotació dels recursos i la destrucció d’hàbitats causa l’extinció d’espècies. Això suposa la pèrdua irreparable d’una riquesa i alhora una alteració dels hàbitats. El canvi climàtic ho agreuja.

World Wild Life vetlla per la protecció de les espècies amenaçades.

Projecte de seqüenciar el Genoma de totes les espècies (New Yorker  9/8/2023). Banc de llavors a Salvard.

Primats

44V La vida  |   Arbre de la vida   llista espècies  La vida que trobem al voltant

(Arbre de la vida. Primats).


  • Strepsirrhini: P Estrepsirins (es distingeixen per la forma de les dents de davant i membrana als narius). Lorisifomes: 10 espècies de loris i potos, animals nocturns amb grans ulls, Eocè, 40Ma. Lemuriformes, 20 espècies localitzades a Madagascar, abans més extens, Eocè, 40Ma.
  • Haplorrhini
    • P H Tarsis, 3 espècies al suedst asiàtic, Paleocè 50Ma, Tarsius, petits d’ulls rodons.
    • P H Simiformes, els simis se separen dels Tarsis al Paleocè, 60Ma
      • P H S Platirins, els simis del Nou Món, narius que apunten al costat, que van evolucionar a partir dels Africans fa 40Ma, registre fòssil Oligocè, 50 espècies. (tabic nasal ample, cua prènsil, primats del nou món com el Uacari o el mico aranya)
      • P H S Catirrinos , narius que apunten cap avall,  Aegyptopithecus p.202 20Ma 34Ma, 5 famílies extingides.  (tabic nasal estret, sense cua, polze ben desenvolupat)
        • P H S C Cercotipecoideus: o micos del vell món, babuins, macacos, 80 espècies, Miocè 20Ma. (dentadura defensiva, babuins i mandrils de cul vermell). Un estudi sobre la seva vida social (Pinillos 54) ens diu que formen grups de 10 a 200, ocupant una àrea relativament petita de 5 a 10 km2 [en vanvi l’home paleolític ocuparà de 300 a 1000 km2; és com els infants que tenen un univers limitat a la casa i el carrer]. Són vegetarians i no coparteixen el menjar. La comunicació és gestual i molt limitada. No hi ha divisió del treball. La relació entre mascle i femella no és prolongada; hi ha promiscuïtat total i no hi ha tabú pel que fa a l’incest.
        • P H S C Hominoideus: 4 famílies extingides (20.4 Ma). (extremitats llargues, barbeta rodona, sense cua, neopalio (3er desenvolupament del córtex H0100) ben diferenciat). (  Driopitecus †, antecessor dels pòngids i els homínids. Procònsul i Ramapitecus. Miocè)

Mamífers

44V La vida  |   Arbre de la vida   llista espècies  La vida que trobem al voltant


Mammalia. Originats a partir dels Synapsida, els “cosins” dels rèptils que van desenvolupar una obertura al crani rera l’ull (imatge). Els Sauròpsids, o bé o en tenen (anàpsids, extints i tortugues), o bé en tenen dues (diàpsids, dinosaures, rèptils, ocells). 6.000 espècies. Triàssic, Secundari. Revestiment de pèl, glàndules mamàries .  Sang calenta. Tenim els Prototeria (1) que encara ponen ous, els Marsupialia (2), Eutheria, la resta (3-18), després de la fecundació, l’embrió serà fetus i viurà en una bossa bescanviant metabolisme amb la mare, després de néixer s’alletarà del pit (mamífer=mamen). Això vol dir que tenen llavis i galtes per fer ventosa i xuclar (Folch).

  • Prototeria: primitius com l’ornitorrinc o l’equidna, regulació de la temperatura encara imperfecta.
  • Marsupialia: Sense placenta, cries amamantades i transportades en una bossa: koala, zarigüeya, cangur, dimoni de Tasmania.
  • Insectivora: Eriçó, musaranya, talp són els mamífers més primitius i segurament tot grup hi té un antecessor. Cretàcic, secundari.
  • Scandentia, Tupaies, petits rosegadors del sudest asiàtic
  • Chiroptera. Ratpenats que volen de nit orientant-se pel rebot d’ultrasons, insectívors.
  • Dermoptera. lemur volador, Asia.
  • Edentata. Gandul, armadillo
  • Pholidota. Pangolins, coberts d’escames, sense dents, llengua llarga per xuclar formigues
  • Rodentia Rosegadors, 2.000 esp, dos incisius que creixen contínuament. Hystricomorfa: Chinchillidae, porcespí, Myomorfa: Zapodidae, Platacanthomydae: esquirols, Giridae: lirons, Muridea amb Critecidae: rates, hamster i Muridae: ratolins, Sciuromorfa: Castoridae: castors, Sciuridae: esquirols, marmotes.
  • Lagomorfa: llebre i conill, similars als rosegadors però amb una filogènia independent.
  • Carnívors. Pinnipedia: foques, morses, Carnivora amb Aeluroidea (Felidae: gat, lleó, pantera, Hyaenidae: hienes, Viveridae: gineta. Arctoidea (Mustelidae: mustela, Procyconidae:, Ursidae: ossos, Canidae: gos, guineu, llop.
  • Tubulidentata: ós formiguer
  • [Subungulats]
  • Sirenia: vaques marines
  • Proboscidea: elefants
  • Hyracoidea: damans rosegador relacionat amb els elefants
  • [Ungulats]
  • Perissodactyla.(nombre senar de dits). Rinocerontidae: rinoceronts, Tapiridae: tapirs, Equidae: cavall, ase, zebra.
  • Artiodactyla. (nombre parell de dits). Suiformes: Hipopòtams, Tayasuidae, Suidae: Porc i senglar, Camelidae: camell (2 bonys), dromedari (1 bony), vicunya, llama, Ruminantia: (Girafa, okapi), Cervidae, Antilocapridae, Tragulidae, Bovidae (Bovinae: vaques, Antilopinae, Gazelinae, Ovinae: ovelles, cabres, isard).
  • Cetacea: derivats dels artiodàctils? Mysticeti balenes que s’alimenten de plancton filtrat, Odontoceti amb dents, catxalot, narval, dofí, marsopa.
  • Primats. (relació amb insectívors i scandentia). Miocè, Terciari. (Arbre de la vida. Primats).

Aus

44V La vida  |   Arbre de la vida   llista espècies  La vida que trobem al voltant


Aves 9.000 espècies. Recobertes de plomes, quilla sortint a l’estern en un esquelet sòlid i lleuger, bec, musculatura i cor vigorós (500/min), ovípars, nidífars, esbarts, sang calenta. (Maluquer). Juràssic, Secundari. 5 ordres de Paleògnats colls i cames llargs, menys adaptats a volar i la resta que inclou la majoria. Despréa els 2 grups de Galloanserae i després la resta.

Rèptils

44V La vida  |   Arbre de la vida   llista espècies  La vida que trobem al voltant


Reptilia 6.000 espècies.  Pell amb plaques i escames còrnees, ovípars, sang freda. Primari, Carbonífer.

    • Crocodilia (cocodrils, gavials, caimans i al·ligàtors): 27 espècies
    • Sphenodontia (tuatara de Nova Zelanda): 1 espècie
    • Squamata (sargantanes, serps i amfisbènids o «llangardaixos cuc»): aproximadament 11.052 espècies. Lacertilia: llargandaixos (60 cm.), dragó, sargantana, camaleó. Serpentes (Ofidis): escurçó (cap triangular i arremangat, pupil.la vertical, llocs humits, crepuscle 40-60 cm. verinós), colobra (cap i ull arrodonit, llocs secs, migdia, 120 cm.
    • Chelonia o Testudines (tortugues, tortugues d’aigua i tortugues d’estany): 361 espècies

Un cocodril es reprodueix sol. Partenogènesi. (BBC)

Amfibis

44V La vida  |   Arbre de la vida   llista espècies  La vida que trobem al voltant


Amphibia 4.000 espècies. Larves aquàtiques, adults terrestres (els primers i més primitius) quatre extremitats, orifici nasal comunicat amb la boca, pell nua, sang freda.

    • Anura. sense cua, potes posteriors llargues, Ranidae (granotes), Bufonidae (Gripaus) (7 fam.)
    • Caudata o urodels. 695 espècies en 6 famílies. Salamandres, tritons.
    • Gymnophiona o àpodes, que han perdut les potes. 200 espècies. Depredadors subterranis.

Peixos

44V La vida  |   Arbre de la vida   llista espècies  La vida que trobem al voltant


Peixos 36.000 espècies. Ordovicià i Silúric.

    • Sense mandíbula. Hyperoartia, llamprees. Myxini, en forma d’anguila. (fòssil Ostracoderma).
    • Gnatosthomata (amb mandíbula)
      • Cartil·laginosos: Chondrichthyes. Elasmobranquis (600 esp.: Selacea: taurons, bons nedadors, Batoidea: rajades,) Holocephala: quimeres
      • Osteictis, peixos amb ossos (peixos ossis, crani o tot l’esquelet ossificat, opèrcul branquial, veixiga natatòria, normalment fecundació externa) 20.000 espècies.
        • Actinopterygii, 99% dels peixos, aletes membranoses sostingudes per radis. Chondrostei, escames ròmbiques, esturions i peixos espasa. Holostei.  Teleostei, peixos ossis en sentit estricte, 30.000 esp.  Clupeiformes (Clupeidae: de mar, sardines, anxoves, Salmonidae: salmons (rius), Esocidae: lluci (rius)), Cypriniformis ( Cyprinidae: carpa, Cobitidae: colmilleja, locha, lobo, Siluridae: peix gat), Apodes ( Anguilidae: anguiles; Muraenidae: morenes), Gadiformes ( Gadidae: Bacallà, Merluccidae: lluç) ——– (Cottidae: cavilat (Vall d’Aran), Percidae: Perca, Serranidae: Lubina M, Mullidae: salmonete, Labridae: Maragota, Scombridae: Tonyina, pelàgic bon nedador, Gobidae: xanguet, Sparidae: Dorada, besugo, Soleidae: llenguado, Rodaballo, Lophiidae: rap.
        • Sarcopterygii, Peixos Pulmonats, antecessors dels tetrapoda: protopterus, latimeria, celacanto.

Museu de la pesca, 198 espècies de Mediterrani

Mollusca

44V La vida  |   Arbre de la vida   llista espècies  La vida que trobem al voltant


Mollusca 93.000 espècies. Cambrià 540 Ma. Bivalves 9.000. Cefalòpodes 800 espècies Pops i calamars. Gasteròpodes 70.000 espècies cargols.
(A.135). No tenen el cos segmentat sinó massís amb quatre parts: el cap amb òrgans sensorials i cavitat bucal, el peu, muscle per reptar, nedar, convertit en tentacles en els cefalòpodes, sac visceral (vísceres) i plec del mantell on desemboquen l’intestí, ronyons i o.reproductors. Damunt del sac i el plec es forma la closca en anells successius. Els bivalves i cefalòpodes (petxines i pops) respiren per brànquies mentre que alguns gasteròpodes (caragols) ho fan ja amb pulmons. O. excretors, O.genitals sovint hermafrodites. Sistema nerviós ganglionar amb un cervell primitiu format a partir d’un gangli. No obstant els segments encara tenen certa independència respecte el cervell.

    • Altres: Aplacophora, CaudofoveataMonoplacophora, † Rostroconchia, Scaphopoda (300 esp. closca com una banya, excavadors, cap amb filaments prensors.)
    • Bivalvia petxines, 9.000 espècies (abans anomenats Lamellibranchia), petxines, espècies fins a 1.3 m de diàmetre, excavadors, habitat sedentari. Protobranquia, 4 famílies, núcula. Filibranchia, 5 famílies (Mitilidae, musclos. Ostreidae, ostres). Eumelibranquia, 28 famílies.
    • Cephalopoda pops i calamars. 800 espècies. Formes més evolucionades. Tetrabranquiata, Nautilus, 2 parells de brànquies, molts tentacles, Oceà pacífic. Dibranquiata, 2 brànquies, sistema nerviós molt desenvolupat, ulls amb cristal·lí. Decàpodes, 8 braços i 2 tentacles enrotllables, sèpia, calamar, Architeutis (fins a 25 m.), expulsen tinta quan els ataquen. Octòpodes: cos en forma de sac, closca reduïda, pop, argonauta.
    • Gastropoda cargols, 70.000 espècies (nudibranquis, Haeckel). torsió i assimetria del sac visceral i la closca. Carbonífer, primari. / Prosobranquia, cargols marins dels que inclou la majoria, amb cordons viscerals, sistema nerviós creuat, closca robusta, inclou la majoria dels marins (18 famílies a GC 13, i pp.163). Ofistobrànquia, brànquies rere el cor, aliment de balenes. Pulmonata, la cavitat del mantell s’ha convertit en pulmó, sistema nerviós en anell. Basommatophora, pulmonats aquàtics. Stylommatophora, pulmonats terrestres.  Arionidae, sense closca, babosa. Zonitidae, Helicidae, Enidae, Clausiilidae, Succineidae.Amphineura (sistema nerviós en dos cordons, quitons amb 8 plaques calcàries, s’agafen a terra en zona de marees; cucs marins)
    • Polyplacophora: 1000 espècies primitives closca dividida.

Insectes

44V La vida  |   Arbre de la vida   llista espècies  La vida que trobem al voltant


Hexapoda, insectes 1.000.000. [En la classificació antiga es dividien entre Aptera, sense ales, i Pterigota, voladors. Els aptera, arcais, mai haurient ingut ales.  (Collembola, Thysanura F/204: Peixet de Plata, puça).

Crustacea

44V La vida  |   Arbre de la vida   llista espècies  La vida que trobem al voltant


Crustacea, crancs 40.000 (Copepoda Haeckel) Pentastomida [12], abans classificats a part, paràsits dels rèptils].

    • Entomostraca. Primitius, puces d’aigua, 9 famílies.
    • Malacostraca. Crustacis superiors. Peracarida: Isopoda: truges (cochinilla) que s’enrotllen; Amphipoda, puces de mar, part del plancton. Decapoda. Reptantia: s’arrosseguen el llobregant i el cranc de riu. gamba, llagostí, escamarlà.

Chelicerata

44V La vida  |   Arbre de la vida   llista espècies  La vida que trobem al voltant


Chelicerata, aranyes, 70.000, primers animals terrestres (Haeckel) . Sense mandíbula. Primera parella d’antenes reduïda, segon parell pinces, cheliceros.

    • Merostomata. Limula, forma arcaica ara tropical com una cassola.
    • Aracnida. 36.000 esp., 8 potes. Escorpins: pinces, verinosos, Pedipalpi, Palpigradi, Pseudoescorpins, Aranae: Aranyes; abdomen no segmentat, teixeixen xarxa, 10 famílies a GC15. Opilions: potes allargades, no teixexen, Solifugae, Ricinulei (), Acari: 30.000 esp. paparra, paràsits.
    • Pantopoda. Aranyes de mar

Pensar la vida

La vida

Què és la vida?  |  Complexitat, ordre, individuació  |    Els museus de ciències naturals


Què és la vida?

[Mirant el que tenim al voltant veiem les plantes que creixen, els animals que creixen i es mouen, reaccionant tots es reprodueixen. ] Aristòtil va classificar els éssers segons les seves capacitats, atribuint-los una ànima vegetativa, sensitiva i racional. (Ciències de la vida fins sXVI ). L’observació dels éssers vius planteja si es tracta de matèria amb ànima, o bé de mecanismes complicats (Pensar la vida). No podem concebre gaire bé ni l’origen de la vida ni una explicació de la seva diversitat. (Ciències de la vida segles XVII i XVIII )

Amb el microscopi i s’afirma la cèl·lula com a unitat de la vida (Ciències de la vida. sXIX) , l’evolució com a explicació de la diversitat d’espècies. Al s20 arribem al nivell molecular ( Ciències de la vida. sXX-sXXI) i a formular hipòtesis sobre l’origen de la vida.

[La vida doncs, són unes estructures extraordinàriament complexes, molècules, cèl·lules, teixits, òrgans, organismes, duent a terme processos de:

  • Nutrició (agafar substàncies de l’ambient i transformar-les, obtenint components i energia i retornant els residus)
  • Creixement i proliferació cel·lular
  •  Diferenciació (els gens s’expressen segons diferents estímuls externs)
  • Senyalització (resposta a estímuls químics i físics, comunicació amb altres cèl·lules, per senyals químics com hormones, o neurotransmissors)
  • Evolució. Modificacions del codi genètic

[Com a estructura i fenòmen molt complex, a cada època hem l’hem entès com s’ha pogut, amb les metàfores que teníem disponibles. A l’antiguitat ho veiem com a matèria impulsada per un principi no visible, com un aire o alè, la metàfora del vent invisible movent matèria. Al segle 17 i 18, quan comencem a entendre algunes màquines, considerem la possibilitat que siguin una màquina, tot i que encara no sabem gaire de sistemes tèrmics. Al s19,  que ja es coneix més química, ho veurem com un laboratori químic on es transformen substàncies,  i es converteix energia en treball. Al s20, amb la química molecular i la informàtica, farem servir la metàfora de l’ordinador i el codi que programa.]


Complexitat, ordre, individuació

[Si bé l’estudi de la vida ens ha mostrat que la base de la vida no és diferent del món inorgànic, hi ha els mateixos àtoms, la seva complexitat sí que el diferencia. En lloc de parlar de món inanimat i món animat, podem parlar de sistemes uniformes i sistemes complexos. o ho formulava a Layered Ontology ignorant les observacions similars de Schrödinger a What is Life 50 anys abans. El món inanimat és bàsicament uniforme, ja es tracti de gasos, o de sòlids. El camí per entendre la vida ha estat passar de la idea general de “matèria animada” al coneixement detallat dels òrgans, teixits, cèl·lules i molècules. Segons el que arribem a entendre a cada època, passem pel model de mecanisme, similar a un rellotge, a la fàbrica química, al sistema d’informació codificat al DNA. J

Schrödinger parla de “cristall aperiòdic” i sobretot assenyala que els sistemes vius es caracteritzen per evitar el desordre, és a dir, la uniformitat, l’estat d’equilibri a la qual tendeixen tots els sistemes físics (2a llei de la termodinàmica).

[Hi pot haver un sistema que esquivi l’equilibri i la uniformitat si d’alguna manera està separat de la resta, alhora que s’hi comunica. L’individu biològic, per contraposició a un gas uniforme, és possible gràcies a la membrana, que estableix els límits i intercanvia energia i components amb l’exterior. En els estadis més primitius, la cèl·lula es troba en un entorn favorable, una “sopa orgànica”. En els estadis més evolucionats el sistema viu modifica l’entorn, cosa que també aplica a la vida humana en general (entorn habitable).  existir com a individu suposa aïllar-se, separar-se, i alhora connectar-se i modificar-s mútuament.]

La complexitat de la vida té diferents nivells que són difícils d’entendre. Com es va originar per primer cop el cicle de processos que sintetitzen molècules complexes? Un cop en marxa s’entén el seu avantatge però la  probabilitat que aparegui per atzar, és molt petita ( hipercicle a l’ Origen de la vida ). [una de les proves és la universalitat del codi genètic (la cèl·lula). Les cèl·lules vives tindrien de l’ordre de 109 parelles de bases al DNA i unes 10.000 proteïnes amb uns 2000 aminoàcids, 2 107 en total. (les peces de la vida).
Després, en els organismes multicel·lulars, ¿com es forma una comunitat organitzada de cèl·lules? Com es substitueixen ordenadament les que es degraden? Com es forma un nou ésser amb milers de milions de cèl·lules (de les 105 d’una mosca als 1012 d’animals superiors, Creixement i reproducció).
¿Com s’organitza un hàbitat on coexisteixen diferents espècies que interactuen i es reprodueixen? amb diferents processos? [en el cas de l’home, es podria parlar d’un ordre “narratiu”? un model del món compartit amb altres humans, una narració autobiogràfica?]


Els museus de ciències naturals.

Tots els museus de ciències naturals van començar com una col·lecció d’insectes i vitrines amb animals dissecats.  A mitjans del s19 totes les ciutats importants van fundar-ne. (Ciències de la vida sXIX). Com hauria de ser una museu que no sigui una acumulació de pedres i un seguit de vitrines? Què volem explicar? Un inventari de totes les espècies com Linneu? Preguntes sobre la vida? Com passem del que tenim al voltant a una visió ampliada? Coses a contemplar, la vida en aquest instant, organismes que es renoven, que neixen i que moren, els hàbitats, els avantpassats].

  • El museu blau
    Entrada: esquelet de balena, “Som natura”, mediateca i botiga, el terrat viu, espai nens, exposició temporal.
    Altres museus de ciències naturals a Catalunya per ordre d’antiguetat: Geològic del seminari, Zoo, museu Darder, Marimurtra, Cosmocaixa, Alcover, Montsià, Volcans, Granollers, Arenys de Mar, Conca de Deià, Cercs, Papallones a Sort, Crusafont Sabadell, Ter Manlleu.
    Gran esfera on es projecta la història de l’univers i la història geològica de la terra, mostrant els moviments dels continents. /  Història ràpida de la ciència, de Copèrnic, Lyell, Darwin…
    Biografia de la terra: meteorits. Arqueà 3.8 a 2.5, Proterozoic 2.5 a 542, Paleozoic inferior 542 a 416 Trilobites i peixos, Paleozoic superior 416 a 252, Mesozoic 252 a 65, Cenozoic 66 a 0. Presenten l’arbre de la vida i mostren quines branques han aparegut a cada període. Fòssils. / Evolució [molt breu, sense els arguments de Darwin].
    Animals. La cèl·lula animal [no entren a estudiar teixits i sistemes d’òrgans, ni bioquímica. Classificació, botons, nomenclaura, Linneu encara vigent. El moviment: volar, desplaçar-se, sostenir-se amb un esquelet. Aliment: predadors, hervívors, carnívors, com evitar ser menjat. Diferències entre individus, cicles biològics. conducta. Els grans animals. El gabinet de curiositats.
    Fongs. Plantes. La cèl·lula vegetal. Fulles, flors, herbaris, diversitat de fulles i llavors [no presenten una classificació general]. Algues. Microbis [hauria de sortir Haeckel?]. Biodiversitat a Catalunya.
    Univers. la Terra i la seva estructura. Roques i minerals. Formes i cristal·lografia. cicle geològic, ígnees, metamòrfiques i sedimentàries.  Geologia de Catalunya, Europa i nord-d’Àfrica. Mineria.
  • Cosmocaixa
  • London Natural History Museum
  • American Museum Natural History
  • Naturhistorisches Museum Wien
  • Kelvingrove Art Gallery and Museum. Concentrat però molt ben explicat, vista per hàbitats. Liverpool World Museum. Manchester Museum.
  • Berlin, Museum für Naturkunde .

Regulació, sistema nerviós i conducta

La vida

Regulació hormonal. Els sentits, interacció amb senyals. Sistema nerviós, senyal, sistema, aprenentatge i memòria. Cordats i cervell trinoConducta Cicles vitals, pautes de comportament. Moviment, conductes heretada, adquirida i aprenentatge, social, etiologia.


Regulació hormonal

Els organismes han de mantenir regulada la temperatura, el nivell d’aigua o de sucre, entre altres. La regulació hormonal regula i coordina els diferents processos de l’organisme amb substàncies que activen o inhibeixen la producció d’enzims. [funcionem con un conjunt d’aixetes, cosa que es correspondria una mica amb la teoria dels quatre humors dels antics]. Es tracta de de substàncies que no són generades a la mateixa cèl·lula sinó en altres cèl·lules especialitzades que les segreguen immediatament o les emmagatzemen fins que són requerides i passen a la sang. Poden ser proteïnes (insulina), isoprè, o esteroides [lípids] (gl. suprarenal, h.sexuals) fabricant-se en glàndules, el sistema nerviós central o en cèl·lules  especialitzades de teixits com el budell. Regulen el creixement i funcions fisiològiques incrementant la producció d’enzims (transcripció mRNA) o activant-ne de ja fets.
Al s19 Berthold observa que la castració dels galls en disminueix l’agressivitat (1849). Edward Sharpley-Schafer veu que el nivell de sucre de la sang està regulat per les hormones insulina i glucagón, segregats pel pàncrees. Als insectes les hormones regulen la metamorfosi. A les plantes l’auxina actua sobre el creixement.

  • Hipotàlem-hipòfisi. L’hipotàlem enllaça el sistema nerviós amb el sistema hormonal a través de la hipòfisi. Segrega neurohormones que estimulen o inhibeixen la secreció d’hormones de la hipòfisi (glàndula pituitària). Controla la temperatura corporal, la gana, la set, la fatiga, la son i el ritme circadià.
    (A.329) L’activació de la secreció es deu tant a la concentració de substàncies a la sang, fet que suposa una regulació feedback (excés de sucre → secreció d’insulina que el frena), com a un senyal del sistema nerviós (adrenalina) [resposta del cos a un estímul]. L’hipotàlem està en contacte amb el cervell (endomorfines pel dolor), activa els sistemes simpàtic i parasimpàtic, i segrega liberina i estatina que passen a la hipòfisi. Aquesta segrega unes altres hormones glandotròpes que activen les glàndules perifèriques (tiroides, pàncrees, suprarenal, sexuals). Regula la temperatura.
  • Glàndules sexuals: fabriquen els gàmetes, espermatozous i òvuls, així com hormones reguladores de caràcter i comportament sexual. La testosterona és una hormona que accentua els caràcters masculins i augmenta la massa muscular. Els estrògens són hormones femenines entre les quals hi ha l’estradiol que regula la formació d’òrgans sexuals femenins a l’embrió, i els cicles de fertilitat [ els dos tipus es troben en els dos sexes, amb efectes més o menys intensos].
  • Tiroides. Situada rere la tràquea segrega la tiroxina (iode+tirosina) a instàncies d’estímuls (emocions, fred, calor, llum, son, fam, fosca) que actuen sobre l’hipotàlem que ho passa a la hipòfisi. Té un paper fonamental en la diferenciació cel·lular i el creixement, així com en els reaccions a les emocions. Un excés crema greixos, puja el pols, la humitat i dóna un temperament alegre i excitable. En canvi un defecte disminueix el ritme metabòlic i el creixement i fomenta un caràcter apàtic.
  • Glàndula Suprarenal: Segrega l’adrenalina a instàncies no de la hipòfisi sinó de senyals del simpàtic que reclamen una reacció d’urgència (excitació provocable també per la cafeïna). S’inhibeixen les funcions digestives, augmenta la pressió sanguínia i el sucre [energia a punt]. La crosta suprarenal segrega aldosterona que regula l’equilibri la concentració de les sals actuant sobre la secreció de saliva i orina, corticosterona que regula el metabolisme de proteïnes i hidrats de carboni (ritme dia-nit, activitat, estat anímic).
  • Pàncrees: Regula el nivell de sucre a la sang. Mentre que el glucogen l’augmenta, la insulina el redueix [Els diabètics se l’han d’injectar. El nivell de sucre també és intervingut per la tiroides [estat general], la suprarenal (corticoides i adrenalina (reacció ràpida)).

Els sentits

Procés d’interacció, no metabòlic sinó mecànic o electromagnètic, amb l’entorn mitjançant els òrgans dels sentits, per regular d’altres processos del cos, en els superiors moviment i conducta sovint a través d’un sistema nerviós. [L’entorn supera el nivell de contacte químic. Informació. Les cèl·lules simples viuen depenent d’un medi favorable. Amb uns inputs assegurats, els organismes superiors desenvolupen un metabolisme i una regulació hormonal globals amb divisió del treball. El següent pas és actuar abans de l’alteració de les magnituds internes, és a dir, actuar davant les causes externes que provoquen aquestes alteracions. Això suposa uns òrgans capaços de recollir aquests senyals externs. Un organisme cec “interacciona” mecànicament amb una pedra que li cau i segurament mor, si l’organisme pot reaccionar a ones de llum, pot evitar-la. Amb l’aparició del sistema nerviós neix un nou tipus d’interacció. L’energia d’interacció entre l’objecte extern i l’organisme és rebuda pel sistema nerviós, processada i genera una resposta d’acord amb les pautes de conducta fixades al llarg de l’evolució. Així el comportament global de l’organisme NO ÉS LA SUMA de les interaccions físiques. La mateixa energia lluminosa sobre un organisme amb el SN espatllat només escalfaria el conjunt mentre que la conducta fixada al llarg de l’evolució pot desencadenar un moviment general posant en joc diversos músculs.]

Estímuls de les plantes
Responen a estímuls lluminosos, gravitatoris, de contacte o químics, que exciten membranes cel·lulars. El senyal es transmet (en la mimosa >50cm a 10cm/s) per potencials d’acció o transport químic. La reacció consisteix en moviments intracel·lulars (desplaçament de nucli o orgànuls com els cloroplastos davant la llum), canvi de lloc o tàxia (en protistos, algues, cèl·lules reproductores de falgueres que tenen capacitat de moviment) i moviment d’òrgans (canvis en la direcció de creixement, turgència) o tropismes. El fototropisme es manifesta en l’orientació de les fulles i direcció de creixement de la tija. El creixement de les arrels és geopositiu [cap a la gravetat] i el de la tija geonegatiu. Les nàsties són alteracions de la turgència sota contacte i les trobem a la mimosa, als estams i sobretot a les plantes insectívores que es poden tancar en 0.02 seg.

Sentits dels animals
[Pinillos, evolució dels sentits. Els organismes primitius van anar desenvolupant receptors, estatocists per la gravetat, a la llum (de la simple reacció a claredat foscor, a captar formes en els insectes, cefalòpodes i més tard els colors), l’oïda a partir dels estatocists. L’olfacte i el gust només existeixen en els insectes i vertebrats.]
Excitació de membranes celulars a partir d’un llindar. Quimioceptors, gust (dolç, salat, amarg, àcid), olfacte (1000 olors), vista, oïda). La captació de senyals es fa per òrgans especialitzats [cal aprofitar millor la informació perquè es disposa de mobilitat]. Les cèl·lules sensorials tenen una membrana amb un potencial en repòs de -60 a -120 mV. L’estímul despolaritza el potencial del receptor tot extenent-se fins al soma i l’axón des d’on es transmet sinàpticament a d’altres cèl·lules. Els quimioceptors es troben en els mol·luscs, artròpodes i vertebrats. Un molècula de substància estímul és fixada per una proteïna. El gust té un llindar d’estímul (>1016 mol/ml) més alt que l’olfacte (107 mol/ml en l’home i 102 en alguns animals) i només presenta quatre qualitats (dolç, salat, amarg, àcid) contra més de mil qualitats olfactives difícils de determinar.

  • Vista. Un fotó activa un fotoreceptor (canvi d’energia de rodopsina després de l’absorció), bastó o con, activant el nervi òptic. Es capta forma, color, moviment (combinat amb moviment muscular del cos) i distància (esforç enfocament).El sentit de la visió és la capacitat de reacció a vibracions electromagnètiques mitjantçant uns fotoreceptors sensibles a unes determinades longituds d’ona. La qualitat més simple de captar és la lluminositat (cucs de terra). La direcció demana un conjunt de fotoreceptors disposats en forma de cassola (vesícula òptica) (A.350D)[segons la direcció de la llum s’activen uns o altres], permetent la variació de la direcció captar el moviment. La percepció de la forma es pot aconseguir amb els ulls compostos, presents en insectes, crustacis i alguns mol·luscs, que consten d’un nombre d’ulls simples amb lent cuticular i cristal·lí, i també amb els ulls cambra dels vertebrats. Aquests deriven de la vesícula òptica on la reducció de l’orifici hauria permès un principi d’enfocament. L’ull com a aparell òptic consta d’un diafragma per variar l’obertura, la còrnia (lent convergent) i el cristal·lí com a lent biconvexa que enfoca la imatge a la retina segons la distància on es trobi l’objecte. Quan el globus ocular és massa gran i la imatge es forma abans tenim miopia que es corregeix amb una lent divergent. La hipermetropia és el cas invers. L’apreciació de la distància i relleu s’aconsegueix comparant les imatges dels dos ulls. La retina consta d’una densa capa de fotoreceptors, cons i bastons, (20 106 per mm2) connectada a una segona capa de cèl·lules nervioses bipolars que després passa a una capa de cèl·lules ganglionars i el nervi òptic. Aquesta densitat permet un poder de resolució de 0.4′ al falcó o 2′ en l’home [Amb un camp visual de 54 graus suposa que tenim una pantalla d’uns 2000×2000 punts]. Els bastons receptors tenen rodopsina [proteïna] que es transforma (retinal-cis -> retinal-trans) quan absorbeix un fotó, tot activant ions Ca i canviant el potencial de la membrana de manera que en superar un llindar s’activa el nervi. Després la rodopsina torna a la configuració inicial [deu estar vibrant contínuament entre un estat i l’altre. Els diferents colors són percebuts pels cons que reaccionen de diferent manera segons les longituds d’ona. Amb tres tipus de cons diferents tindríem els tres extrems del triangle dels colors. Sabem que l’objecte està immòbil quan la imatge varia pel desplaçament de l’ull perquè el sistema nerviós combina la informació del moviment muscular amb la visual [quan movem el cap “espera” un desplaçament de la imatge]. El mateix mecanisme [esforç d’enfocament de l’ull] fa que interpretem com a gran un objecte gran que es veu petit perquè està lluny.
  • Oïda. Vibracions de membranes com el timpà, cèl·lules ciliades connectades a neurones. La informació sobre la posició del cos s’obté a través de cilis externs o vesícules que contenen corpuscles mòbils que actuen sobre uns receptors o altres de la vesícula segons la posició. El sentit de l’oïda es basa en la velocitat del so en artròpodes i en variacions de la pressió en els vertebrats. A l’home les vibracions són recollides per l’orella fins a la membrana del timpà (oïda externa) d’on es transmeten les vibracions per una cadena d’ossos (oïda mitjà) fins a l’oïda interna on són recollides per unes cèl·lules ciliades (¸15.000) connectades a neurones. L’oïda humana abasta un ventall de freqüències de 16Hz a 20.000Hz amb un nivell màxim entre 500-3000. D’altres sentits mecànics són els del tacte o pressió. També hi ha percepció de la temperatura, dolor i informació interna com la posició de les articulacions, el seu moviment o l’esforç muscular que s’està fent per vèncer una resistència.
  • [quins altres sentits hi ha? els ratpenats?]

Sistema nerviós

Conjunt de neurones formant una xarxa. Procés de relació entre entrades sensorials i sortides motores per transmissió de senyals d’acord amb els pesos de la xarxa. Coordinació. Variació dels pesos: aprenentatge.
[La cèl·lula regula els processos metabòlics per la concentració de substàncies necessàries i els nutrients de l’entorn. Hi ha un contacte químic. L’organisme ha de coordinar un gran conjunt de cèl·lules i un entorn més complex enriquit per la informació que aporten els sentits.]

Senyal.

Ara el contacte pot ser “a distància” captant variacions en la pressió de l’aire (vibracions de l’objecte origen), part de l’espectre electromagnètic emès pels objectes de l’entorn, o bé partícules químiques característiques despreses per l’objecte i transportades per l’aire. Aquí no es contacta amb una partícula d’aliment a engolir sinó amb un senyal a processar. Això suposa l’existència d’un sistema nerviós que comença a aparèixer, encara que de manera molt simple, després dels celenterats. El SN recull senyals, les passa a la CPU i envia ordres d’activació als òrgans. Només  en tenen els animals perquè només els animals amb moviment tenen capacitat de moure’s, de reaccionar]. Així cada cèl·lula nerviosa és un node que recull informació d’una o vàries cèl·lules nervioses/receptors, el condueix llarga distància i el transmet a una o vàries cèl·lules o efectors [inductor de moviment. Es forma una immensa i complexa xarxa neuronal].

Evolució del psiquisme
El sistema nerviós comença als celenterats com un generador de polsos i després passa a una xarxa central amb separació de procés automàtic i resposta a estímuls externs. El nombre de neurones estimat:

  • Insectes: de 103 a 105
  • Crustacis de 105 a 106
  • Pop 0.5 a 1 109, tenen part de les neurones distribuides als tentacles.
  • Peixos de 103 a 106
  • Amfibis de 105 a 106
  • Rèptils: de 105 a 106
  • Aus: 103 a 106 (cervells relativament grans en proporció al cos)
  • Gossos: 70 a 500 106
  • Ésser humà: 86 109, unes 100 vegades més que un pop

  • Primitius: (celenterats), SN ganglionar en escala al voltant del tub digestiu (cucs, mol.luscs i artròpodes).
  • Cordats: SN central amb cervell:
    • i) C.Anterior (olfacte) → telencèfal i diencèfal (córtex que evoluciona paleocórtex olfactori, arquicórtex de telencefalització sensorial i neocórtex associatiu
    • ii) C. Mig (vista) → Mesencèfal
    • iii) C.Posterior (equilibri) → Cerebel i bulb raquidi

(Pinillos parla de l’origen del psiquisme com de capacitat d’adaptació, més enrere que el tractament d’informació. Tenim tàxies i tropismes a plantes i animals. El parameci presenta un moviment coordinat dels cilis)
Als celenterats apareix un sistema nerviós reticular. Als Plathelmintes o cucs plans comença la diferenciació del sistema nerviós amb l’agrupament de cossos en ganglis disposats al llarg d’una mena d’escala i tres tipus de neurones, eferents cap als músculs, aferents dels receptors i connexions. Això suposa una jerarquització.
En els mol·luscs i artròpodes es forma una mena de cervell a partir d’un gangli. El sistema nerviós està segmentat al llarg del tub digestiu seguint els anells del cos. Tot i que poden presentar conductes tan complexes com la construcció de formiguers o la comunicació en les abelles, les parts del cos (anells) encara tenen independència respecte del cervell. Els mol·luscs ja es poden sotmetre a condicionament simple, clàssic o operant. Un calamar necessita una fibra d’un diàmetre de 650 10-9 m (0.65 mm) per transmetre a una velocitat de 25 m.p.s. [què és aquest m?] mentre que als mamífers disminuirà 2000 vegades.
Amb els cordats i l’esquelet comença el veritable control centralitzat. D’una banda la medul·la quedarà encapsulada a la columna vertebral i de l’altra el cervell es desenvoluparà a partir de tres protuberàncies inicials. El cervell anterior donarà lloc al telencèfal (còrtex) i diencèfal (Hipotàlem i hipòfisi)[Olfacte]. El cervell mig  al mesencèfal o “peduncles cerebrals” [connexió nervi òptic?]. El cervell posterior al cerebel i bulb raquidi  [Equilibri]. El desenvolupament fou desigual ja que mentre els peixos necessiten un bon sentit de la vista i de l’equilibri, no fou fins que començà la vida terrestre (amfibis i rèptils), que l’olfacte [medi gasós amb moltes propietats diferents a ensumar] va ser important i van créixer els hemisferis del telencèfal.
En els mamífers, començà el desenvolupament del còrtex a partir del bulb olfactori (paleocòrtex). Per poder integrar la creixent informació sensorial que desbordava les possibilitats del tàlem va aparèixer l’arquicòrtex amb àrees per la vista, l’equilibri o la motricitat. De la necessitat d’integrar i relacionar les diferents dades sensorials va néixer el neocòrtex o còrtex associatiu, sense connexions sensorials, una àrea lliure destinada a relacionar informació.

Transmissió del senyal nerviós
En repòs les cèl·lules tenen un potencial (entre el plasma i el líquid extracelular) entre -55 i -110 mV. La membrana funciona com un condensador entre dues solucions salines,  de 6 nm de gruix. Aquest condensador es carrega traient fora ions K+ contra el gradient elèctric ( transport actiu). Sota un estímul o excitació, aquesta situació de repòs es torna inestable i es desencadena un potencial d’acció que despolaritza la membrana fins a +30mV tot recuperant després la situació de repòs inicial. Aquesta excitació en un punt de la membrana es transmet al llarg de tota la cèl·lula. [amb la mateixa llei del tot o res] que evita el debilitament del senyal [amplificació]. Després d’una excitació la cèl·lula no es pot tornar a activar fins que recuperi la polarització, durant uns 4 10-3 s [aquesta seria la unitat de temps fisiològica?]. El senyal es va transmetent per les fibres formades per nòduls de Ranvier. Al final de l’àxon hi ha un cap que conté vesícules amb acetilcolina (Ca++) que es desprenen en rebre el senyal i són captades per la membrana de la dentrita de la cèl·lula en contacte (sinapsi química) alliberant-se després i tornant a l’emissora. Aquest mecanisme fa l’efecte d’amplificació del senyal, efecte de vàlvula que només deixa passar senyals en el sentit axon → dentrita, i capacitat de modificació de l’eficàcia de la transmissió ( capacitat d’aprenentatge, memòria) [xarxes neuronals]. El cap de l’àxon pot estar dividit de manera que transmeti l’impuls a diverses cèl·lules nervioses (principi de divergència) [no es debilita]. Així les fibres aferents [sentits], després d’entrar a la mèdula espinal informen diverses cn i queden informats n.motores (reflexos), el cerebel i la crosta cerebral. Aquesta xarxa múltiple té diferents mecanismes d’excitació, suma d’impulsos, realimentació (quan s’excita un múscul s’inhibeixen els antagonistes). El senyal es transmet sempre en la mateixa direcció (de dentrites a axon).

Sistema Nerviós
Les cèl·lules nervioses sempre formen part d’un sistema que, en general, acompleix la funció de coordinar les funcions dels òrgans juntament amb les hormones, i estableixen un vincle entre els sensors i els efectors (músculs).
En els celenterats hi ha unes xarxes simples que distribueixen el senyal en totes les direccions i on s’observa la producció d’impulsos rítmics (moviments natatoris de les meduses, digestió actínia), és a dir, activitat espontània en absència d’estímuls externs.

Sistema nerviós als cordats
Gangli=cossos cel·lulars, nervi=axons, medul·la espinal=(nervis sensibles i motors, sistema vegetatiu autònom =(simpàtic (activació) + parasimpàtic (relax)), xarxa formada per tronc cerebral i encèfal.
En els animals superiors les cèl·lules es disposen agrupant els cossos cel·lulars en ganglis que formaran centres aïllats i els axons conductors en nervis. Se separen les vies aferents [input sensorial] i eferents [output motriu]. Aquesta organització general constitueix un sistema nerviós central. Seguim trobant producció de patrons d’impulsos juntament amb una complexa organització jeràrquica de nivells d’activació amb mecanismes d’autoregulació. Algunes cèl·lules s’alteren segons la freqüència d’activació [entrenament d’una xarxa neuronal]. [Topologia a tenir en compte en la recerca de xarxes neuronals]. Hi ha moltes neurones, 1011  i cada una rep inputs de moltes altres, entre 103 i 105. Això vol dir que és possible connectar dues neurones qualsevol amb només quatre sinapsis (1016 accessibles) amb un promig de 104 connexions) (PDP:4). Als vertebrats el sistema nerviós consta de les parts següents:

  • Encèfal
    • cervell anterior (telèncefal): Ganglis Basals, Escorça cerebral (substància gris amb unes 15 109 cèl·lules, medul·la o substància blanca connexions. [2]
    • cervell Intermig o diencèfal: tàlem  (conex. vies sensibles), Hipotàlem (metabolisme i SN autònom), Hipòfisi i glàndula pineal. [3]
  • Tronc cerebral [4]
    • C.Mig o Mesencèfal [5]
    • Protuberància [6]
    • C.Posterior o cerebel, orientació en l’espai [8]
    • Bulb raquidi, connexió encèfal i medul·la espinal [7]
    • 12 parells de nervis, òrgans sensorials i cap
  • Medul·la espinal (substància gris interna) [9]
    • 31 parells de nervis raquidis: sensible i motor
    • SN nerviós autònom o vegetatiu (ganglis): S.simpàtic (activació), S.Parasimpàtic (relaxament)
  • Sistema nerviós intramural, independent del SNC, cor, intestí, veixiga ¦

[El 1960s Paul D. MacLean va proposar el model del cervell trino, que ara no es considera vigent, però que dóna una visió simplificada:

  • Complex reptilià format pels ganglis basals [i el cerebel] corresponent als instints primaris.
  • Sistema límbic, paleomamífer associat amb els primers mamífers i corresponent a les emocions.
  • Complex neomamífer, el neocòrtex, associat amb el pensament racional.

(WK emocions). Quan van aparèixer els mamífers actius a la nit, l’olfacte va passar a ser més important que la visió. Això els permetia sobreviure mentre els rèptils dormien. Se suposa que això va desenvolupar l’emoció i la memòria i finalment aquestes rutes de l’olfacte van donar lloc al sistema límbic.

Sensibilitat

  • Area Cortical de Motivació Impuls d’actuar [PLA – PROGRAMA]
  • Ganglis Basals/Cerebel
  • Tàlem, motricitat dirigida
  • Escorça motora
  • Tronc cerebra, motricitat de suport
  • Interneurones espinals, EXECUCIO
  • Neurones motores α i γ → músculs

En principi es distingeix entre el SN vegetatiu que controla els òrgans interns i el somàtic [músculs voluntaris]. Hi ha un SN vegetatiu perifèric (A.377) amb ganglis (nou cos cel·lular) entre la medula i els òrgans (ex. intestí) de manera que distingim entre neurones preganglionars (medul·la → gangli) i postganglionars (gangli → òrgan). El sistema simpàtic fa una excitació difusa mentre el parasimpàtic activarà el contrari però de forma localitzada. Així es regulen reflexos viscerals, cutanis i intestinals. Hi ha centres superiors a l’hipotàlem i sistema límbic (influència de les emocions en els processos digestius) que actuen en combinació amb les hormones. [Davant d’un perill] el sistema simpàtic activarà el cor, mobilitzarà glucosa i interromprà l’activitat del sistema digestiu. [Després] El parasimpàtic reduirà el ritme cardíac i tornarà a activar la musculatura intestinal i glàndules digestives.

Les vies sensorials condueixen els senyals sensibles dels òrgans a la medul·la espinal (1a neurona) on una 2 neurona les connecta al tàlem o cerebel. Una 3a neurona passa el senyal a l’escorça. Tant el tàlem com l’escorça té diferenciades les zones corresponents a cada receptor i es parla de camps de projecció sensorials. Uns camps sensorials secundaris estan relacionats amb la interpretació (identificació, aprenentatge, memòria) de la percepció. El tronc cerebral regula motricitat de posició que segueix funcionant inclús amb l’animal sense cervell. La motricitat dirigida (moviment voluntari) parteix d’un estímul a un hemisferi de l’escorça on es poden localitzar zones específiques (gir de cap, cames) que causarà el moviment corresponent a l’altra meitat del cos. La motricitat de posició [moviment general] s’adaptarà a aquesta acció.

Les vies motores surten del cervell amb l’ordre d’activació fins al segment de la medul·la espinal d’on es connecta amb el múscul. Els moviments reflexos no arriben al cervell sinó que s’originen en algunes connexions entre neurones aferents i eferents que tenen lloc a la mateixa medul·la espinal obtenint així respostes ràpides i fixes.

Aprenentatge i memòria. Memòria distribuïda

El SNC fa una funció integradora a més del control separat d’òrgans. A mesura que avança l’evolució l’àrea de l’escorça cerebral inespecífica, és a dir, integradora i no fent una feina concreta, és cada vegada més important. Entre ells hi ha el ritme circadiari son-vigília. Es important la fase del son REM (Rapid Eye Movement) durant el qual es mou l’ull i baixa molt l’activitat muscular [procés de les vivències diàries?]. La consciència només es pot estudiar introspectivament, tot i que per estudis de lesions cerebrals s’ha pogut veure que l’hemisferi esquerre és la base neuronal de la consciència (el que s’observa amb l’hemisferi . esquerre i va al dret, no pot ser anomenat). Sembla que l’hemisferi esquerre està relacionat amb el llenguatge i el dret amb l’orientació espacial. L’aprenentatge i la memòria encara estan poc estudiats. Es distingeix una memòria sensorial que dura <1s. [buffer del perifèric], una memòria primària que guarda uns segs. informació verbal (hi té un paper una proteïna) que per entrenament i repetició passa a la memòria secundària, de gran capacitat i llarga durada (minuts o anys) amb recuperació lenta. Quan l’entrenament ha estat molt intens es passa a una memòria terciària de recuperació ràpida i pràcticament permanent. La memòria que suporta l’aprenentatge d’hàbits i reconeixement de patrons és distribuïda (PDP), no simbòlica.


Conducta

Introducció
[Tenim la “vida” de les cèl·lules, refent les proteïnes que es desfan, duplicant-se per mantenir els teixits. Quina és la “vida” dels organismes?  Què els passa i què fan? Diferents actes com moviment, posició o segregació química, heretats, o adquirits en funció de l’estat interior i l’entorn (coordinació nerviosa) (i a l’entorn hi ha d’altres organismes, en especial) per garantir els processos bàsics de l’organisme (reproducció, creixement, metabolisme).
Etiologia [Del metabolisme i reproducció de la cèl·lula inicial immersa en l’entorn perfecte de la sopa orgànica hem passat a organismes pluricel·lulars que desenvolupen teixits i òrgans amb una divisió del treball, autoregulats per hormones i una integració nerviosa entre els senyals dels sensors i els músculs. Però a més de tenir òrgans especialitzats per moure’s, captar aliment, digerir-lo, protegir-se d’enemics, etc, els animals tenen incorporades unes pautes de comportament que no són simples reaccions per contacte amb el medi o reflexos, són seqüències d’accions encaminades a aconseguir un fi. Part d’aquest comportament s’adquireix per herència genètica (instint) mentre que l’altre és fruit d’un aprenentatge. Aquí començaria el que es podria anomenar herència cultural, que es superposaria a l’herència genètica pura, amb el benentès que la simple herència genètica no garanteix la vida, cal un medi favorable. Però un entorn “educador” és més que un entorn favorable metabòlicament.]

Cicles vitals
Visió global de la conducta animal. De major a menor, els processos d’un animal serien els següents, cada un d’ells contenint l’inferior:

  • Procés lineal de naixement, creixement, maduresa i mort (i reproducció).
  • Processos estacionals (període anual) com hivernació, migració, aparellament.
  • Processos diaris: repòs, obtenció d’aliment. Hi ha un ritme cíclic de son i vigília [no igual per a tots. No tots els animals dormen de nit, d’altres tenen cicles estacionals com els ossos que hivernen. Però sembla clar que, els organismes superiors “descansen”. Les amebes van funcionant la sopa orgànica de manera contínua. Dormen les formigues? Comença el ritme cíclic quan són necessaris els sentits per dur a terme una activitat coordinada amb els senyals que es reben del medi?]

Pautes de comportament
Cada acció estacional o diària (aparellament, metabolisme) es duu a terme segons una pauta de comportament (seqüències d’accions) que se superposa a la “fisiologia vegetativa”. La pauta de conducta té en compte l’hàbitat (geografia d’aliment, refugi, perill, identificació de coses), els altres membres del grup (competència, protecció mútua) i pot ser:
i) resultat d’un contacte químic (sopa orgànica).
ii) resposta heretada o apresa sota un senyal nerviós extern (el món codificat en informació, senyals de primer ordre) o intern (motius de gana, set, agressivitat, sexe).

  • tàxies i motricitat de coordinació (caminar, vol).
  •  conductes instintives per a l’estratègia de caça, aparellament, migració.
  • conducta (heretada) modificada per un aprenentatge d’habituació, sensibilització o condicionament clàssic i operant. [Podríem dir que cada estímul busca en el repertori d’instints la resposta que toca]. (Senyal, un nou tipus d’interacció objecte/energia-informació/organisme, que difereix de la suma d’interaccions sobre els àtoms en tenir un sistema (SNerviós) que tracta aquesta energia com a informació per desencadenar una conducta).

[Cada senyal i resposta de l’etiologia es podrà reduir a la fisiologia dels sentits i motricitat corresponent. En termes antropològics diríem que hi ha una infraestructura pel que fa a la nutrició i reproducció (estratègies de caça i aparellament), una certa estructura en l’organització del grup o ramat (líder, paper del mascle i les femelles) i una superestructura cultural pràcticament nul.la. En nivells decreixents tenim:

  • Fisiologia dels òrgans, processos de Reproducció, Creixement, Metabolisme, regulació hormonal, sistema nerviós, Moviment.
  • Bioquímica de la cèl·lula,  Metabolisme, Catabolisme, Anabolisme amb biosíntesi, moviment i transport, duplicació DNA i còpies RNA.
  • Físico-química

[Quina seria la simulacio de la vida d’un animal?

  • i) Organisme i entorn en paràmetres i equacions d’evolució.
    Per exemple a l’entorn cicles dia-nit, estacions i temperatura, senyals lluminosos i olfactius d’objectes, contacte amb objectes. A l’organisme concentració de sucre, sals, receptors mecànics, dolor [ex. cama: repòs, activació, dolor], cicles metabòlics amb temps de consum.
  • ii) Repertori de programes input-procés-output (inicialment innats). Exemple: dolor -> reflex evitació, senyal de menjar -> secreció salival-aproximació per caça, senyal hormonal de fertilitat -> conducta d’aparellament.
  • iii) Evolució en el temps. Al llarg de la vida es van rebent inputs 1), es reacciona amb la conducta 2). La resposta modifica el medi, l’organisme evoluciona sol i en dependència de la resposta i l’exercici de ii fa que es modifiquin els programes d’actuació o bé que n’apareguin de nous (conducta apresa).

[En l’home H0000 també hi haurà:

  • Un cicle vital amb etapes i ritmes estacionals i diaris (l’etapa infantil és molt més llarga, els ritmes estacionals ja són més convenis culturals -vacances- que naturals).
  • Pautes de comportament on i) Es processen senyals de segon ordre, ii) hi ha una motivació cultural -expectatives-, iii) Les accions sobre el medi es fan en l’estructura de divisió del treball de la societat. iii) hi ha herència i comunicació cultural. iv) Hi ha propositivitat.
    En definitiva, un estímul no busca l’instint adequat en el limitat repertori de l’espècie sinó que s’inscriu en el model del món del subjecte, en les expectatives creades per la seva història personal en un cert entorn sociocultural. la conducta dependrà menys dels estímuls i més de la història personal.
    Les expectatives si projectes a llarg termini es descomposen en petites unitats [sèries encaixades] on entorn + situació interna configuren una acció a resoldre per càlcul, fugida, etc.
    Cada reacció té el seu corresponent a nivell de xarxa neuronal alhora que es pot veure com dues xarxes nervioses (SNC, SNA) intentant controlar el sistema de musculatura esquelètic i visceral. Després, com en els animals, hi haurà la fisiologia (BM200) i la bioquímica (B1200).

Moviment
Procés de d’òrgans (músculs) amb canvi de posició o desplaçament de l’organisme en l’entorn. Creixement plantes, moviments autònoms (orientació fulles, budell, cor), moviments reflexos, locomoció per retropropulsió, rem de cilis, vol, salt, marxa.
(A.389) (A les plantes es basa en creixement de teixits i òsmosi) (Animals → moviment de cada cèl·lula, filaments, cilis, desplaçament d’actina i miosina per activació de Ca+ consumint ATP) Es distingeix entre músculs ràpids i lents. Activacions poden provocar un tètanos on la força muscular és quatre vegades la normal. Hi ha moviments autònoms que es basen en condicions internes. A les plantes hi ha l’orientació de les fulles o l’enganxament de les heures. En els animals hi ha la motricitat del budell prim i l’activitat cardíaca basada en el ritme sinusal. Els moviments reflexos són regulacions estímuls resposta.
Formes de Locomoció. A l’aigua es desplacen per retropropulsió meduses i cefalòpodes, per rem d’extremitats crustacis, insectes, granota, castor o pingüí, per moviment ondulatori de tot el cos (anguila) o les aletes (peixos). El vol s’ha desenvolupat igual en insectes, rèptils, aus i ratpenats. A part del planejament, el batre les ales, que demana una forta musculatura i un perfil adequat, el moviment cap avall impulsa el cos amunt i endavant, tot replegant-se l’ala per recuperar la posició inicial. El colibrí oscil.la les ales com un helicòpter. Per terra el desplaçament pot ser per reptació peristàltica en els cucs (es recolza on el cos es fa gruixut), reptació basal als caragols i r.serps. Els vertebrats caminen recolzant alternativament les diferents extremitats. Les llagostes salten amb les potes de darrera.

Conducta heretada
Instint: Moviments i accions ordenats per aconseguir un fi desencadenats per estímuls interns (gana, hormones, estat de creixement) o externs (motivació). Jerarquitzats en graus creixents de complexitat. Fixat al codi genètic. Són respostes fixes a estímuls fixes. Coordinació hereditària, tàxia (orientació sota estímul extern). B2920.1.OS Equilibri, prensió d’objectes, caça, aparellament, migració.
(A.403) L’instint seria “un mecanisme nerviós jeràrquicament organitzat que reacciona davant d’uns impulsos desencadenants, tant interns com externs, responent amb uns moviments ben coordinats destinats a la conservació de la vida i de l’espècie”. La coordinació hereditària (moviment instintiu) és una seqüència complexa de moviments pròpia de l’espècie amb un marge de variació més petit fins i tot que els caràcters morfològics (ex. moviment de festeig dels ànecs, agafar un objecte, caçar una mosca amb la llengua una granota). La tàxia és un moviment d’orientació desencadenat per un estímul extern (ex. orientació de la granota abans de caçar la mosca per una granota).
La motivació (A.404), el desencadenament de l’acció es pot deure a factors interns:

  • Estímuls sensorials interns: la gana es basa en l’excitació d’unes cèl. que reaccionen davant d’una determinada concentració de glucosa o sal a la sang. El llindar de l’estímul pot variar segons si la necessitat ha estat molt satisfeta (puja) o fa temps que està pendent (baixa).
  • Les hormones.
  • Els ritmes endògens, circadians (ritme dia-nit, freqüència de cant dels ocells) o circanuals (reproducció, migracions, acumulació de reserves).
  • Estat de maduresa. L’animal reacciona de diferent manera segons l’edat.
  • Història prèvia a l’acció: Experiències anteriors amb èxit reforcen la resposta i viceversa [on s’acumula aquest aprenentatge?]
    Els factors externs poden ser:
  • Estímuls. Primer es detecten patrons d’estímuls que són aplegats en un acumulador. Després són comparats i avaluats d’acord amb les necessitats internes.
  • Influències ecològiques
  • Influències cícliques

(A.410) Les cadenes d’accions instintives tenen una jerarquia que va des d’instints d’ordre superior (apetència de migració primaveral) [caça, reproducció], desencadenats internament per una hormona que se subdivideixen en varis d’ordre inferior (Recerca del territori, lluita amb rivals) [moviment d’aproximació, ritual de festeig] condicionats per factors interns i externs com poden ser les condicions de l’entorn i que després, es descomponen en coordinacions hereditàries (cop de bec, mossegar, córrer)[moviment coordinats d’extremitats en arrossegar-se o sacsejar el cap] i finalment en moviment muscular (on encara podríem distingir un centre per l’extremitat sencera, una altre pels diferents radis d’uan aleta, els feixos de fibres musculars d’un radi i finalment la neurona motora d’un únic feix de fibra muscular).
La base genètica de pautes de comportament així com la seva localització cerebral s’ha pogut comprovar en animals sense aprenentatge que presenten un comportament determinat (amenaça, atac, fugida) per estimulació cerebral directa a diferents punts de la crosta. Es pot veure que els diferents estímuls que poden desencadenar unes accions són agrupats i avaluats.
El comportament heretat es basa en informacions acumulades al llarg de la filogènia i fixades al material hereditari [un gen que genera una proteïna per sintetitzar una hormona d’acord amb el ritme de les estacions?] A més de la paleontologia morfològica hi hauria una paleontologia etiològica  A.425. Hi ha proves que la fixació genètica de pautes de comportament constitueix un avantatge. Així s’observen pautes similars en espècies diferents emparentades filogenèticament], constituint una memòria de l’espècie. Té l’avantatge d’una resposta ràpida amb la contrapartida la rigidesa; funcionarà bé en condicions de vida estacionàries.
Migracions. al s19, Audubon a Amèrica, Hans Christian Mortensen i  Hans Christian Cornelius Mortensen que marquen els ocells amb anells, aporten coneiement sobre els patrons de migració. Nikolai Przhevalsky i Vladimir Kovshov ho fan pels mamífers a l’Àsia.  Es troba que hi ha un coneixement innat de les rutes que pot ser modificat amb l’aprenentatge. Why animals Don’t Get Lost. Kathryn Schulz (New Yorker 201/04/05)

Conducta adquirida i aprenentatge
Moviments i accions fixats [en pesos de la xarxa neuronal] per habituació, sensibilització, condicionament clàssic (associació estímul neutre a un real), condicionament operant (reforç o atenuació). Adapta respostes a entorns (estímuls) més concrets i variables que els instints fixes. Es una memòria no simbòlica, distribuïda. La conducta heretada està fixada genèticament i permet una resposta ràpida. En l’aprenentatge tenim una experiència individual gravada al SNC, una memòria individual [alteració de les connexions neuronals? on es grava la informació?].
Diferents tipus d’aprenentatge poden ser l’habituació (quan es repeteix un estímul sense conseqüències) o sensibilització segons si baixa o puja la reacció a un estímul:
El condicionament clàssic crea una resposta a un estímul inicialment neutre per associació (Pavlov, gos, os i campaneta, 1891). s19 Douglas Spalding (1841-1877) estudia la conducta  dels animals, innata i adquirida i assenyala l’efecte Baldwin, quan la conducta adquirida és un avantatge per a la supervivència en l’evolució.
El condicionament operant reforça una tendència ja existent. Skinner, observa que un animal que havia accionat una palanca de menjar, era capaç de repetir-ho. Throndike creia que així es podrien explicar la majoria de conductes d’animals que semblen intel·ligents, simplement la repetició del que s’ha trobat per atzar. (Skinner). L’aprenentatge pot ser per assaig i error (premi i càstig), per entrenament motor (repetició d’un moviment fins que es domina ex. ballar o conduir).
Però Wolfang Köhler, estudiant ximpanzès en captivitat notarà que són capaços de solucionar problemes, és a dir que tenen un propòsit [una pregunta, depassa l’assaig i error]. Fan servr un pal o apilen capses per abastar un objecte inaccessible. A partir de 1970, l’etologia considerarà també la genètica i l’ecologia. Hi ha aprenentatge per observació o imitació (simis), per intel·ligència. En els vertebrats és una tendència heretada la curiositat d’explorar nous materials i comportaments, tendència que va desapareixent amb l’edat. El joc és un altre aspecte de la curiositat i l’aprenentatge per assaig i error present en alguns mamífers. L’empremta és una conducta que només es pot adquirir en una fase sensible, sovint curta, i que després queda fixada irreversiblement. (Konrad Lorenz estudia aprenentatge adquirit en ocells i assenyala l’existència de la empremta, l’adquisició d’una conducta que té lloc a una edat determinada. Tinbergen, el ritual de festeig del peix espinós. )
Alguns vertebrats presenten capacitats d’aprenentatge superior similars a les de l’home: memòria (elefant, cavall), concepte d’igual i diferent, número en aus i mamífers i algunes nocions verbals en primats. A vegades hi ha pautes de comportament desencadenades per estímuls ja difícils d’identificar. Domesticació.

[Emocions. Indicis d’emocions en insectes, BBC, ex les mosques busquen aliment més intensament si pateixen gana. Hi ha indicis que poden patir dolor.]

Conducta social
Conducta pròpia de relacions entre organismes. Divisió del treball, competència, agressivitat, territori, comunicació.
Alguns espècies constitueixen societats, que poden ser anònimes quan no hi ha papers individuals (a vegades agrupacions obertes com ramats o bancs de peixos, o tancades i identificables per l’olor com clans de rosegadors, estats d’insectes, o individualitzades amb jerarquies. Presenten avantatges d’organització i divisió del treball com poden ser la defensa dels enemics, caça en comú, cura comunitària de les cries, construcció de refugis.
L’agressivitat intraespecífica es basa en la rivalitat per triar parella, i serveix per garantir la salut de l’espècie en la reproducció. Hi ha un comportament d’amenaça (l’antílop mostra les banyes) que anticipa la lluita i un d’exhibició (l’antílop mostra els flancs, la mida). Alguns combats estan ritualitzats en pautes fixades.
Els territoris es denfensen contra competidors de la mateixa espècie i poden ser per reproducció i/o alimentació. El territori es pot delimitar per l’olfacte amb excrements i orina, òpticament (maques als arbres dels ossos), o acústicament (aus).
Llenguatge. Algunes espècies (en societat) presenten alguna mena de comunicació. La reina dels ruscs d’abelles regula la comunitat amb segregacions químiques. Les danses de les abelles poden informar sobre fonts d’aliment i la seva distància al rusc. Els primats tenen 25 sons que combinen per comunicar dades. [Quin és l’origen del llenguatge i la representació? La dansa de les abelles, resumeix els moviments que caldria fer per arribar a un aliment situat a 5m direcció nord? Els sons són els que s’emetrien en contacte amb l’objecte real (bang)? En tot cas es pot repetir aquí el mateix que amb el codi genètic: potser no és l’única possibilitat, però un cop establerta, té un immens avantatge selectiu.] Sobre el llenguatge dels animals (New Yorker  2022/06/13)

Etiologia Humana

Conducta heretada fixada genèticament al llarg del paleolític afectant ingestió d’aliments, sexualitat i agressió. Modificada per conducta adquirida i per herència cultural que tindrà un paper fonamental.
(A.435) S’accepta que en l’home predomina l’adquisició cultural a l’instint: “l’home és fins a tal punt un ser cultural que no té sentit parlar d’una naturalesa de l’home, doncs aquesta varia segons les diferents condicions socials” (Kentler 1971). No obstant sí que hi ha un comportament heretat. Aquest pot ser reprimit o alterat culturalment (agressió). Es interessant demanar-se què roman de l’hereditari, si és un avantatge o un inconvenient i com pot ser alterat culturalment.
Hauser ha mostrat que hi ha gestos independents de la cultura (el somriure i aixecar les celles per saludar, amagar la cara per timidesa, somriure i mirada de flirteig, cop de puny a la taula, el petó derivat de l’alimentació boca a boca és independent de la cultura, i que cecs i sords de naixement presenten gestos expressius típics. Els nou nats tenen una motricitat heretada de succió, de prensió, de caminar, reptar, anar penjat o nedar. Algunes d’aquestes capacitats desapareixen al cap de poques setmanes perquè no es desenvolupen.
Sembla que alguns tipus de comportament es poden identificar com derivats de mecanismes hereditaris: esquema infantil (ser graciós, generar protecció), esquema femení (forma de guitarra, accentuat pel vestit), esquema masculí (amples espatlles i musculatura) [?].
La motivació seria hereditària (modificable culturalment) pel que fa a la ingestió d’aliments, la sexualitat i l’agressió. Com que la societat humana ha evolucionat molt ràpidament des de la superació de la societat de caçadors i recol·lectors (amb la revolució agrícola del neolític), cal suposar que els mecanismes de conducta fixats genèticament no han canviat des d’aleshores. Això voldria dir que sota la capa cultural tenim els instints del caçador del paleolític. Des d’aleshores el paper de l’herència cultural i la influència de la societat sobre l’individu és molt important. Quan la resta d’instint (ex. homosexualitat) s’oposa a l’establert socialment hi ha conflicte. L’agressivitat i la guerra és el natural, encara no hem après a viure en pau ara que tenim armes globals (futbol com a substitutiu?). Hi ha la tendència a formar grups, clans amb signes distintius tot marginant els estranys (els nens es burlen dels que tenen defectes físics). Hi ha llaços afectius que compensen l’agressivitat, especialment la relació mare-fill o sexualitat perdurable amb la parella. Hi ha tendència a la submissió (el líder d’un experiment induí a fer electroxocs que simulaven gran dolor). La conducta humana se suposa determinada per (models cibernètics A.440): Disposicions heretades o “valors teòrics vitals”, – Normes socials o v.t. socials., Decisions personals o v.t. racionals.


 

La cèl·lula

La vida [estructures i processos complexes]


Introducció

[La cèl·lula en la seva versió més simple és com una bossa de plàstic, com a membrana, surant dins de l’aigua. A través de la membrana intercanvia nutrients [quins, oxígen, co2]. A dins hi té els “plànols” de DNA per generar noves proteïnes, proteïnes i enzims per fer el catabolisme i anabolisme, i eventualment, duplicar-se.
Els organismes pluricel·lulars som una “societat” de cèl·lules, pròpies i convidades que  generem un entorn “aquàtic” adequat per a les nostres cèl·lules, com un aquari. Un aquari líquid en els organismes aquàtics, i un aquari sòlid pels terrestres.]

Il·lustracions de Goodsell.

Teoria cel·lular:”la cèl·lula és una unitat morfològica de tot ésser viu; és a dir, que en els éssers vius tot està format per cèl·lules o pels seus productes de secreció.” No hi ha generació espontània,  Omnis cellula ex cellula (Rudolf Virchow). Les funcions vitals dels organismes tenen lloc o bé dins de les cèl·lules, o en el seu entorn immediat. Cada cèl·lula és un sistema obert que intercanvia matèria i energia amb el seu ambient augmentant l’entropia de fora. Cada cèl·lula conté tota la informació hereditària necessària per al control del seu propi cicle i el desenvolupament i funcionament d’un organisme de la seva espècie, així com per la transmissió d’aquesta informació a la següent generació cel·lular.” (Ciències de la vida sXIX)


Parts i funcions

Característiques funcionals: Nutrició (agafar substàncies de l’ambient i transformar-les, obtenint components i energia i retornant els residus), Creixement i proliferació cel·lular,  Diferenciació (els gens s’expressen segons diferents estímuls externs), Senyalització (resposta a estímuls químics i físics, comunicació amb altres cèl·lules, per senyals químics com hormones, o neurotransmissors). Evolució.

Mida [Tal com indica l’article New Yorker 7/3/2022 encara no podem observar què passa dins d’una cèl·lula, a un escala entre els àtoms de 1 å, 10-10m, i els bacteris de 2 μm, 10-6m de longitud. El mycoplasma genitalium és de 0.2 μm i el límit teòric seria de 0.17 μm. En l’organisme humà, els hematies fan 7 μm, els espermatozous 53 μm, els òvuls de 150 μm.

Membrana: Individus gràcies a una membrana que les separa i comunica amb l’exterior, que controla els moviments cel·lulars i que manté el potencial elèctric de la cèl·lula.
Dues capes de lípid (45%) que envolten unes proteïnes flotants (55%). Formen una barrera (¸10-8m) selectiva que deixa passar l’aigua i algunes substàncies (reconeixement per enzims) arribant a tenir un paper actiu en el transport [aliments i deixalles). La paret cel.lular, no sempre present, està formada per polisacàrids amb un gruix d’uns 20 nm i evita que la cèl·lula exploti quan no està limitada per altres. Deixa passar molècules petites. A la membrana hi ha també els enzims que converteixen els aliments en ATP, tasca que a les cèl·lules eucariotes acompliran els mitocondris.
Dutrochet (1827) descobreix el paper de l’òsmosi a la membrana i més tard Van’t Hoff i Arrhenius n’enuncien les lleis (1884). 1935 Danielli i Dawson indiquen que la membrana cel·lular oleica està recoberta de proteïnes. El 1972 Singer i Nicolson ho refinaran dient que estan intercalades.

Citoplasma: el que hi ha a l’interior de la membrana, diversos orgànuls en una una dissolució d’aigua, sals inorgàniques, proteïnes del metabolisme i intermediaris del procés metabòlic, el citosol. Pot tenir un citoesquelet amb microtúbuls i microfilaments que li aporta certa consistència i ordena l’espai.

Material genètic. Cromosomes [no em queda clar si sempre està organitzat en cromosomes o bé només ho fan en el moment de la divisió] , una doble hèlix de DNA de 2 nm de diàmetre i 1 mm de llarg enrotllat molt compacte.[108 elements!]. Servirà per transcriure proteïnes  i autoreplicar-se. les ARN polimerases transcriuen ARN missatger contínuament, que, exportat al citosol, és traduït a proteïna segons les necessitats fisiològiques. A més, depenent del moment del cicle cel·lular, aquest ADN pot entrar en replicació com a pas previ a la mitosi. [Àcids nucleics]
A les cèl·lules eucariotes està separat de la resta del citoplasma per una membrana formant un nucli.

Ribosomes: boles de 18 nm en un nombre de 15000 a l’E.Coli (l’organisme més ben conegut) on els RNA copiat del DNA codifiquen la síntesi de proteïnes. [es copia una part dels plànols del DNA, al mRNA i es du al “taller” on es construirà la proteïna]. Poden estar agrupats al reticle endoplasmàtic. Els processos de les proteïnes són facilitats per l’estructura de l’aparell de Golgi.

El m-RNA, RNA missatger, copia el “negatiu” a partir del DNA. Es troba amb un t-RNA  que ha acoblat l’aminoàcid corresponent. [Si ho entenc bé, el m-RNA tindria la longitud d’un gen, i el t-RNA només un codó per un aminoàcid]

Grànuls de reserva: polímers de sucres, reserves d’energia per a l’organisme.

Mitocondris: orgànuls encarregats de l’obtenció d’energia a través de la respiració cel·lular. Intervenen en el cicle de Krebs, la fosforilació oxidativa i la cadena de transport d’electrons de la respiració. S’haurien assimilat de bacteris per endosimbiosi i tenen material genètic independent.

Als eucariotes vegetals hi trobem:

  • Cloroplasts: Orgànuls de color verd que duen a terme la fotosíntesi [només són a les fulles? no a les arrels?]. Segons la hipòtesi de la simbiosi s’haurien integrat a partir de cianobacteris i tenen material genètic independent.
  • Vacuoles: acumulen reserves, faciliten l’intercanvi amb l’exterior i mantenen la turgència de la cèl·lula.

Als eucariotes animals hi trobem liposomes, enzims hidrolítics que serveixen per degradar molècules.


Les peces de la vida

[Si volem fer una estimació grollera de quantes i quines peces formen la vida tenim, els 4 nucleòtids del DNA, les bases adenina (A), timina (T), citosina (C) i guanina (G), cadascuna formada per uns 10 àtoms, i els 20 aminoàcids que formen les proteïnes.]  Bioquímica.

Al bacteri E. coli hi ha uns 4300 gens que codifiquen proteïnes. Les proteïnes tenen uns 300 aminoàcids de mitjana. Així tindríem 1.29 106 aminoàcids. Amb uns 12 àtoms per aminoàcids tenim 2.3 107 àtoms de proteïnes. [no sabem quantes còpies de cada proteïna, però]. En els humans hi hauria de 20.000 a 25.000 proteïnes, entre 300 i 10000 aminoàcids. Així que en una cèl·lula hi hauria 22.000×2.000 uns 4.4 107 aminoàcids, amb uns 5 108 àtoms de proteïnes.

A l’E. coli hi ha 4.6M de parelles de nucleòtids que donarien uns 9.2 107 àtoms. En una cèl·lula humana hi ha uns 3.000 M de parelles de bases, que serien uns 6 1010 àtoms.

Les cèl·lules vives tindrien de l’ordre de 109 parelles de bases al DNA i unes 10.000 proteïnes amb uns 2000 aminoàcids, 2 107 en total.


Procariotes: (bacteris i arquebacteris) les cèl·lules no tenen estructura interior ni nucli definit, tots els orgànuls estan dispersos al citosol.

Eucariotes animals
Diàmetre 20µm (0.002 mm) En un cm3 n’hi ha 106 deixant espai intercelular i tot. (Lehninger p.35, Atlas pp.23-51).
La membrana té més proporció de lípids que els procariotes.
El nucli fa uns 5 nm diàmetre. La doble hèlix del DNA s’enrotlla sobre proteïnes histones formant un filament de cromatina. Aquests s’agrupen en cromosomes, bastonets d’uns 0,0002 mm que es dividiran en la divisió nuclear. El número de cromosomes és fix per cada espècie, són dobles en les cèl·lules somàtiques (diploides) i simples en les c.sexuals (haploides). Els nucleols són concentracions de RNA. [el material genètic adopta la forma de cromosoma en la fase de mitosi del cicle de vida).
Els mitocondris produeixen energia oxidant glúcids. Origen per endosimbiosi. N’hi ha uns 500, 20% citoplasma, elipsoides de 1µm d. plens d’enzims on els glúcids, lípids i aminoàcids més O2 s’oxiden a CO2 i H2O alliberant energia que serveix per formar ATP.
Complex de Golgi, un reticle de cossos buits que aïlla certes substàncies del citoplasma tot expulsant-les a l’exterior. Serà important en les cèl·lules especialitzades en secreció. Peroxisomes: Vesícules amb enzims d’oxidació. Lisosomes: vesícules amb enzims (fosfatasa àcida) que digereixen substàncies absorbides o les deixalles.
Reticle endoplasmàtic, xarxa de conductes de superfície rugosa on hi ha els ribosomes que duen a terme la síntesi proteica.

Eucariotes vegetals
Com la procariota, membrana, citoplasma, nucli (separat), mitocondries, reticle endoplasmàtic, i pròpiament vegetal, cloroplastos i vacuoles. (Lehninger p.37). Cloroplast, receptors d’energia lluminosa que converteixen en ATP alliberant oxígen i consumint CO2 i H2O. Vacuoles, orgànuls que van absorbint restes dels processos, expulsant deixalles i augmentant de volum al llarg de la vida de la c. Contenen sucres dissolts, sals, proteïnes.


Cicle de vida

Interfase [cèl·lula nova després d’una mitosi]

  • G1: Creixement cel·lular amb síntesi de proteïnes i d’ARN. transcripció i reactivació del mRNA, concentració de nucleòtids.
  • S: s duplica l’hèlix de DNA, es produeixen histones. cada cromosoma es duplica i queda format per dues cromàtides idèntiques.
  • G2: Continua la síntesi de proteïnes i ARN. Es fon el reticle endoplasmàtic, la cèl. perd contecte amb les veïnes i s’arrodoneix. S’acaba quan els cromosomes comencen a condensar-se al principi de la mitosi.

Mitosi (Atlas p.39)

  • Profase: la cromatina [el material genètic] es concentra en cromosomes. Prometafase: es desfà la membrana del nucli i entren microtúbuls que desplacen els centrosomes.
  • Metafase: S’acaben d’espiralitzar les cromàtides, els cromosomes s’alineen entre els dos centrosomes.
  • Anafase: els cromosomes de separen i es desplacen, , se separen les cromàtides germanes dirigint-se als pols.
  • Telofase i citokinesi: Els cromosomes tornen a disposar-se normalment i es dissolen en cromatina. A partir del reticle endoplasmàtic es torna a formar l’envoltura nuclear entorn de cada centròmer. A l’equador es genera una biomembrana que separarà les dues noves cèl·lules.

[Quin és el rellotge que indica el ritme de reproducció i mort?]

(En el procés de meiosi de la reproducció a la metafase es fusionen les cromàtides del pare i la mare (2N →N), a l’anafase se separen (N→2N) i a la telofase es divideixen (2N). Després a la meiosi II es tornen a dividir i tindrem 4 gàmetes haploides.)

[Procés general de reproducció, creixement i mort, setmanes, mesos, anys? El cos en constant reconstrucció] [ Procés cíclic d’assimilació de nutrients  i biosíntesi, hores]

[Manca una explicació de la degradació de la cèl·lula, la mort]

Gemma Anderson


Metabolisme

[igual que explotem la terra per obtenir energia i materials, l’organisme fa com una “mineria” del medi, ingerint nutrients i respirant oxígen. Amb el que “excavem” (1) carreguem les nostres bateries de ATP, (2) preparem materials i reconstruïm tot el que es va desfent (3) i tenim un circuit d’eliminació de deixalles]
Catabolisme: Reaccions químiques per obtenir components i energia. La ruta catabòlica degrada les grans molècules ingerides (proteïnes, polisacàrids i lípids) a components (aminoàcids, pentoses i àcids grassos), a acetil-CoA i finalment a NH3, H2O i CO2.
Anabolisme: biosíntesi, transport i contracció muscular. La ruta anabòlica parteix d’aquí per sintetitzar també en tres fases, els components superiors. La ruta catabòlica descendent i exergònica convergent a elements simples no passa pels mateixos passos intermitjos que l’anabòlica que puja i es divergeix en components superiors especialitzats. Això es deu a causes energètiques. Són regulades per diferents enzims (Lehninger p.381).

Cicle del carboni: Autòtrofs (llum) i heteròtrofs (química) es complementen mútuament formant un cicle on el CO2 es torna glucosa amb energia lumínica (plantes) que després és cremada en CO2 altra vegada amb la respiració animal [i vegetal] dissipant calor.
Cicle del Nitrogen: El gas nitrogen N2 és molt inert i només pot ser fixat per bacteris que el deixen com a amoníac o Nitrat → (Plantes superiors) → aminoàcids → (animals superiors) → amoníac/urea → (bacteris nitrificants, nitrosomes) → Nitrit (B.Nitrificants, nitrobacter) → Nitrat. [els grans cicles]


Catabolisme

Hidrats de carboni: Obtenció d’energia a partir de la glucosa [que es genera a les plantes per fotosíntesi] per glucòlisi i respiració cel·lular (i fermentació en alguns bacteris).
Greixos: trencament dels triglicèrids en àcids grassos i glicerol, mitjançant la incorporació de tres molècules d’aigua i l’ajuda d’enzims anomenades lipases. Els àcids grassos, guardats en forma de triglicèrids, són una reserva d’energia més concentrada que els sucres (9 kcal/g contra 4 kcal) i es fan servir pels animals superiors en cassos de dejuni o hibernació. Són esterificats fins a formar un acetil-CoA i després carreguen ATP a les mitocondries. Un exemple és: àcid palmític + 23O2 + 129Pi + 129 ADP = 16CO2 + 145 H2O + 129 ATP
procés on es recupera en ATP un 40% de l’energia de l’àcid.
Proteïnes: Escissió de les cadenes polipeptídiques en els seus aminoàcids mitjançant enzims anomenats proteases. Els aminoàcids constitueixen una altra font d’energia en els vertebrats. Les proteïnes són descomposades en el tub digestiu (tripsina) i passen a la sang per on seran conduïdes al fetge on tindrà lloc el seu catabolisme. Una degradació oxidativa els deixa en Acetil-CoA amb amoníac com a subproducte (asparagina+H2O -> Aspartato+ NH3). L’amoníac s’excreta com a urea, format-se així un cicle del nitrogen (cicle de la urea, Krebs 1930). La síntesi de la urea consumeix quatre grups fosfat:
2NH3+CO2+3ATP+3H2O -> urea + 2ADP + AMP + 4Pi

 

(0) Fotosíntesi: llum + CO2 → sucres

Als cloroplasts de les cèl·lules de les fulles té lloc la fotosíntesi, que en resum és:

6 CO₂ + 12 H₂O + llum → C₆H₁₂O₆ + 6 O₂ + 6 H₂O

Cicle de Calvin (1961)

 

Garreu (1849) mostra que l’evaporació d’aigua a les fulles és proporcional al nombre d’estomes. Liebig mostrarà que l’humus i els fems no aporten altra cosa que minerals. Sachs i altres determinaran els que són essencials: nitrogen, fòsfor, sofre, calci, potassi i magnesi. A més tenen un paper en petites quantitats, el ferro, zenc, magnanesi, i boro. Juntament amb l’aigua, carboni i oxigen són els 13 elements que componen les plantes.

En el cas dels bacteris sulfurats el donador d’electrons és sofre en lloc d’oxígen, la reacció general seria 2H2D + CO2 = (CH2O) + H2O + 2D, on D és el donador d’electrons.
La meitat de la fotosíntesi que es fa a la terra es duu a terme per plantes superiors i l’altra per les algues microscòpiques dels oceans, diatomees i dinoflagelats. Un m2 de fulla origina 1g sucre per hora. Es calcula que s’aprofita un 0.12% de la radiació incident. La reacció té lloc als cloroplasts que contenen els pigments capaços d’absorbir la llum ( Lehninger p.608-610). Els pigments presenten un màxim d’absorció per llum de 700 nm i 680 nm.

Fase lluminosa: [carreguem les piles ADP a ATP] Dos fotosistemes es complementen per incorporar els e- de l’oxígen de l’aigua (contra la tendència natural redox) a un enzim NADP alhora que carreguen ADP a ATP:
2 H2O + 2 NADP+ + 3 ADP + 3 Pi + llum → 2 NADPH + 2 H+ + 3 ATP + O2

La fase fosca: [fem servir la pila que obtenir sucre a partir de CO2]
3 CO₂ + 9 ATP + 6 NADPH + 6 H+ → C₃H₆O₃-fosfat + 9 ADP + 8 Pi + 6 NADP+ + 3 H₂O


Respiració aeròbica

C1 indica CO₂, C6 indica 6 àtoms de carboni, glucosa

El procés es resumeix (en el cas que el sucre sigui la glucosa) com:
C₆ H₁₂ O₆ + 6O₂ → 6CO₂ + 6H₂O + energia (ATP)  ΔG = −2880 kJ per mol of C6H12O6

i té 4 etapes (és regulat per la càrrega energètica, és a dir, és estimulada per la concentració de ADP o AMP i inhibida per la de ATP.)

  • (1) Glucòlisi: sucres → Piruvat: glucosa + 2 NAD+ + 2 ADP + 2 Pi → 2 piruvat + 2 NADH + 2 ATP + 2H+ + H₂O. Té lloc al citosol de la cèl·lula. Ho duen a terme totes les cèl·lules vives. glucosa + 2ADP + 2Pi -> àcid làctic + 2ATP + 2H₂O, glucosa + 2ADP + 2Pi -> 2etanol + 2CO₂ + 2ATP + 2H₂O
  • (2) Descarboxilació oxidativa : Piruvat → Acetil-CoA Té lloc als mitocondris. El piruvat és oxidat després a Acetil-CoA. (Lehninger p.450)
    Àcid pirúvic + NAD + HSCoAAcetil-CoA + NADH + H+ + CO₂
  • (3) Cicle de Krebs (1937) Un conjunt de 9 reaccions. Per cada glucosa es fan dues voltes. L’acetil-CoA és acabat d’oxidar pels processos següents (Atlas p.303) Té lloc a les mitocondries i segueix les etapes: CH3CO-S-CoA -> Acetil-CoA, Citrat, Isocitrat, Ó-Oxoglutarat, Succinil-CoA, Succinat, Fumarat, Malat, Oxalacetat, Acetil-CoA. A cada volta s’incorpora una molècula d’àcid acètic, se n’alliberen dos de CO2 i 8 H+ i 8 e- que seran usats en el procés posterior (Lehninger p.456). Els àcids intermitjos es recuperen llevat de quan els productes intermitjos són aprofitats per a la biosíntesi. Aleshores cal reposar-los amb reaccions laterals.  [ Surt NADH i H+ que en la següent fase es combina amb oxígen per donar aigua i es recupera el NADH]
  • (4) Cadena respiratòria i Fosforilació oxidativa. També té lloc als mitocondris.  [Aquí és on entra l’oxígen per acceptar electrons i el 2H+ O- es convertiran en aigua, aquí hi hauria la combustió que suggeria Lavoisier] Es reoxiden els coenzims que que s’han reduït en les etapes anteriors i es produeix energia en forma de ATP. Els electrons i els protons implicats en aquests processos són cedits definitivament l’O₂ que es redueix a aigua.
    Transport Electrònic (Lehninger p.505) Els electrons alliberats en el cicle anterior són transportats pels enzims NADH i NADPH en reaccions del tipus: substrat.reduït + NAD+ <-> s.oxidat + NADH + H+, i posteriorment a deshidrogenases, proteïnes ferro sulfurades i citocroms. Cada etapa és una reacció redox amb uns potencials estàndar de l’ordre de 0.5V (Len.p.490). En aquest procés de transferència electrònica s’allibera molta energia lliure: AG=nFAE (n núm. e- transferits, F=23.000 cal, AE diferència de potencials redox) ¸ -52.7 kcal/mol [l’hidrogen s’oxida a aigua cedint e- a l’oxígen atmosfèric. La gran energia perduda s’usa per ADP -> ATP]
    Fosforilació oxidativa es duu a terme amb l’energia proporcionada pel transport electrònic: ADP+Pi+(2H++1/2O2)=ATP+H2O + 7kcal/mol. Aquest procés demana uns gradients de concentració d’ions que tenen lloc a les membranes dels mitocondris.

Alguns bacteris poden obtenir energia sense oxígen, amb respiració anaeròbica:  10H+ + sulfat ( SO24) + 8e- → H2S + 4 H₂O. És 15 vegades menys eficient que la respiració aeròbica. [no veig on entra la glucosa]
La fermentació, descoberta per Pasteur, no hi ha transferència d’electrons .


Anabolisme

Els components i energia obtinguda del catabolisme servirà per:

  • Treball químic, biosíntesi. En general la ruta de la síntesi és diferent a la de la degradació catabòlica. La síntesi és possible gràcies a l’acoblament amb reaccions que hidrolitzen l’ATP subministrant l’energia per convertir en endergònic un procés exergònic. La ruta anabòlica està regulada per la concentració del producte final (que actúa sobre l’enzim de la primera etapa de manera que el procés mai s’interromp a la meitat). L’economia dels processos cel·lulars millora ja que només se sintetitza si manca producte, aleshores es consumeix ATP i es desencadena el procés catabòlic just per compensar la pèrdua.
  • Treball mecànic, contracció, divisió cel·lular.
  • Treball osmòtic o de concentració, transport a membranes.
  • (Treball elèctric i tèrmic)

BIOSÍNTESI

  • Biosíntesi de glúcids i lípids
    Glúcids. (L. 23) és el procés més important de la bioesfera. Als autòtrofs és: CO₂ → hexoses→ midó (reserva) i cel.lulosa (parets) a les plantes. Als heteròtrofs: piruvat o lactat o aminoàcids → glucosa → glucogen (quitina insectes). El procés comença als mitocondris i acaba al citosol. Als vertebrats es fa al fetge.
    Lípids. (L. 24) són un mitjà de guardar energia de manera més concentrada que els sucres i també tenen un paper regulador (prostaglandines). A partir del Acetil-CoA i) Acids grassos → Prostaglandines i triglicèrids, ii) Hidroximetilglutaril-CoA → (terperns i cetones) Colesterol → àcids biliars, esterols fecals, hormones esteroides. Els procés té lloc als citosols a partir de l’acetil-CoA resultant de la respiració mitocondrial. En els vertebrats es fa al fetge, teixit adipós i glàndules mamàries.
  • Biosíntesi d’aminoàcids i proteïnes
    (L.25) Alguns organismes són capaços de fixar directament el nitrogen atmosfèric (bacteris i les plantes lleguminoses que els contenen). Totes les plantes són capaces de sintetitzar els 20 aminoàcids precursors de les proteïnes a partir d’amoníacs, nitrits (N2O3) o nitrats (N2O5) mentre que alguns animals superiors com l’home o la rata només en poden sintetitzar 10, havent d’ingerir els altres. Tots els aminoàcids es formen a partir de subproductes de processos catabòlics com la glucòlisi o el cicle de Krebs.
    De la glucòlisi la 6fosfat-glucosa és precursor de la histidina, el 3fosfoglicerat és precursor de la glycine i cysteine; phosphoenol pyruvate + , 3-phosphoglycerate-derivative erythrose 4-phosphate forma tryptophan, phenylalanine, and tyrosine.
    Del cicle de Krebs α-ketoglutarate és convertit en glutamate i després  glutamine, proline, and arginine. L’oxaloacetate passa a aspartate i després a  asparagine, methionine, threonine, and lysine.
    La síntesi dels no essencials fa oxoglutarat → àcid glutàmic → glutamina i prolina, piruvat i oxalacetat → alanina i àcid aspàrtic, fenilalanina → tirosina, metionina → cisteïna, fosfoglicerat → serina → glicina. Els aminoàcids essencials són: → àcid aspàrtic → treonina i metionina, piruvats → valina, isoleucina, leucina, àcid glutàmic → ornitina → arginina, → histidina, àcid pirúvic → aromàtics com fenilalanina i triptòfan.
    El pas d’aminoàcids a proteïnes és tan complex que ha de ser codificat amb molècules d’informació com és el RNA. [té lloc als ribosomes]
  • Biosíntesi de nucleòtids
    (L. 26) La poden fer gairebé tots els organismes. Fosfo-D-ribosa+ … + 2 anells → purines → adenina i guanina (AMP i GMP). Acid oròtic + ribosa → uracil i citosina (UMP i CTP). Els ribonucleòsids s’obtenen per reducció dels Desoxir.
    La síntesi dels àcids nucleics demana la intervenció de molècules d’informació, del codi genètic.

MOVIMENT
Conversió d’energia química ATP a energia mecànica per desplaçament de filament de proteïna miosina sobre els d’actina. (Tubulina) L’ATP es converteix en energia mecànica mitjantçant la contracció de filaments. Aquesta contracció és la base de i) moviment muscular (normalment consumeix un 30% de l’ATP produït, arribant al 85% en una cursa de sprint, amb tensions de 3.5 kg/cm2 arribant a 30 tones en tot el cos!) ii) organització del contingut celular iii) divisió cel. iv) activitat de cilis i flagelos v) transport de material.

  • Moviment muscular
    Miofibrilles, conjunt de sarcòmers miosina i actina. Un múscul està format per miofibrilles amb uns segments, els sarcòmers, que poden ser de dues menes, gruixuts i anisòtrops o prims i isòtrops. Cada segment està format per un tipus de filament, els prims d’actina i els gruixuts de miosina que es poden desplaçar al llarg dels anteriors. La longitud de cada filament es conserva, només varia la posició relativa (L. p.761). La proteïna actina, globular, s’uneix formant cadenes d’unes 150 peces que s’enrotllen format hèlixs dobles (filament prim). Cada 7 unitats hi ha una molècula de troponina que pot fixar el ió Ca2+. La molècula de miosina és una molècula molt llarga (160 nm) amb un cap globular. La miosina forma un complex amb l’ATP i quan hi ha l’impuls nerviós l’hidrolitza tot activant el cap que formarà una unió amb el segment molecular més proper. Aquestes molècules són al mig d’un sarcoplasma i un reticle sarcoplasmàtic entre el qual s’intercanvien Ca+. L’impuls nerviós introdueix Ca del reticle al sarcoplasma. El Ca es fixa a la troponina, en varia la configuració i lliga la miosina tot produïnt-se la contracció. El retorn del Ca del sarcoplasma al reticle allibera els ponts relaxant el muscle.
  • Cilis, flagels
    Conjunt de microtúbuls formats per tubulina, una proteïna de forma allargada que en grups de 10-14 forma un microtúbul de 10-5 mm de diàmetre i 10-2 de llarg. Els microtúbuls donen rigidesa a les regions plasmàtiques. Grups d’uns 27 microtúbuls formen centriols que intervenen en la divisió celular. Varis microtúbuls es poden unir per formar un cili (nombrosos i curts) o un flagel (2 o 3 per cel. i llargs). L’energia de l’ATP serveix per desencadenar una variació dels angles de segments correlatius que resulta en un moviment de fuet (Atlas p.17).
  • Transport
    Desplaçament de molècules a favor o contra un gradient de concentració. Passiu si és a favor d’un gradient de concentració i actiu quan a través d’una membrana es força l’entrada de solut contra el gradient. A la membrana hi ha enzims transportadors que s’acoblen al substrat que per si sol no la pot traspassar, i el fan entrar tot consumint ATP. Així ho fa la Na+K+ATPasa amb els ions K+, la concentració dels quals intervé en processos de glucòlisi, ribosomes i senyals nerviosos. En els mamífers es manté una concentració alta de K+ i baixa de Na+ dins la cèl·lula mentre que el fluid extracel·lular té concentracions inverses. (L. 28, Atlas p.25).

Autoreplicació i transcripció, DNA i RNA

Síntesi d’una cadena de DNA per aparellament de nucleòtids complementaris.(Lehninger 31 i 32)(Atlas p.33s) [DNA a química orgànica]. El pes molecular del DNA dels virus més petis és de 106, el dels bacteris de 109  i el dels cromosomes eucariòtics de 80 109 [Hi ha més diferència entre un virus i un bacteri, 103 que entre un bacteri i l’home, 80. Comptant que cada nucleòtid pesa 102 i que la cadena és doble, tenim ¸ 108 unitats d’informació, cabria en un disc de 100 Megabytes!].En els virus el DNA és lineal enrotllat, als bacteris és un llaç continu, a les cèl·lules eucariotes està associat a proteïnes com la histona formant la cromatina.

  • Replicació. El mecanisme (Meselson-Stahl 1958) és semiconservador: la doble hèlix es desenrotlla i cada una forma la seva complementària, de manera que el nou DNA està format per un bri vell i un de nou (el mecanisme conservador, sense desenrotllar-se, produiria un DNA fill totalment nou). El procés comença quan la RNA-polimerasa identifica els punts d’iniciació, trenquen la doble hèlix i sintetitzen 500 unitats de RNA com a cebador [iniciador, desencadenant], la DNA polimerasa Ó segueix a partir del RNA inicial afegint DNA (120-1000 unitats), la DNA polimerasa ß acaba la feina ( avegades intervé una gamma) i finalment s’elimina el RNA inicial. El nou bri té una polaritat complementària [les parts 3’i 5′ de la pentosa estan oposades]. La DNA-ligasa lliga els dos brins complementaris amb ponts d’hidrogen formant la doble hèlix.
  • Morfogènesi. Estructura 3D de l’hèlix de DNA, cromosoma. (L. 36) L’autocatàlisi del DNA explica la duplicació d’una seqüència lineal de nucleòtids o aminoàcids (→ codi genètic). Cóm es forma l’estructura 3D del DNA i el cromosoma? cóm es formen les parts 3D com els complexos enzimàtics, les membranes i orgànuls i les diverses estructures supracelulars?  El plegament es deu a minimitzar l’energia lliure. La mateixa raó explica l’associació de diferents molècules sense que arribin a formar enllaços covalents. Així es formen capes, fils. (S’ha estudiat en estructures simples com els virus o ribosomes).
  • Mitosi. (veure més amunt).Duplicació celular

Transcripció i Síntesi de Proteïnes
B1420.1.DP Un gen és transportat pel mRNA, s’aparella amb tRNA que té 3 nucleòtids que s’aparellaran amb un aminoàcid d’acord amb el codi genètic. Síntesi de proteïnes regulada per gens repressors fixats a l’operon.
Les RNA-polimerases(-DNA-dirigides) transcriuen tres menes de RNA a partir del codi de DNA (eines per a la síntesi de proteïnes):
rRNA: RNA ribosòmic, de paper encara sense esclarir del tot, possiblement amb funcions catalítiques, RNA-pol I. Fixa el mRNA.
mRNA: RNA missatger, per la RNA-pol II, transporta una seqüència de codi. Hi ha uns punts d’iniciació i de final.
tRNA: RNA de transferència, per la RNA-pol III, és una estructura en forma de trèbol, amb un dels braços anticodó (3 nucleòtids) que encaixa amb un codó (3n) del mRNA, i un altre braç aceptor amb capacitat de fixar aminoàcids.

Codi genètic

Cada grup de tres nucleòtids (­ codó) correspon a un aminoàcid (hi ha redundància de 64=43 codons contra 20 aminoàcids):

UUU Phe UCU Ser UAU Tyr UGU Cys
UUC Phe UCC Ser UAC Tyr UGC Cys
UUA Leu UCA Ser UAA End UGA End
UUG Leu UCG Ser UAG End UGG Trp

CUU Leu CCU Pro CAU His CGU Arg
CUC Leu CCC Pro CAC His CGC Arg
CUA Leu CCA Pro CAA Gln CGA Arg
CUG Leu CCG Pro CAG Gln CGG Arg

AUU Ile ACU Thr AAU Asn AGU Ser
AUC Ile ACC Thr AAC Asn AGC Ser
AUA Ile ACA Thr AAA Lys AGA Arg
AUG Met ACG Thr AAG Lys AGG Arg

GUU Val GCU Ala GAU Asp GGU Gly
GUC Val GCC Ala GAC Asp GGC Gly
GUA Val GCA Ala GAA Glu GGA Gly
GUG Val GCG Ala GAG Glu GGG Gly

[El mRNA es trasllada al ribosoma?] Els aminoàcids es fixen al t-RNA per acció d’uns grans enzims (pes molecular 150.000), les sintetases de l’aminoacil-tRNA, tot consumint ATP. Els anticodons del t-RNA van encaixant a la seqüència del m-RNA alhora que un altre enzim va separant els aminoàcids ja enllaçats del t-RNA. Arribats al final de la seqüència se separa el darrer tRNA, el mRNA i el polipèptid acabat de formar. El conjunt de DNA que correspon a una proteïna determinada (que transcriu una seqüència de mRNA) es diu gen.

El codi genètic és universal, comú a tots els sers vius. El “dogma central de la biologia molecular” (Crick 1958) afirma que la informació sempre flueix del polinucleòtid al polipèptid i no a l’inrevés. L’aparellament codó-anticodó i l’assignació codó-aminoàcid no té una explicació en termes d’energia d’enllaç que justifiqui el codi universal. El codi funciona gràcies a l’existència dels enzims que guien el procés. I aquests enzims existeixen gràcies a estar codificats en DNA mitjantçant el codi universal. Es a dir que potser el codi no és únic però un cop se n’ha format un per atzar entre diverses fluctuacions, l’avantatge selectiu que té és tan gran que és el que es reprodueix més ràpid, tot consumint la majoria de recursos i eliminant els competidors (Hipercicles Eigen 1971).

La meitat de les proteïnes sintetitzades és estructural i l’altra meitat enzimàtica.
Regulació de l’expressió genètica (L. 35)(A.467) Als procariotes, quan certs productes ja no són necessaris per a la cèl.lula, la producció del conjunt d’enzims que els genera és reprimit, (o estimulat e cas contrari). El conjunt de gens corresponent a aquest grup d’enzims s’anomena operon. Un operon conté els gens estructurals codificadors dels enzims, un gen regulador que codifica la proteïna repressora i un operador units entre sí. Si hi ha substrat pels enzims (→ regulació de l’anabolisme), aquest s’uneix a la proteïna repressora tot alliberant l’operador (Model de Jacob-Monod, 1961). La producció d’enzims es pot regular segons el medi, de manera que en unes condicions el repressor és fixat a l’operon inhibint la síntesi.
Als eucariotes la regulació és molt més complexa tot intervenint les hormones a més de la presència dels substrats dels enzims. (A.471 → paper de les histones, model de Britton-Davidson).


Altres

La unitat de vida mínima

No coneixem del tot els detalls de què passa dins d’una cèl·lula. Per això la recerca intenta crear la unitat viva més simple possible, 35 cops més petita que la Escherichia Coli, amb només uns centenars de gens en lloc de 5.000. (New Yorker 7/3/2022).

It was by accident that Antoni van Leeuwenhoek, a Dutch cloth merchant, first saw a living cell. He’d begun making magnifying lenses at home, perhaps to better judge the quality of his cloth. One day, out of curiosity, he held one up to a drop of lake water. He saw that the drop was teeming with numberless tiny animals. These animalcules, as he called them, were everywhere he looked—in the stuff between his teeth, in soil, in food gone bad. A decade earlier, in 1665, an Englishman named Robert Hooke had examined cork through a lens; he’d found structures that he called “cells,” and the name had stuck. Van Leeuwenhoek seemed to see an even more striking view: his cells moved with apparent purpose. No one believed him when he told people what he’d discovered, and he had to ask local bigwigs—the town priest, a notary, a lawyer—to peer through his lenses and attest to what they saw.
Today, we take for granted that we are made of cells—liquidy sacs containing the Golgi apparatus, the endoplasmic reticulum, the nucleus. We accept that each of us was once a single cell, and that packed inside it was the means to build a whole body and maintain it throughout its life. “People ought to be walking around all day, all through their waking hours, calling to each other in endless wonderment, talking of nothing except that cell,” the physician Lewis Thomas wrote, in his book “The Medusa and the Snail.” But telescopes make more welcome gifts than microscopes. Somehow, most of us are not itching to explore the cellular cosmos. Today, although there’s still no microscope capable of showing everything that’s happening inside a living cell in real time, biologists grasp the strangeness of the zone, bigger than atoms but smaller than cells, in which the machinery of life exists. They’ve analyzed the tiny parts from which cells are made and learned how those parts interact. They’ve frozen cells, photographed them, and used computer simulations to revivify the pictures. They’ve studied the apparently empty spaces inside cells and discovered that they contain a world governed by unintuitive physical laws.

Several groups of “synthetic biologists” are now close to assembling living cells from nonliving parts. If we could design and control such cells with precision, we could use them to do what we want—generate clean energy, kill cancers, even reverse aging. The work depends on understanding a cell’s inner workings to a degree that van Leeuwenhoek could not have imagined.

They’ve modified a species of bacterium to create a “minimal” cell. It contains only what’s necessary for life—it’s the cellular equivalent of a stock car onto which new components can be bolted. John Glass, one of the project’s leaders, described the minimal cell to me as “a platform for figuring out the first principles in biology.”
J. Craig Venter, an instrumental player in efforts to sequence the human genome, felt a need to simplify. Why not create a cell with as few genes as possible, and use it as a model organism? If you wanted to understand a more complicated biological process, you could add the genes for it to your minimal cell. Venter assembled a team of biologists that included Glass, who was one of the world’s leading experts on a bacterium called Mycoplasma. “If you went to the zoo and lined up all the mammals and swabbed their urogenital tracts, you would find that each of them has some mycoplasma,” Glass told me. Because the bacteria live in such a nutrient-rich environment, they rarely have to forage for food, or even do much to digest it;
By 2016, after a few revisions, they had devised a minimal Mycoplasma genome half the size of the original. A researcher named Carole Lartigue spent years during her postdoc solving the daunting problem of implanting the genome in a cell. The bacterium that eventually resulted from the work was called JCVI-syn3.0. It was an engine bolted to some wheels.
For contrast, Cook had prepared samples that contained both JCVI-syn3A and E. coli. The lab rat of biology, E. coli grows quickly and uniformly, and is genetically manipulable. It also hunts and eats, has a rudimentary kind of memory, and possesses around five thousand genes, compared with the minimal cell’s roughly five hundred. After Cook loaded the syn3A slide, I peered through the eyepiece, but struggled to distinguish the minimal cells from the floaters in my eyes. Then I looked at the other slide. An E. coli swam by. It was about thirty-five times bigger than the minimal cell by volume, and crenellated with complexity—a destroyer rather than a dinghy.
He showed me a poster noting all of JCVI-syn3A’s genes. About a third were labelled as having an unknown function. When the project began, there were a hundred and forty-nine mystery genes. Now about a hundred were left.
Generally, what a gene does depends on the protein it tells our cells to make. It’s proteins that run the cellular world, by sparking chemical reactions, sending signals, and self-assembling into biological machines. To understand and control a cell, or to design a new one, biologists need to know exactly how a given protein behaves in the cellular environment. What shapes can it take? What does it interact with? What happens when a small molecule, like a drug, gets lodged in one of its crevices?
Our best pictures of the protein-rich cellular interior have come not from a microscope but from the brush of David S. Goodsell, a sixty-year-old biologist and watercolorist at the Scripps Research Institute. When I met Goodsell at Scripps, which is just down the road from J.C.V.I., he had long hair, a full beard, and a funky face mask. A painter since the age of ten, he illustrated his first E. coli during his postdoc, in 1991; the article that resulted, “Inside a Living Cell,
Roseanna N. Zia, a physicist who studies cells, emphasized the importance of physicality in biology. She told me that there were other “colloidal” properties of the cytoplasm, besides liquid-liquid phase separation, that nature might be using to its advantage—for instance, the fact that a shove at one end of the cytoplasm propagates, nearly instantly, to the other. Her group models how individual molecules subtly interact. “This area of understanding how colloidal-scale physics is regulating and orchestrating cell function—this is the frontier,” she said.

[ semblava que la biologia es reduïa a química i la química a física, i tot just estem aprenent a mirar les cèl·lules més simples!]


Cells, not DNA, are the master architects of life. No podem explicar encara què determina l’organisme a partir del DNA, sense l’entorn de la cèl·ula. No podem generar un ésser viu simplement a partir de la informació. I mlagrat les esperances inicials, tampoc podem posar una cèl·lula mare en una placa de Petri i desenvolupar el teixit que vulguem, cal un entorn determinat d’un conjunt de cèl·lules.

Herència

La vida  Evolució

Espècie i Herència. Procariotes. Eucariotes. Lleis de Mendel. Sexe. Mutacions. Clonació. Domesticació


Espècie i herència

Conjunt d’organismes amb característiques prou semblants com per reproduir-se entre ells i heretar-les. [la vida suposa complexitat i ordre, els trets es perpetuen. Linneu
Schrödinger assenyalava com d’extraordinari era que es pogués mantenir.] Els individus de l’espècie, en un hàbitat ecològic adequat, van naixent, reproduïnt-se, morint i, eventualment, evolucionant o extingint-se.
L’herència és el procés de transmissió de caràcters morfològics i fisiològics d’un organisme a la seva rèplica per informació genètica. (A.443) En una espècie, els organismes que se succeeixen cada generació són semblants gràcies a la constància relativa de la informació genètica que hereten (replicació DNA) tot i que hi ha alguns caràcters variables degut a la recombinació i, en temps llargs, mutacions que alteren el material genètic. (1865 Mendel, 1950 Morgan).

  • Genotip: en un individu, caràcters deguts a material genètic fix.
  • Fenotip: caràcters deguts a l’herència+ambient. El fenotipus és la suma de caràcters morfològics i fisiològics resultat del genotipus, el material genètic fix, i  la influència de l’entorn. (A.449) En general la correspondència 1 fen=1 gen no sempre és certa. A vegades un caràcter és controlat per varis al·lels (4 gens pel grup sanguini), o bé un sol al·lel controla varis fens alhora.
  • Al·lel: Conjunt de gens d’una espècie que regulen un mateix caràcter, posició cadena DNA, dos a cada organisme diploide. Els gens que regulen un mateix caràcter i estan a la mateixa posició en la cadena de DNA reben el nom d’alel·ls. A tots els organismes diploides, per un caràcter hi ha dos grups de gens que el regulen, una parella d’al·lels. Es podran combinar barrejant-se o bé dominant un sobre l’altre. Si no estan barrejats se simbolitzaran per AA, BB,… Quan un sigui recessiu, que es deixi dominar per l’altre s’escriurà aa, bb.

La mida del genoma en mitjana per a diferents organismes és, en parells de bases:

  • Fongs: 10-50 Mb
  • Angiospermes: 0.1 a 1.50 Gb
  • Insectes: 0.1 a 1.50 Gb
  • Aus: 1 a 3 GB
  • Mamífers: 1 a 6 Gb, 3.2 en el cas dels humans. la mida d’un gen pot variar però rau al voltant de 10m-15m parelles de bases. El genoma humà té de l’ordre de 20m-25m gens que codifiquen proteïnes, tot just un 2% dek genoma total [i com ho saben?] [No és un procés de còpia exacta. L’ambient determina quins gens s’expressen. (Cells, not DNA, are the master architects of life). S’estima que només un 2% del DNA està dedicat a codificar proteïnes (BBC the mistery of human genome dark matter). S’observen casos d’epigenètica en que es propaguen característiques adquirides sense que hi hagut canvis en el DNA. v[epigenètica, què s’expressa, genoma dark matter]

Herència en els Procariotes

(A.459) [Són més simples d’estudiar, com el bacteri Escherichia Coli, i en ells es va poder determinar la seqüència de nucleòtids del DNA). El DNA d’un virus es pot introduir en un bacteri i reproduir-se. (A.462, Meselsohn-Stahl el DNA de diferent tipus es determina per centrifugació, quedant a diferents posicions del tub segons la seva densitat).

Herència en els Eucariotes

Lleis de Mendel

[Es creia, amb raó, que els individus hereten característiques dels pares. Però com? Per exemple creuant flors blanques i vermelles, se n’obtindríen de rosades? Els experiments de Mendel amb pèsols van dur-lo a la conclusió que les característiques del color, el que més endavant s’anomenaria gen, s’heretaven senceres, és a dir, o blanc o vermell. Una dominava sobre l’altra (gen recessiu). Aquest darrer podia quedar emmascarat fins a una propera generació.]

  • LLei d’uniformitat. El creuament de dues races homozigòtiques [pures, per un tret com el colro té Aa o aa] que es diferencïin només en un parell d’al·lels donaran una generació F1 amb tots els híbrids iguals (flors blanques + vermelles = f.roses, RR + BB = RB + RB).
  • Llei de Segregació El creuament de membres de F1 dóna F2 RB+RB+RB+RB = RR + BB + RB + RB [Es recupera RR per segregació dels R durant la divisió).
  • Llei de recombinació. Quan les races difereixen en dos o més al·lels aquests es barregen i recombinen donant lloc a tipus nous (A.444 B). Així la barreja de races diferents pot recuperar algún caràcter atàvic. La recombinació genètica, possible gràcies a la reproducciósexual dels haplontes, té un paper important en l’evolució doncs 10 mutacions simples poden donar lloc a 210 races diferents. La recombinació és a nivell de cromosoma, per la qual cosa no es poden recombinar de qualsevol manera sinó que el grup que pertany a un mateix cromosoma segueix junt (grup de lligament) (1950, Morgan Mosca del Vinagre, Drosophila Melanogaster, amb 500 gens agrupats en 4 grups i per tant 4 cromosomes).

Determinació del sexe
Totes les cèl·lules són potencialment bisexuals. En les algues, fongs, talòfits i hermafrodites (falgueres i espermatòfits), el caràcter és determinat per l’ambient. A les plantes inferiors, les cè·lules diploides són hermafrodites però en la fase haploide es determinen d’un sexe o un altre, és a dir, durant la meiosi (det. haplogenotípica). En la determinació diplogenotípica, durant la meiosi es formen gàmetes X X (femella) o X Y (mascle). Si la fecundació és XX tindrem femella i si és XY un mascle (en alguns peixos i rèptils és a l’inrevés).

Herència extracromosòmica
A part del DNA nuclear que es troba en els cromosomes hi ha processos de replicació basats en DNA del citoplasma que duplica mitocondris i plàstids (origen de la vida). A l’home l’estudi és complicat donat que els caràcters (fens) observables com color de cabells, ulls i pell, alçada, intel·ligència i personalitat estan controlats per gens diversos i molt influïts pel medi ambient. Hi ha 23+23 cromosomes de manera que la dona és 44+XX i l’home 44+XY. [no tenim una configuració a demanda, triar sexe, alçada, color dels cabells].

Mutacions
La informació hereditària pot quedar alterada per mutacions. A les cèl. somàtiques (mitosi, regeneració teixits) està relacionat amb la diversitat d’anticossos, el [creixement desordenat] dels tumors i l’envelliment fisiològic que afecta la síntesi proteica. Les alteracions a les cèl. sex. afectaran totes les cèl. del fill, amb el resultat de que no reculli les caràcterístiques pròpies de l’espècie i estigui mal adaptat, o bé que el canvi sigui avantatjós.
La mutació pot ser puntual si afecta un parell de nucleòtids de la seqüència de DNA, cromosòmica quan es perden fragments sencers de DNA del cromosoma o de ploidia si canvia el nombre de cromosomes sencers. Les causes de l’alteració poden ser un mal funcionament del DNA-polimerasa, l’absorció de fotons de raigs ultravioleta, i és afavorida per un augment de temperatura. En el cas de ploidia l’alteració es deu a problemes en el procés de duplicació cromosòmica a la mitosi.

Clonació i edició
Clonat de gens. Les tècniques de manipulació genètica permeten clonar gens amb el procediment següent: es trenquen molècules de DNA usant endoRNA-ases específiques que després s’uneixen amb ligases i la mostra s’introdueix a l’Escherichia Coli [com un virus] que el fabrica amb gran eficàcia.
Clonat d’individus. Per reproducció asexual es poden obtenir vegetals a partir de cèl·lules somàtiques i es milloren les espècies d’interès agrícola. El 1996 es va aconseguir clonar l’ovella Dolly. I en un futur s’espera poder generar embrions a partir de qualsevol cèl·lula del cos (New Yorker 2023). El 2018 He Jiankui va editar el genoma d’uns humans (New Yorker 2023), i posteriorment fou empresonat.

Domesticació
El canvi de les condicions fisiològiques [forma de vida] de bèns i porcs on la selecció natural és substituïda per la selecció de les cries per part de l’home, afecta els organismes amb pèrdua de sentits que ja no necessiten i disminució de la mida cerebral. [Cóm queda fixat? També per alteració mutació o bé queda fixat d’una generació a l’altra cosa que implicaria el Lamarckisme?]
Les plantes cultivades tenen uns fruits més grans. Es parla de caràcter Gigas i s’atribueix a un augment del genoma per diploidia. El canvi no només pot ser de mida sinó de durada, passant a vegades d’anuals a bianuals. La selecció es fa produint les varietats que s’han mostrat millors i assajant creuaments entre varietats per combinar qualitats diferents com mida del fruit i resistència al clima. [Hi ha modificacions que produeixen animals amb una vida més difícil, ja sia vaques per produir més llet o gossos per satisfer capricis dels compradors]

Fisiologia. Metabolisme d’organismes

La vida  Metabolisme cel·lular


Introducció. Respiració Fisiologia vegetal Nutrició, transport xilema i floema, excreció. Fisiologia animal. Digestió extracel·lular. Excreció. Respiració. Transport. Músculs.


Processos dels òrgans de l’organisme amb entrada de nutrients, assimilació i evacuació de deixalles [metabolisme global] garantint el metabolisme cel·lular i el seu entorn. [Una tribu autosuficient tindria aigua, conreus, ramat, minerals, i es podria proveir de tot. En el meu pis, jo no sóc autosuficient, hi ha un sistema que em fa arribar aigua, gas, llum, els aliments, els vestits, els mobles, es fabriquen en altres llocs i un sistema me’ls deixa a una botiga del barri o me’ls fa arribar Amazon. Jo contribueixo -contribuïa- en una part del sistema de control].

Les necessitats metabòliques individuals de les cèl·lules de l’organisme es resolen a nivell global gràcies a l’especialització de cèl·lules i òrgans (diferenciació i teixits).
Després que les plantes han fabricat glucosa amb la fotosíntesi, tots els organismes duen a terme un procés de respiració. [ La respiració en animals i plantes, és una mena de combustió lenta que té lloc en tots els teixits [la fermentació que fa el llevat convertint el sucre en alcohol la fan també les zimases a tots els teixits vegetals i animals. Felix Hope-Seyler descobreix com l’oxigen és recollit per la sang]. Hi ha una respiració sense oxigen, anaeròbica, observada per Cagniard de la Tour el 1838. El 1897 Büchner troba que extractes de llevat (sense la cèl·lula sencera) també poden fer fermentar la glucosa, ho fan els enzims.


Fisiologia vegetal

Nutrició. Les plantes necessiten

  • aigua
  • gasos com O₂ i CO₂
  • nitrògen (nitrats → metabolisme del nitrogen)
  • fòsfor (fosfats → ATP i àcids nucleics)
  • sofre (sulfats → aminoàcids que contenen S) per als processos orgànics
  • una sèrie de components minerals (anions i cations) que formen part d’alguns enzims, processos de transport i estructura del citoplasma. K+ i Ca++ intervenen inflant i desinflant citoplasma. Mg++, Mn++, Fe++ són necessaris per alguns enzims i citocroms de la fotosíntesi.

Transport
(A.289) Les sals minerals i l’aigua són absorbides per les arrels mitjançant osmosi (deixa entrar aigua i solvent i només deixa sortir aigua). Aquestes substàncies s’han de transportar als llocs de producció i magatzem (ràpid 95%) i del magatzem als llocs de consum (lent 5%). El transport a curta distància es fa a través dels espais intercelul·lars i el protoplasma comú a totes les cèl·lules. (A.288) fins que s’arriben a les conduccions especialitzades en conducció (xilema i floema).
Xilema: Transport general de líquid, aigua i minerals  de les arrels a les fulles.  Entren per osmosi a les arrels i es transporta cap amunt per capilaritat a través dels vasos del xilema. (Strasburger 1891), evaporació a les fulles segons el nombre d’estomes (Garreu 1849) Les fulles cedeixen vapor d’aigua provocant una succió que arriba als 40 bars i que pot ser prou com per impulsar-la fins a 140 m.
Floema. Com es fa arribar a tot l’organisme els nutrients [equivalent a la circulació de la sang]? Hi ha un altre sistema de vasos, el floema, per on circulen els sucres des de llocs d’alta pressió, com les fulles, a llocs de baixa pressió, com les arrels. (Münch ∼1930, i més tard Sussex i Sadava el 1983). Els espais intercel·lulars permeten l’intercanvi de gasos per simple difusió. Nutrients. (1930 Ernst Munch) . DK 154

Excreció
(A.295) A part de l’aigua s’eliminen excés d’hidrats de carboni mentre que no hi ha un mecanisme d’excreció de nitrogen com la urea en els animals degut a que les plantes gairebé sempre són deficitàries en Nitrogen. Algunes substàncies com olis, resines i cautxú surten de les cèl·lules i queden guardats en bosses (explotació comercial).


Fisiologia animal

Cal un entorn amb nutrients vegetals. Els heteròtrofs necessiten aminoàcids que no són capaços de sintetitzar, hidrats de carbó (glucosa) o greixos com a combustible energètic, components inorgànics com Na, K, Ca, Mg, Cu, per processos nerviosos, enzims, i vitamines per sintetitzar enzims. La digestió intracelular (protozous i cèl·lules  fagocitàries) té una fase àcida on l’aliment es descompon en components que seran incorporats o expulsats per excreció.

  • Digestió extracelular
    Als annèlids, artròpodes i vertebrats l’especialització cèl·lular permet una digestió extracelular (A.284 B) on els aliments recorren un tub on van essent transformats fins a la seva incorporació o excreció: digestió bucal (trituració+saliva), digestió gàstrica (àcid clorhídric i altres a la paret de l’estómac que descomponen les proteïnes i mata els bacteris), digestió intestinal (midó a glucosa, proteïnes a polipèptids, greixos a àcids grassos) mitjançant la secreció alcalina del pàncrees. La bilis del fetge activa els moviments de l’intestí col.laborant al procés. Els resultats de la digestió de baix pes molecular són absorbides a l’intestí (a.enteral) afavorides per les vellositats i moviments de l’intestí estret. S’anomena metabolisme basal a la producció d’energia necessària per mantenir les funcions vitals en estat de repòs (5800-8400 kJ a l’home segons edat, pes i sexe) i depèn de la massa segons M0.73 (més un ratolí que un elefant).

    • Proteïnes: la pepsina a l’estómac talla les proteïnes en pèptids. A l’intestí prim s’acaben de dividir en aminoàcids.
    • Hidrats de carbó: la amisala de la saliva degrada el midó a maltosa. A l’intestí prim de maltosa a glucosa.
    • Greixos (lípids): intestí prim, la lipasa pancreàtica passa als quilífers [?]
    • Fibra: passa de llarg i s’acumula a l’intestí gruixut.
    • Aigua: Se n’absorbeix una mica a l’estómac i intestí prim; la majoria a l’intestí gruixut.
    • Vitamines liposolubles (A, D, K): Intestí prim amb la bilis del fetge es preparen. Al gruixut bacteris generen la K i s’absorbeixen totes.
    • Vitamines hidrosolubles: s’absorbeixen als intestins prim i gruixut.
    • Minerals (Fe, Na, Ca): S’absorbeixen a l’intestí prim.

     

Excreció
S’expulsen productes metabòlics sobrers o tòxics i es defequen substàncies no digeribles (no arriben a entrar en el procés). Entre els primeres s’eliminen sense transformar el CO2 i NH3, àcids grassos i aminoàcids quan estan en concentracions elevades, s.actives i toxines mentre que el nitrogen requereix la preparació d’àcid úric enzimàticament i amb despesa d’energia. Mentre els mesozous i celenterats expulsen els productes sense intervenció d’òrgans, els animals superiors han desenvolupat els ronyons on es genera l’orina (amb els productes de deixalles) que serà traspassada als conductes urinaris. El CO2 és eliminat pels pulmons, la suor elimina sals inorgàniques i les brànquies dels peixos l’excés de sal.

Respiració
Els unicelul·lars han d’estar en contacte amb l’oxigen per dur a terme la respiració que els dóna l’energia necessària. Els animals superiors han desenvolupat un sistema de transport eficaç que manté les cèl·lules en estat permanent de saturació de O2. El gas es transmet per difusió ajudat per moviments (brànquies de crustacis, compressió i expansió d’òrgans en caragols pulmonats, insectes i vertebrats) i passa a l’organisme a través d’un sistema traqueal (insectes) o circulatori (vertebrats).

Transport
Procés pel qual es posa en contacte els diferents òrgans a través del sistema circulatori, sang. Els nutrients de la digestió (sucre), i O2 (hemoglobina) de la respiració són transportats a les cèl·lules on té lloc el metabolisme que allibera CO2 i deixalles. Aquestes són transportades als pulmons i sistema excretor. Funció d’immunologia ( leucocits ) protecció de coagulació ( trombocits ).
Als celenterats el transport es fa pels espais intercelul·lars i a través de les cèl·lules. Els animals superiors han desenvolupat un sistema de vasos sanguinis que en els insectes és obert i en els annèlids i vertebrats és tancat. El sistema de vasos capil·lars (diàmetre de 5-10μm ) intercanvia CO2 i O2 als pulmons, i cedeix productes residuals als òrgans excretors. El líquid intersticial és substituït per plasma nou sanguini i queda acumulat a les vies limfàtiques on va a parar a les venes. El líquid és impulsat pel cor. [En el líquid intersticial que envolta la cèl·lula, com se separen en artèries i venes el que és aliment del que és deixalla?]
Sang. El transport de substàncies a través de la xarxa de vasos sanguinis acompleix funcions de respiració, nutrició-excreció, amortiguació (regulació concentració H+), cessió de calor i immunobiologia. Consta d’unes cèl·lules  [carros de transport, arteria ­autopista] leucocits (immunologia i reparació, originats al teixit conjuntiu), trombocits o plaquetes (coagulació) i eritrocits o glòbuls rojos (produïts a la medul·la òssia, cèl·lules contenint molta hemoglobina, proteïna amb ferro que fixa l’oxigen). En la respiració l’aire captat pels pulmons es difon en la sang, queda fixat a l’hemoglobina i és alliberat al plasma quan troba molta concentració de CO2. Aquest es dissol a la sang en forma de HCO3– la qual cosa suposa una acumulació d’àcids a la sang que és compensada amb l’aportació de bases (amortiguació). La funció de la sang és tan important que els organismes superiors han desenvolupat un sistema de coagulació per evitar pèrdues en cas de ferida (trombocits). També hi ha un sistema de defensa contra microorganismes nocius com la secreció de lisozima, els interferons i cèl·lules fagocitàries, alhora que hi ha també una defensa cel·lular específica en els vertebrats (en l’organisme humà el sistema immunitari pesa un kg i té 1020 anticossos) que consisteix en la generació dels enzims específics per destruir el cos detectat com a estrany. L’al·lèrgia és una reacció immunitària inadequada. Quan la sang roba cèl·lules amb el nivell d’oxigen baix, l’hemoglobina els el cedeix. L’energia de la respiració es fa servir per la divisió cel·lular, construcció de proteïnes i DNA i transport.

Músculs
Es contrauen per l’acció de dues proteïnes la miosina (Kühne 1864) i l’actina (Halliburton 1887). 1954 Andrew Huxley i Jean Hanson mostren que als músculs, els filaments de la proteïna actina llisquen sobre la miosina per contraure’l tot consumint energia ATP.)
En repòs els filaments fins de l’actina se superposen una mica sobre els de la miosina. Quan es rep un senyal nerviós, els filaments d’actina llisquen sobre la miosina escurçant el múscul i consumint energia ATP.


La reproducció i generació d’un nou organisme

La vida   |    La vida que tenim al voltant

Reproducció: asexual, sexual, aspectes evolutius
Diferenciació i teixits: la societat de cèl·lules. Vegetals: teixits parènquima i meristema. Òrgans: arrels, tija, fulles. Tipus fonamentals. Animals. Teixits de revestiment, conjuntiu, muscular, nerviós. Òrgans: Pell, Esquelet, Músculs, sistema respiratori, digestiu, excretor, endocrí, sanguini, immune, nerviós, reproductor. Tipus fonamentals d’animal: celenterats, cucs, mol·luscs, artròpodes, vertebrats.
Creixement, microorganismes. Tres fulls embrionaris, ectoderma, endoderma, mesoderma. Animals, forma tancada. Plantes, forma oberta.


[ De quines maneres es reprodueixen els éssers vius? La reproducció de l’organisme suposa la rèplica de la “societat” de cèl·lules. De la simple divisió cel·lular asexual dels protistos, que no tenen cèl·lules especialitzades, en la reproducció sexual passem a tenir gàmetes mascle i femella per a la reproducció (amb N cromosomes) que es fusionen per donar lloc a un nou organisme. Aquest està format per cèl·lules somàtiques que es copien per mantenir un teixit però que no poden donar lloc a un nou organisme. Mentre que la simple divisió fa còpies, la reproducció sexual barreja materials de diferents organismes].

Moltes espècies presenten alternen reproducció sexual i asexual. Alguns protists es  poden reproduir sexualment després de diverses generacions asexuals. En algues, fongs, molses i falgueres, creix un esporòfit d’on sortiran gàmetes mascle i femella. També es dóna en els celenterats.


Reproducció asexual

  • En els protistes tot l’organisme es torna una cèl·ula germinal asexual. En les colònies (esponges), talòfites, fongs i falgueres només una part de l’organisme conserva la totipotència. En el volvox és la meitat de la colònia mentre que d’altres produiran espores que després generaran un organisme sencer. Aquesta és una reproducció asexual monocitògena, que parteix d’una sola cèl·lula. A les plantes hi ha reproducció asexual policitògena (a partir d’una part del cos pluricel·lular). Sense un òrgan reproductor especialitzat, una part del cos pot subsistir i créixer independentment. Per exemple el despreniment d’un tal·lòfit a causa d’un cop, un esqueix, etc. Als animals hi ha divisió asexual policitògena per divisió d’embrions (bessons i cucs de terra), per formació de borrons i separació de la forma juvenil en celenterats i alguns cucs paràsits, pel mateix d’organismes adults com al divisió i separació longitudinal de la hidra o l’actinia en els celenterats.
  • Fissió: Els Procariotes es divideixen en dues cèl·lules iguals. Els eucariotes com protistes i fongs unicel·lulars també ho poden fer per mitosi. [la nova cèl·lula té el mateix nombre de cromosomes].
  • Espores: Moltes plantes produeixen espores haploides per meiosi (reducció de 2N a N cromosomes) que, en lloc de fusionar-se amb una altra cèl·lula haploide com en la reproducció sexual, es divideixen fins a formar un individus multicel·lulars,  gametòfits mascle i femella [és com si l’estratègia de la reproducció encara no ha aconseguit que tingui lloc la fecundació d’esperma i òvul de seguida]. Aquesta generació produeix cèl·lules gàmetes per mitosi [. L’esperma fecunda l’òvul i creix un nou esporòfit.
    En les  molses l’esporòfit (2N) es veu com una tija que sobresurt de les fulles amb un sac a dalt. Hi ha una alternança de generacions. N’hi ha de sinoiques i d’heteroiques.
    En les falgueres el que veiem com fulla és l’esporòfit (2N). Dels sacs sota les fulles en cauen les espores que donen lloc a gametòfits mascle (anteridis) i femella (arquegònides), N haploides. Després de la fecundació creixerà un nou esporòfit.
  • Fragmentació: una part se separa i esdevé un nou organisme. Pot ser una part del miceli en els fongs, les gemmes en les hepàtiques, els líquens que són la unió d’un fong i una alga, el despreniment d’una part del tal·lus en una alga, o un esqueix en una planta superior que desenvoluparà arrels.
    En els animals es dóna en diversos cucs, celenterats com la hidra o l’actínia, i estrelles de mar.
  • Partenogènesi: un ou sense fecundar evoluciona en un nou organisme. Acostuma a donar-se en casos que normalment serien de reproducció sexual però que per circumstàncies adverses no hi ha gamet masculí disponible.  S’ha observat en 2000 espècies, la majoria invertebratsm rotífers, àfids, insectes pals, i alguns vertebrats, peixos, amfibis i, recentment, el dragó de Komodo i Varanos. En les plantes es dóna en falgueres i altres angiospermes com la dent de lleó. En aquest cas s’anomena apomixis.

Reproducció sexual

Els metazous són organismes amb dotació genètica de cromosomes duplicats, o diploide (diploide dominant), fabriquen cèl·lules gàmetes, esperma o òvuls, per meiosi, un procés que divideix una cèl·lula dues vegades fins a obtenir-ne quatre amb només una còpia de cada cromosoma, haploide. Quan un òvul és fecundat es converteix en un zigot diploide que combina el material genètic dels dos.
Els protistos i les algues viuen tot el cicle com a haploides, s’uneixen dos individus per formar un zigot diploide i seguidament una meiosi dóna quatre individus haploides.
Els gàmetes s’especialitzen en òvul immòbil i espermatozou mòbil. El gran avantatge de la reproducció sexual és la mescla de dotacions genètiques diferents, la del mascle que aporta l’espermatozou i la de la femella que aporta l’òvul. Té un paper important de cara a l’evolució. (les dotacions genètiques no es barregen en la paidogàmia (A.157) on els gametos procedeixen d’un mateix individu; permetent així la reproducció en espècies de difícil aparellament, com els pòlips sèssils o gasteròpodes).

Fases de la meiosi

  • meiosi I: Profase I parelles de cromosomes amb material procedent del pare i la mare. Cadascun està format per dues cromàtides unides al centre. Metafase I: es recombinen les cromàtides barrejant els gens [es divideix el material, si abans teníem 3 parelles, ara només 3]. Anafase I: se separen les cromàtides [3 parelles]. Telofase I: es divideix la cèl·lula [2 cèl·lules amb 3 cromosomes]. Profase II
  • meiosi II: Metafase II els cromosomes tenen dues cromàtides que ja no són idèntics sinó barreja. Anafase II. Les cromàtides se separen i es desplacen als pols ([6]. Telofase II. Les cèl·lules es tornen a dividir . Citocinesi: al final tenim quatre gàmetes haploides.
  • La fecundació té lloc entre cèl·lules haploides i en resulta una diploide. La fusió requereix una trobada de les gàmetes que es facilitada químicament. L’espermatozou contacta amb l’òvul, desfà la membrana, i l’activa. Després els dos nuclis es fusionen s’aparellen els cromosomes en una placa equatorial quedant un zigot diploide.

Inicialment els gàmetes no es diferenciaven de les altres cèl·lules mitòtiques i les diferents funcions quedaven determinades per condicions ambientals. Després el que inicia la fecundació es va tornant més mòbil i l’altre més reposat (anisogamia) fins que als metazous i plantes superiors trobem un macrogàmeta immòbil amb força reserves i un espermatozou petit, mòbil, amb cilis que busca l’òvul per fecundar-lo. A les plantes superiors i animals els gàmetes es formen en òrgans diferents (ovari i estams), a vegades en un mateix organisme (sinoics) i d’altres en organismes diferents (heteroics). La cèl·lula de l’esperma es divideix per meiosi i en resulten quatre espermatozous mentre que la femella resulta en l’òvul (macrogàmeta) i tres corpuscles.

[El creixement i regeneració cel·lular somàtic dels teixits d’un organisme és per mitosi. Es duplica una cèl·lula amb dotació diploide.] [Podria haver-hi hagut reproducció que combinés material genètic de dos organismes sense haver-se d’especialitzar en mascle i femella?]).

  • els fongs poden tenir reproducció sexual i asexual, adaptant-se a les circumstàncies. Dos fongs haploides poden unir les hifes dels micelis sense arribar a fusionar cromosomes (dicariota), produint un bolet on es fusionen els nuclis (diploide) que per meiosi fan una espora haploide. Aquesta germinarà i donarà lloc a un miceli haploide. Esquema.
  • Plantes
    A les angiospermes i ginospermes la disposició de la flor permet una trobada més eficaç entre gàmetes ♂ i ♀ sense haver de recórrer a l’aigua. Quan el gra de pol·len cau damunt l’estigma fecunda l’òvul → i) el nucli → zigot → embrió ii) nucli secundari → endosperma i teixit nutritiu que juntament amb els teguments seminals convertits en coberta formen una llavor amb tres parts. [Això és la llavor, a diferència de les espores dels pteridòfits. A les angiospermes està coberta i a les gimnospermes nua] .

    • les molses i falgueres alternen generacions asexuals (esporòfits, més amunt) i sexuals .
    • Gimnospermes: L’arbre que veiem normalment és l’esporòfit, diploide (2N cromosomes), en el qual creixen [ a la mateixa planta, no a terra] els gametòfits mascle i femella, haploides que en fusionar-se donaran lloc a un embrió [el pinyó] diploide. [no tenim doncs organismes mascle i femella adults i independents].
    • Angiospermes: plantes amb flor, òrgans masculins, els estams (amb l’antera que conté el pol·len i el filament) i l’òrgan femení, el pistil, format per un o més carpels (amb l’estigma on quedarà enganxat el pol·len que desenvoluparà un filament fins arribar a l’ovari que conté els òvuls). L’òvul fecundat donarà lloc a una llavor d’on germinarà la planta. Així hi pot haver reproducció sexual al mateix lloc alhora que en col·laboració amb els insectes s’optimitza la difusió. Camerarius (1694) ho va demostrar tallant els estams. La disposició de la flor permet una trobada més eficaç entre gàmetes sense haver de recórrer a l’aigua com en les molses i falgueres. Quan el gra de pol·len cau damunt l’estigma fecunda l’òvul, es crea un zigot, després embrió, i després un nucli secundari envoltat per teixit nutritiu i uns teguments que formen una coberta protectora. Això és la llavor. Sprengel (1811) descobreix el paper dels insectes en la pol·linització.
  • Animals (En algunes espècies de difícil aparellament, un individu pot fabricar gàmetes mascle i femella. És el cas dels pòlips sèssils o alguns gasteròpodes. (A.157).
    • Esponges: Una esponja adulta mascle allibera esperma que va a parar a una altra esponja femella on fecunda un òvul. Es desenvolupa una larva que serà emportada pel corrent i que donarà lloc a una nova esponja adulta. Celenterats: Pot ser asexual, per divisió, o alternant estadis de pòlip i meduses. La medusa és l’esporòfit que produeix gàmetes ♂ i ♀ que en unir-se formen un pòlip del qual es desprenen discs que es converteixen en meduses.
    • Cucs : reproducció sexual per divisió i cicles sexuals poc coneguts encara.  Mol·luscs: hi ha reproducció sexual, en alguns cargols amb conductes de festeig que inclouen el llançament d’uns “dards de l’amor”. Són hermafrodites i l’òrgan masculí d’un fecunda el femení de l’altra i viceversa. Els cefalòpodes es reprodueixen sexualment. Conducta de competència i agressió entre mascles.
    • Artropoda. Els crustacis es reprodueixen sexualment, ocasionalment per partenogènesi. Els insectes es reprodueixen sexualment. En algunes espècies d’abelles es dóna haplodiploidia . Els mascles es desenvolupen a partir d’òvuls no fecundats i són organismes haploids, i les femelles a partir d’ous fecundats (diploids). Molts presenten un procés de metamorfosi, ja sia substituïnt l’exoesquet, o passant per fases completament diferents com les erugues que es tornen papallones.
    • Vertebrats. Peixos: la majoria tenen òrgans sexuals, testicles i ovaris, i són ovípars. Els ous són petits, una mitjana de 1mm de diàmetre i proveeixen aliment. En neixen unes larves que hauran d’alimentar-se de plàncton  durant les setmanes que té lloc la metamorfosi. Amfibis:  Els mascles fertilitzen els ous que la femella ha deixat fora a l’aigua. En surten larves adaptades al medi aquàtic, com els capgrossos. Després passen una metamorfosi que els permet estar als dos medis.  Amniotes: la resta de vertebrats estan més adaptats a la vida terrestre, gràcies a que l’embrió està protegit per tres capes, el còrion per intercanvi de gas, els al·lantoides per a les deixalles metabòliques i l’amni per protegir l’embrió. Així s’obté un medi aquòs fora de l’aigua, on pot respirar i alimentar-se. Els rèptils i les aus tenen els ous protegits per una closca o pell que els permet sobreviure fora de l’aigua. Majoritàriament no té lloc metamorfosi. En els mamífers l’embrió es desenvolupa dins de la mare, no a l’ou, i necessita ser alletat després del part.

Animals: invertebrats  /   vertebrats: Medi aquàtic peixos i amfibis, ous rèptils i ocells, mamífers sense ou


Aspectes evolutius

Dimorfisme:  El dimorfisme primari és l’adaptació dels gàmetes i dels òrgans sexuals que els fabriquen. El dimorfisme secundari és la modificació d’òrgans no sexuals. Així hi ha una variació de mida que deixa la femella més gran en mol·luscs, insectes, peixos i amfibis, i més petita en els carnívors i mamífers superiors. Varia la mobilitat, essent la femella més quieta. Es desenvolupen òrgans secundaris com les antenes de l’escarbat rinoceront, els sentits del mascle per localitzar la femella, etc.

Comportament sexual: Apareixen conductes prèvies a la fecundació que ajuda la perpetuació de l’espècie: atracció de la femella amb senyals sonors, d’olor o color (ales vistoses), lluita amb rivals, etc.
A les plantes, flors i insectes evolucionaran alhora.

Inseminació: La fecundació externa, l’esperma impregna els òvuls fora de la femella, requereix el medi aquàtic i es dóna en mol·luscs, celenterats i peixos . La fecundació interna suposa una còpula que introdueixi els espermatozous en l’organisme femení (forat davant forat en els ocells, penis en platihelmints (cucs plans), caragols, insectes i mamífers).

Cura. La reproducció es completa en els animals superiors amb una cura del nou organisme. Pot ser només dels ous (es posen en lloc protegit i prop d’aliment, granotes, escarabats, ocells) o de les cries amb subministrament d’aliment, protecció davant d’enemics i educació. (A.177) Alguns duran les cries damunt. Els embrions que no creixen a l’aigua (com els amfibis) demanen una estructura més complexa amb un entorn de desenvolupament artificial, l’ou o el ventre de la mare. En alguns cassos la cura de les cries és del grup, la “societat animal” [és que això ja seria una cultura?].


Diferenciació i creixement

De la cèl·lula individual autosuficient a la societat de cèl·lules
[Els organismes pluricel·lulars poden especialitzar les cèl·lules per fer millor algunes tasques encara que sigui al preu que la cèl·lula deixi de ser autosuficient. La cèl·lula passa a ser part i la unitat de la vida és el conjunt de cèl·lules. Les cèl·lules especialitzades no estan distribuïdes a l’atzar sinó que adopten una disposició d’acord amb la tasca que han d’acomplir. Això vol dir que formen teixits i òrgans. Cada part està al servei del conjunt i la pregunta clau és “quina funció té un òrgan determinat”? Així per exemple, si una cèl·lula té una membrana semipermeable i només sap fer alguns processos, els organismes tenen un òrgan, la boca, que condueix els aliments fins a la zona on hi ha les cèl·lules més preparades per tractar-lo, com els teixits de l’estómac i el fetge. Després un altre sistema de transport s’encarrega de conduir les matèries digerides allà on convé. L’entorn d’una cèl·lula és millorat per la col·laboració o divisió del treball fet per altres cèl·lules. En el cas dels animals, el desplaçament permet buscar-se un entorn global millor i en alguns cassos (niu ocells, home) ser capaços de crear-lo artificialment.
En principi doncs, les necessitats de les cèl·lules individuals justificarien l’existència d’òrgans la funció dels quals seria satisfer aquestes necessitats. Però un cop tenim l’organisme també hi ha el punt de vista recíproc, és a dir, que l’existència de les cèl·lules està justificada per la seva aportació al funcionament del conjunt.
[La vida va començar a “veure” i a “pensar” per poder menjar millor. Ara mengem per pensar o contemplar.]

Un organisme no és una impressió dels plànols de DNA
[Encara no entenem del tot la influència de l’entorn de cèl·lula pel que fa al desenvolupament de l’organisme o dels teixits. Semblava que un cop desxifrat el genoma, i identificades les cèl·lules mare (stem cells), podríem “editar” els “motlles” de la vida per eliminar malalties, o millorar-nos. O bé podríem fabricar nous organismes i teixits a partir de les cèl·lules mare. Res d’això ha passat.]
Malgrat els anuncis de cures miraculoses a partir de cèl·lules mare, o la possibilitat d’obtenir embrions a partir de qualsevol cèl·lula del cos (NewYorker), el cert és que 25 anys després no hi ha cap tractament basat en les cèl·lules mare (Technology review).
Arguments de Alfonso Martinez Arias sobre la importància de la cèl·lula per damunt del determinisme dels gens: Cells not DNA are the master architects of life. The Case against the selfish gene:
En contra de la visió determinista que un organisme està totalment definit pel DNA, l’estudi de l’epigenètica revela que les condicions del voltant tenen un paper molt important a l’hora de determinar quins gens s’expressen. Només un 2% del genoma està dedicat a codificar proteïnes mentre que la resta, el que s’anomena “genome dark matter” estaria dedicat a regular l’anterior (BBC).

Diferenciació de cèl·lules vegetals, vacúols i paret.
Les cèl·lules comencen el creixement amb una fase embrionària normal. L’especialització comença quan entra aigua i vesícules petites s’uneixen per formar un gran vacúol que ho ocupa gairebé tot i desplaça el citoplasma. Acostuma a guardar reserves com sucres o principalment midó i en alguns cassos alcaloides com cafeïna, nicotina, estricnina i pigments. L’alteració de la paret està relacionada amb la formació del vacúol i consisteix en un augment de gruix acompanyat a vegades de lignificació, les cèl·lules seguiran sostenint un cop mortes, suberificació,impermeabilització amb suro o mineralització (fulles de gramínies).

Formes
(A.79) Es classifiquen en isiodiamàetriques o arrodonides (parènquima, epidermis, pètrees de les closques i pinyols, glangulars segregadores de resina i similars) i prosenquimàtiques o allargades (tubs, pels o tricomes, colènquima amb capes de celulosa i pectina per al sosteniment, fibroses de l’esclerenquima i traqueides per a la conducció de l’aigua). Aquestes darreres a vegades es fusionen formant vasos.

Teixits

  • Parènquima o teixit fonamental. Assimilador de clorofil·la a les fulles amb els cloroplats. Teixit de reserva on s’acumulen sucres, proteïnes, midó, aigua. Revestiment amb l’epidermis aïllant i protectora, els pèls absorbents de les arrels que s’adapten al terra i amb membrana prima per a l’absorció, i els estomes que, situats a la part inferior de les fulles asseguren el bescanvi de gasos. [I el teixit de la tija?] El suro i la crosta són un meristema secundari que es genera quan la protecció de l’epidermis és insuficient. [El parènquima no es reproduiria, només els extrems amb meristema].
  • Meristema o teixit de creixement. Hi ha unes cèl·lules apicals que es van dividint creixent en una o vàries direccions tot generant el teixit. Als talòfits és única mentre que als espermatòfits n’hi ha diversos grups [diferents borrons de les branques].

Òrgans

  • Tija. Medul·la amb xilema (arrel → fulles), cèl. mortes, càmbium (meristema de creixement), floema (fulles → arrels), crosta. Funció de suport a les fulles per fotosíntesi i transport d’aigua i altres substàncies. Té una zona inicial embrionària [borró], una una sèrie de nusos i entrenusos de determinació des d’on es formen les fulles i una altra de diferenciació on es forma l’estructura interna. Aquesta estructura consta de crosta i medul·la. Dins la medul·la [teixit fibrós, esclerènquima] hi ha diversos tubs conductors disposats en un cercle perifèric a les dicotiledònies i uniformement a les monocotiledònies. Cada tub té un part dirigida a l’exterior, el xilema llenyós amb un teixit de traqueides que condueix aigua i sals nutritives de les arrels a les fulles (alguns arbres hi fan passar 200 litres/dia), una part intermitja dita cambium i una part dirigida a l’interior, el floema per on passen, molt més lentament, substàncies orgàniques de les fulles cap a les arrels. El càmbium és un teixit de creixement (meristema) que en les dicotiledònies permet un creixement secundari de gruix. Els diferents ritmes de creixement segons l’estació de l’any es noten en els anells anuals que es veuen en tallar un arbre. A dins queda la llenya morta amb traqueides pel transport d’aigua i fora el floema.
  • Arrel. Teixit de conducció (xilema i floema) amb superfície porosa per absorció d’aigua. No té nusos. El con vegetatiu [punta de creixement] va protegit per una caliptra que s’enfonsa a terra.
  • Fulla. Teixit amb cloroplasts, parènquima assimilador per fotosíntesi a dalt, parènquima amb estomes per la respiració de CO2 i O2. llimb foliar sostingut per pecíol amb una base foliar unida a la tija. Està recorregut per una xarxa de canals conductors (nervis) reticulada a les dicotiledònies i paral·lela a les monocotiledònies.

Tipus fonamentals de vegetals
El principi general de formació de les plantes és la formació de grans superfícies d’acord amb el seu autotrofisme. Amb els animals passarà el contrari. Les diferents formes en que es poden disposar els tres òrgans [diferents solucions als problemes de la vida vegetal], així com les adaptacions a determinades funcions, metamorfosi, permeten classificar-los. Els tal·lòfits no tenen òrgans mentre que els cormòfits s’estructuren en arrel, tija i fulles. (A.113).

  • Tal·lòfits: algues. líquens, briòfites (molses)
  • Cormòfits o plantes vasculars: Pteridòfits sense flor, gimnospermes, angiospermes.
  • Tipus de fulles, filotàxia (disposició de les fulles). Quan a cada nus de la tija hi ha més d’una fulla, normalment parelles enfrontades, diem que és una disposició verticil·lada. El nombre de fulles per nus i l’angle amb la tija són fixes per a cada espècie. En la disposició alternada només hi ha una fulla per nus. Les fulles presenten adaptacions com cotiledons (sovint funció de reserva), vegetatives o nomòfiles (assimiladores), florals o antòfiles (reproducció). Adaptacions menys freqüents són les fulles de captura de les plantes carnívores, les espines, les carnoses (suculentes) i circells per enfilar-se (pèsol). (A.123) L’alteració en flor més simple és la bràctea (flor petita), Als pteridòfits es troba en forma d’esporòfit, a les gimnospermes són poc vistoses i a les angiospermes presenten gran varietat i color. En una flor hi ha: i) Periant amb sèpals (calze) i els pètals (corol·la). Acostumen a estar acolorits per atraure els insectes que repartiran el pol·len, ii) Androceu conjunt d’estams amb sacs de pol·len que també procedeixen de fulles (nenúfar com a forma transitòria) iii) Gineceu conjunt de carpels ajuntat que conté els ovaris amb substància enganxosa per captar el pol.len.
  • Tipus de tija. Als tal·lòfits i les licopodials (pteridòfits) hi ha ramificació dicòtoma, la tija es va dividint en dos. A la resta hi ha ramificació lateral. A les angiospermes totes les fulles porten un borró lateral mentre que a les gimnospermes només el tenen algunes fulles. No tots arriben a desenrotllar-se. En general les herbàcies estan poc ramificades i les llenyoses ho estan força. La relació de les branques amb la tija principal s’anomena monopodial si les branques laterals són més petites que la principal, que aleshores queda formant un eix (coníferes). En cas contrari, com les liles o marduix, la relació. és simpodial. La tija també es transforma per acumular reserves com en les cebes i els bulbs (tija engruixida i subterrània), els rizomes, els tubercles, dits caulinars quan es formen a la tija, com la patata, tiges suculentes que guarden aigua (cactus), estolons de creixement horitzontal i espines, circells a les trepadores.
  • Tipus d’arrels. Tenen una estructura similar a la tija i presenten metamorfosi en arrels acumuladores de reserves com les napiformes (pastanaga) o tubercles, tuberosos quan són a les arrels, com en les orquídies o moniatos, metamorfosi en arrels aèries com en les plantes enfiladisses (arrels adventícies), tiges suculentes (cactus).

Animals

Tipus de cèl·lula
Hi ha unes cèl·lules germinals capaces de reproduir-se i perpetuar l’espècie [les que fabriquen espermatozous i òvuls?] i les somàtiques que moren i es regeneren. A mesura que van creixent es van transformant en part per elles mateixes i en part per la influència mecànica i química de les cèl·lules veïnes. Tenim cèl·lules lliures a la sang (plasmòcits, leucòcits, trombòcits (plaquetes), i glòbuls rojos),  el teixit connectiu (histiòcits) i que envolta els teixits de revestiment, conjuntiu, muscular i nerviós [amb els seus tipus de cèl·lules, ¿on són les digetsives i glandulars?].

Teixits animals
Tots els eumetazous comencen com a embrions amb una capa o fulla embrionària externa o ectoderma, una interna o endoderma i la zona intermitja, el mesoderma. Aquestes fulles embrionàries donen lloc a quatre tipus de teixits:

  • Revestiment o teixit epitelial, barreja de les tres fulles, que forma una capa contínua de diferents estratificacions i que es pot diferenciar per formar l’esquelet dels artròpodes, la pell, les superfícies dels òrgans interns i les diverses glàndules (A.87-89).
  • Conjuntiu i de suport. Originat a partir del mesoderma. Aquí juga un paper important la substància intercel·lular segregada. D’una banda hi ha el teixit conjuntiu que es troba a l’interior del cos, recobert per epiteli, i una substància intercel·lular formada per (i) una substància fonamental inflable amb més o menys aigua juntament amb proteïnes, (ii) uns elements de suport i rigidesa que són fibres de col·lagen. També hi ha cèl·lules lliures. (A.91). Hi ha el teixit conjuntiu embrionari que serveix d’entorn als òrgans de formació i els vasos, el reticular, l’adipós amb funcions de reserva i coixí i el fibrós (sobretot als vertebrats).
    El teixit de suport es caracteritza per una substància intercel·lular més resistent. Els cartílags (invertebrats i peixos) tenen fibres elàstiques i de col·lagen. Els ossos estan formats per osteòcits generats per osteoblastos (formadors d’ossos) amb uns substància interior formada sobretot per Ca que es va mineralitzant.
  • Muscular. Mesoderma. Capacitat de contracció ( anabolisme). Té cèl·lules musculars llises i allargades d’uns 0.1 mm que mantenen una tensió constant a alguns òrgans com les vísceres o les partes dels vasos als vertebrats. A d’altres òrgans hi ha fibres estriades de cm de llarg, originades per fusió de cèl.lules, amb un sarcoplasma (citoplasma muscular) i miofibril·les (filaments que es contrauen).
  • Nerviós. Procedeix de l’ectoderma i té la funció de captar estímuls i conduir-los. Es troben a tots els eumetazous [de les esponges en endavant]. Les neurones estan formades per un cos, àxon (eix llarg que pot arribar a tenir 1m) i les dendrites (connexions amb altres neurones properes). Presenten diferents tipus de prolongacions, monopolars (mucosa olfactiva i retina dels vertebrats), bipolars (ganglis dels peixos, cons i bastonets dels vertebrats) i multipolars (vertebrats superiors). Hi ha una prolongació principal, la neurita (1m en el nervi ciàtic de l’home) que neix del citoplasma i les dentrites. Les prolongacions consten d’un eix que transmet estímuls elèctro-químics aïllats per una beina de mielina. Les fibres nervioses s’uneixen en feixos que constitueixen nervis.

Òrgans dels animals

  • Pell. Epidermis (ectodèrmica), pigmentada segons l’exposició a la llum, alimentada per la limfa. La dermis és un teixit conjuntiu mesodèrmic. Com a formacions especials tenim pels, escates, plomes, ungles, unglots etc.
  • Sistema respiratori. Capta aire per les foses nasals i passa per faringe, tràquea, arbre bronquial recobert per la pleura que acaba en uns bronquiols on a través dels alveols es fa l’intercanvi gasós amb la sang [això evita que cada cèl·lula hagi d’estar en contacte amb l’aire, ja li porta la sang]. Brànquies.
  • Esquelet. Ossos i articulacions
  • Muscular
  • Sistema digestiu. Cavitat bucal on es trituren i amassen els aliments amb la llengua, les dents i la saliva. El resultat passa a l’esòfag per on arriba a l’estómac, dilatació del tub digestiu amb 4 106 cèl. que produeixen 2 l. de sucs gàstrics al dia tot amassant una polpa que surt per l’esfínter cap a l’intestí prim de 6 m de llarg. El primer tros s’anomena duodè i es connecta al fetge, la glàndula més important de l’home que segrega 0.5 l de bilis al dia, emmagatzemada a la vesícula biliar. També es connecta al pàncrees (0.7l/dia de suc pancreàtic). Segueix l’intestí prim fins que arriba al gruixut i l’anus.
  • Sistema excretor. Els ronyons eliminen els productes del metabolisme amb 106 corpuscles renals, les glàndules suprarenals i esl converteixen en orina que passa pels uréters fins a la veixiga.
  • Sistema sanguini. El transport als diferents òrgans es fa en vasos tancats en els vertebrats i obert en els insectes. El flux és impulsat pel cor en dues direccions independents: circulació corporal o major (sang amb O2 dels pulmons al cos), per les artèries que desemboquen en capil·lars que buiden els líquids als teixits. Allà són transportats per la limfa que els retorna bruts a la circulació pulmonar o menor (sang bruta del cos als pulmons) per les venes.
  • Sistema immune. Conjunt de limfòcits segregats pel tim i melsa, amb macromolècules, immunoglobulines identificadores de substàncies. Autoregulades per rebutjar les externes (defensa), identitat somàtica. Capaces d’aprenentatge.  És la segona xarxa de transport. Retorna a la sang el plasma que surt dels cpail·Lars sanguines a causa de la pressió. Transporta els greixos absorbits a l’intestí, evitant així que arribin massa concentrats al cor. Produeix anticossos, limfòcits, als ganglis limfàtics es generen limfòcits. [ Varela li dóna molta importància a “Pensar la Complexitat”. Ve a ser un sistema d’identitat molecular el cos. Els receptors identifiquen molècules constituint “classes d’equivalència”. Els humans en tindríem unes 108 diferents. Els limfòcits tenen una funció de defensa, abracen les molècules estranyes i les expulsen del cos. Formen una xarxa complexa de relacions de manera que les concentracions dels nocius acabin essent insignificants i només quedin els actius. Aquesta xarxa constitueix una “identitat somàtica” o molecular de l’organisme. És capaç d’aprenentatge. La història del cos hi queda reflectida. Aquesta part que respon als atacs exteriors és el 85-90%. Un 20% dels linfocits es renova cada dia, de manera que la xarxa es regula molt ràpidament.
  • Sistema nerviós. A part de les coordinacions de cilis que trobem als paramecis, el primer sistema nerviós és el dels celenterats, en forma reticular, xarxa homogènea on les parts conserven una independència total. Als cucs plans la xarxa ja s’ha estructurat en forma d’escala, amb ganglis on arriben neurones aferents, eferents i d’interconnexió. Als mol·luscs i artròpodes el sistema nerviós ganglionar desenvoluparà una mena de cervell a partir d’un gangli. El sistema nerviós està disposat al llarg del tub digestiu i els segments encara són independents respecte del cervell, així el mascle de la mantis segueix copulant encara que se li hagi arrencat el cap. En els cordats ja no seguirà al tub digestiu i s’allotjarà al notocordi que més tard serà la medul·la espinal a l’extrem de la qual el crani contindrà el cervell.
    i) El sistema cerebroespinal consta de l’encèfal (ganglis, crosta amb substància gris que té 15 109 de cèl.lules i la mèdula espinal, fibres nervioses (500000 km en l’home), el cervell intermig on el tàlam connecta les terminals nervioses amb la costra i l’hipotàlem que regula el sistema nerviós autònom. També hi ha el cervell mig, el cerebelo i el bulb raquidi. A la mèdula espinal hi arriben i en surten les terminals nervioses (31 parells de nervis raquidis).
    ii) El sistema nerviós autònom o vegetatiu que consta del sistema simpàtic (fibres connectades a una xarxa de ganglis) i el parasimpàtic (el contrari)
    iii) Sistema nerviós intramural format per xarxes perifèriques independents.
    Organs dels sentits.
  • Sistema reproductor. Organs primàriament destinats a la producció de cèl·lules germinals (testicles i ovaris) i per tant englobables en l’endocrí i també amb la funció de permetre la fecundació (còpula, penis, vagina) i d’altres aspectes de la conducta sexual.
  • Sistema endocrí: Glàndules segregadores de substàncies amb funcions de regulació de concentració de sucre, sistema immune, conducta sexual, etc.

Tipus fonamentals d’animal
[(1)Celenterats i cucs.  (2) Animals tous que poden modificar la forma, mol·luscs com calamars i cargols. (3) Articulats amb esquelet exterior, crustacis, insectes (4) Amb esquelet interior, vertebrats.]

  • Celenterats. (A.125) ). Simetria radial [medi aquàtic], dues fulles embrionàries, tub amb endoderma de cèl·lules digestives, glandulars i musculars, ectoderma de cèl. sensorials, epitelials i nervioses. El tub té un únic orifici d’entrada i sortida envoltat de tentacles. Les cèl·lules reproductores estan distribuïdes per les dues capes. La simetria bilateral en lloc de la radial es deu a la locomoció orientada. Hi ha un pol locomotor, un pol sensorial i un pol nutritiu (orifici bucal). D’ara endavant hi haurà una tercera fulla embrionària, el mesoderma.
  • Cucs
    Cucs plans (A.127) Entre l’ectoderma i l’endoderma hi ha un mesènquima format a partir del tercer full, on hi ha els òrgans interns, tenen un sistema nerviós ganglionar. L’intestí és un sac cec en els Plathelmintes i un tub en els Nemathelmintes. En els P. els òrgans sexuals són hermafrodites (penis, testicles i ovaris). [òrgans interns, sexualitat] Ex. ascaris.
    Cucs segmentats (A.129) Tenen un cos cilíndric dividit en segments semblants. Hi ha una epidermis recoberta de cutícula, una túnica muscular, un intestí de punta a punta, una cavitat secundària [la primària era la simple bossa amb ectoderma fora i endoderma a dins, ara hi ha entre els dos una altra cavitat], el celoma, amb parets del mesoderma que ve de la tercera fulla que conté els òrgans. Hi ha un sistema de vasos sanguinis. Reproducció hermafrodita [celoma, sistema sanguini]. Ex. cuc de terra
  • Artròpodes (A.131) Tenen una estructura semblant a la dels anèl·lids (cucs segmentats). Els crustacis tenen tres segments: cap, tòrax i abdomen. Les extremitats de cada segment s’han especialitzat. Al cap hi ha antenes, mandíbules i maxil·les. Al tòrax cames i a l’abdomen s’han atrofiat. Intestí, òrgans genitals, òrgans excretors, cor, sistema nerviós en escala de corda. Els aràcnids tenen junt cap i tòrax. Els insectes tenen un cap amb antenes, un tórax amb tres segments soldats d’on surten potes i ales (expansió laminar cutànea, no ve d’una pota).
  • Mol·luscs (A.135) No tenen el cos segmentat sinó massís amb quatre parts: el cap amb òrgans sensorials i cavitat bucal, el peu, muscle per reptar, nedar, convertit en tentacles en els cefalòpodes, sac visceral (vísceres) i plec del mantell on desemboquen l’intestí, ronyons i òrgans reproductors. Damunt del sac i el plec es forma la closca en anells successius. Els bivalves i cefalòpodes (petxines i pops) respiren per brànquies mentre que alguns gasteròpodes (caragols) ho fan ja amb pulmons. Òrgans excretors i òrgans genitals sovint hermafrodites.
  • Equinoderms (A.137) Tenen una simetria radial (secundària, que deriva d’una bilateral observada en les larves, no primària com els celenterats) amb una cara oral i una altra apical (Eriçó i estrella de mar). Tenen un esquelet calcari derivat del mesènquima i un sistema vascular acuós (s.ambulacral).
  • Vertebrats (A.139) En el més simple dels cordats, l’amfiox, s’observa per primera vegada el notocordi o corda dorsal, òrgan de sosteniment damunt del qual hi ha un tub neural (sistema nerviós central) i una aleta contínua. Té intestí, sistema circulatori tancat sense cor, una cavitat general envoltada de mesoderma que ve del celoma, i òrgans reproductors. En els vertebrats superiors, a la corda dorsal s’hi afegirà un esquelet axial amb un crani on s’allotjaran cervell i boca així com els ossos de les orelles (primer cartilaginós als taurons i amb una progressiva ossificació) i unes extremitats (dos parells → tetràpodes) derivades de les aletes inferiors dels peixos (A.138 B) on els radis de l’eix evolucionen fins a l’estructura d’húmer (fèmur), radio+cúbito (tíbia+peroné), carp de nou ossos (tars), metacarp i cinc dits (extremitat pentadàctil). El sistema circulatori dels peixos té un cor que impulsa sang a 5 artèries branquials. Els arcs branquials van desapareixent, els amfibis en tenen 3, els rèptils 2 mentre que aus i mamífers només en conserven la meitat d’una.

Creixement

Procés de l’organisme des de la cèl·lula embrionària fins a la forma adulta per assimilació de nutrients amb duplicació organitzada de cèl·lules, fins a l’envelliment i mort. Forma tancada als animals i forma oberta en plantes. L’envelliment (A.473) es produeix per mutació somàtica, acumulació d’enzims inactius que no s’eliminen i deficiència creixent dels processos de reparació, transcripció i traducció del DNA.

El procés de creixement va de l’òvul fecundat fins a l’organisme adult, generant per mitosi (teixit meristema en plantes, cèl·lules germinals en animals), un conjunt de cèl·lules  somàtiques diferenciades que formen un teixit i s’organitzen en òrgans que duen a terme certes funcions. Es produeix una diversitat perceptible (ROUX).

Els metazous passen per una etapa embrionària on els òrgans ja estan esbossats, una etapa juvenil i una etapa adulta. Cada etapa està rigorosament determinada i dirigida a un estat adult propi de l’espècie. Diem que té una “forma tancada” [causa final d’Aristòtil]. En canvi a les plantes el nombre d’arrels, branques i fulles no està determinat a l’embrió, havent-n’hi molts més en l’adult que a més té les flors com a òrgan nou. Diem que és una forma “oberta”.  Un desenrotllament determinat no és conseqüència directa de l’herència genètica. Aquesta només dóna unes possibilitats de desenvolupament sota unes condicions concretes [condicions que a vegades garantirà l’organisme pare].

Creixement de Microorganismes
Morfogènesi d’una colònia d’amebes. Alguns com el ficomicete Saprolegnia tenen un desenrotllament obert, això és, que creix de diferent manera segons si està damunt la terra o a l’aigua, o segons si la temperatura és alta o baixa. El desenvolupament tancat es dóna en algues verdes com l’acetabulària que mostra un rizoide basal i un barret, una diferenciació que es deu a un gradient de polaritat (substàncies que van cap amunt o avall). Té una capacitat de regeneració extraordinària.
L’adquisició d’una forma determinada segueix uns principis encara no del tot coneguts i que es poden estudiar en una colònia d’amebes: i) Agregació i contacte cèl·lular. Una cèl·lula fundadora atrau les altres amb el senyal químic acrasina, senyal que repeteixen al seu torn les cèl·lules afegides. ii) Moviment morfogenètic: El moviment en una direcció determinada atrau cèl·lules i determina una estructura [direcció de creixement] iii) Significat futur: la posició inicial de les cèl·lules es conserva i per tant es correspon amb l’òrgan futur. iv) Regulació: una part es pot separar de l’evolució prevista en benefici del conjunt. v) Camp d’autoregulació

Creixement de Metazous
Desenvolupament tancat amb òrgans a l’ovocèl·lula, o obert i regulat per ambient. Ontogènesi. Diferenciació cel·lular per regulació transcripció).
(Polaritat), ou → Segmentació: blàstula → gastrulació: 2 fulls embrionaris endoerma i ectoderma → mesoderm: 3er full → organogènesi: òrgans
El desenrotllament d’un individu (ontogènesi) passa per una fase embrionària (fins que té vida autònoma), juvenil (normal o amb metamorfosi), adulta (maduresa sexual) i la decadència senil. Segons les espècies el període més llarg pot ser el juvenil (larves cigarres) o l’adult (aus i mamífers). Les cèl·lules dels diferents teixits mostren proteïnes i enzims específics havent estat codificades per uns gens que procedeixen per mitosi d’una cèl·lula única. Aquesta diferenciació no s’explica per una alteració del DNA al llarg del creixement (s’ha vist que el DNA d’una cèl·lula somàtica és totipotent i transplantada a un ou torna a poder generar l’organisme sencer) sinó que es deu a diferències en la transcripció DNA → mRNA [regulada externament?].

  • Polaritat de cèl·lula germinal
    La primera determinació de les cèl·lules germinals és una polaritat (A.187) [direcció diferenciada?] manifestada com a estats diferents en els extrems de l’òvul, estructura o gradient de concentració. Aquesta polaritat es pot atribuir a factors ambientals, propietats moleculars o influència dels teixits circumdants (úter als mamífers). L’organització inicial de l’ovocèl·lula  pot ser de mosaic amb els òrgans ja esbossats i preformats que tindran un desenvolupament rígid, o de regulació en que només hi ha uns factors que es diferenciaran en començar la segmentació.
  • Segmentació de l’ou fins arribar a una blàstula (ectoderma)
    La segmentació consisteix en unes mitosis que divideixen l’òvul fecundat en uns blastòmers fins que formen una blàstula (ectoderma) amb cèl·lules més riques en DNA respecte del citoplasma. La forma de la blàstula depèn de la quantitat de vitel inicial (rodó, disc, etc.)
  • Gastrulació.(invaginació) de la blàstula
    Es genera un segon full a l’interior, l’endoderma, ja sia per invaginació o migració de manera que queda una cavitat (tub digestiu) amb un orifici (blastòpor).
  • Mesoderma
    Els celenterats es queden amb dos fulls mentre que en els celomats apareix una capa entre l’ectoderma i l’endoderma, el mesoderma. El blastòpor queda com a entrada de l’intestí als gastroneuralia o protòstoms [1a boca (mol.luscs, annèlids, insectes)] desenvolupant un anus secundàriament, mentre que els notoneuralia o deuteròstoms [2ona boca (vertebrats)] desenvolupen una segona boca i el blastòpor queda com a anus. Del mesoderma en sortiran les cavitats celomàtiques (esquelet, muscles, circulació).
  • Organogènesi a partir dels tres fulls embrionaris.
    i) Ectoderma: epidermis, closques, inici i fi del tub intestinal, cèl·lules sensorials (ulls, nervis). [exterior]
    ii) Mesoderma: teixit conjuntiu i de sosteniment, musculatura, vasos sanguinis, ronyons. [sosteniment i auxiliar]
    iii) Endoderma: intestí, notocorda, pulmó, brànquies, glàndules [dins]. Eriçó (polaritat animal(ecto) i vegetativa (endo).
  • Neurula, notocorda i nervi
    En els primer cordats com l’amfíox, el contacte entre endoderma i ectoderma provoca l’esbós de notocorda i nervi respectivament formant-se una neurula. En els amfibis s’ha pogut comprovar que els blastòmers (primeres cèl·lules dividides) ja tenen una predisposició (autodiferenciació) a convertir-se en uns òrgans en contra de la hipòtesi d’un zigot totalment uniforme (experiments per cultius aïllats i transplantament).
  • Ous
    Aus i rèptils (A.207) [ou amb aliment, gran quantitat de vitel, els mamífers no en necessitaran tant perquè amb l’úter tindran un mecanisme mitjançant el qual la mare els traspassarà aliment]. Als mamífers l’ou es fixa a la cavitat uterina i s’estableixen unes relacions entre els dos teixits formant-se la placenta.

Factors interns de creixement

El creixement de les plantes està regulat per factors interns com la polaritat (branques dalt i arrels a baix) determinació i correlació (influència d’unes cèl·lules sobre les veïnes forçant-les a un tipus determinat).[animals? per arribar a la forma tancada?]

Factors externs de creixement
[Ja tenim l’individu reproduït i creixent. Abans de considerar els processos que fa com són el metabolisme, els sentits i el moviment, cal considerar el sistema organisme-entorn: l’ecologia].

  • Plantes
    Com a forma oberta la planta depèn molt dels factors ambientals com terra, aigua, sals nutritives, CO2, O2, gravetat, temperatura i principalment la llum (A.219). Així, les branques enterrades donaran arrels o tubercles, mentre que les fulles i tiges s’orienten a la llum, etc. La dependència de les plantes respecte de l’entorn és molt gran degut a que en ser autòtrofes depenen de l’oferta de substàncies inorgàniques (terra i clima) i no es poden traslladar per trobar condicions millors. L’aigua és el factor que sovint està més escàs i determina la distribució geogràfica de les plantes. Les poiquilohidres (bactèries, fongs, líquens) no en necessiten gaire i tenen vacúols petits mentre que les homeohidres (majoria de les plantes terrestres) en necessiten força per la qual cosa tenen un sistema radicular absorbent molt eficaç, una cutícula que frena la transpiració i grans vacuoles. El terra conté les sals minerals i l’aigua necessària. La intensitat de llum és proporcional a la fotosíntesi (fins que arriba a un valor estacionari). La longitud d’ona també té un paper important (la UV inhibeix el creixement de bacteris i per això hi ha sanatoris per malalts de pulmó a l’alta muntanya). Cada planta té una temperatura òptima per desenrotllar-se i un àmbit en que resisteix. Poden anar dels 0º C d’alguns bacteris als 45º de plantes del desert, havent-hi resistència entre -60º i 89º C. CO2 també influeix havent-hi normalment una concentració baixa.
  • Animals. En ser una forma tancada estan menys influïts però també presenten diferenciacions davant la temperatura (color de la pells de conills i guineus), l’abundància d’aliments, etc. Els desplaçaments que fan degut a l’entorn s’anomenen efecte direccional i poden anar des d’encongir un tentacle en un pòlip, a petits desplaçaments, fins a la captura d’una presa que dista km per part d’un voltor o les migracions. Una mateixa espècie s’adapta a diferents entorns per l’efecte modificador. Així els animals són més grans en temperatures baixes (regla Bergman), amb extreminats proporcionalment més petites a temperatures baixes (r.Allen) [bola], un percentatge de pes de cor més gran, una major pigmentació en estar en un clima càlid, etc.

[L’altra gran adaptació de les espècies serà la vida col·lectiva que permeti la divisió del treball. [La comunitat animal és u antecedent de la cultura?]. Es com si l’organisme es creés el seu propi entorn.]


Nombre de cèl·lules als organismes

  • Medusa: 103 a 106
  • Mosca: 105
  • Cargol: 104 a 105
  • Pop: 106 a 1012
  • Peix vermell: 1013
  • Llargandaix: 106 a 1012
  • Oreneta: 1013
  • Ratolí: 40-60 1018
  • Gat: 50-70 1018
  • Ësser humà: 30-40 1018
  • Molsa: 103 a 106
  • Falgueres: 106 a 1012
  • Pins: 1012 a 1018
  • Roser: 106 a 1012

La vida que trobem al voltant

La vida    |    Llista d’espècies     |    Arbre de la vida


Ens trobem en un món ple de vida, tenim plantes a casa, gossos, gats, coloms, mosques que molesten, arbres a les voreres i als parcs. Quan sortim trobem camps de conreu, boscos a les muntanyes, peixos al mar. Nosaltres mateixos som un organisme viu, que es nodreix de pa i arròs, fruita i verdura, carn i peix que comprem als supermercats, resultat de l’agricultura i ramaderia.

Si anem d’excursió i explorem el territori trobarem diferents hàbitats, els anomenats antròpics, explotacions agrícoles, pobles i ciutats, i “salvatges”, boscos, arbustos, prats, aiguamolls, aigües dolces i el mar.
Si viatgem pel món quines noves plantes i animals trobem?

Quina ha estat la meva experiència? Quins llocs he conegut? Quins paisatges i animals he vist? Els 7 hàbitats  bàsics,  fred, temperat amb boscos, muntanya, rius i els llacs, els deserts, els tròpicsmars i costes, es poden caracteritzar en detall fins a uns 600 tipus segons la BD Corinne. Al món hi trobem 867 ecoregions de 15 biomes diferents. Mapa de vegetació de Catalunya.
També trobem fòssils que semblen correspondre a espècies que ja no existeixen. [museuet].

Ho recollim en museus de ciències naturals, herbaris, zoològics, jardins botànics.

1 Eucariotes2 Plantes  |   3 Metazous  |   4 Protostomes   |   5 Deuterostomes
| 6 Tetrapodes7 Sauris    Avials8 Mamifers  |  9 Teris  |  10 Primats


Fongs. Llevat, floridures, bolets a Solius. [Diferents d’animals i de plantes, organismes que han desenvolupat la capacitat de processar matèria orgànica no viva, components sobres de processos d’altres organismes, com les arrels dels pins,  fermentació]. Devònic 400 Ma Arbre de la vida


[fotosíntesi: estratègia de vida d’obtenir energia de la llum, i a partir de CO2 i aigua, construir estructures ]
[ reproducció per espores, cèl·lula que pot donar lloc a un nou organisme (generació 1), un gametòfit masculí o femení que es fusionaran en un zigot que creixerà fins a formar un nou esporofit (generació 2)]

Algues. El verdet de la bassa a la terrassa. Algues a la costa Brava o l’estany de Banyoles. [ Molt properes als prototozous, amb qui formen els grup dels Protists, són les primeres agrupacions de cèl·lules que poden dur a terme la fotosíntesi]. Els seus antecessors, les cianofícees també anomenades algues blaves, van canviar la composició de l’atmosfera. Precàmbric > 1000Ma Arbre de la vida

[les plantes colonitzen la terra]

Molses: El bosc de Solius, els rierols del Pirineu, els jardins japonesos, el tangram a la terrassa. [ La vida vegetal comença a colonitzar la terra. No han desenvolupat un sistema vascular i per això no es poden aixecar gaire de terra]. P.Devònic 400Ma. Arbre de la vida

[sistema vascular]

Falgueres : que trobo als racons ombrívols i humits a les excursions i que tinc al tangram de la terrassa. Pteridòfits. Primeres plantes vasculars. Devònic 400 Ma Arbre de la vida

[ reproducció per llavors, en lloc d’una espora sense res, un embrió envoltat d’aliment  i protegit per una membrana].

Coníferes: Els pins de Solius, els avets i pins negres d’alta muntanya, les coníferes en miniatura del tangram, els gingkos de la terrassa, els xiprers dels cementiris. Gimnospermes Apareixen al Devonià 400mA i predominen al Carbonífer 330mA. Arbre de la vida.

[plantes amb flor, òrgans masculins, estams, i femenins, pistil carpels, envoltats de pètals i sèpals que els protegeixen. Així hi pot haver reproducció sexual al mateix lloc alhora que en col·laboració amb els insectes s’optimitza la difusió]

Plantes amb flor: Angiospermes. A la terrassa, dent de lleó, malves, espígol, roselles, llimoner, ametller. Apareixen al Cretàcic, 145Ma. Arbre de la vida. 40 ordres amb 462 famílies.

    • Angiospermes basals, nenúfars
    • Monocotiledònies (Liliòpsides), lliris,gramínies
    • Dicotiledònies (Magnoliòpsida)

[els sistemes de classificació de les famílies van canviant cada pocs anys]


GUIES: Bolets. Orquídies. Plantes aromàtiques. Plantes fruiteres. Varietats de vinya i olivera. Hortalisses, fruits i tubercles.


Meduses : grans meduses blaves que veig en caiac o marrons que m’han picat a la platja, coralls a Tailàndia i al mar roig. Crec que no he vist mai esponges al natural però en venen a les drogueries per netejar-se.
[Tenen una simetria radial, com un sac obert. A partir d’aquí comencen els organismes amb simetria bilateral, organitzats com un tub, amb boca i anus. Els protòstoms formen primer la boca, no tindran esquelet, insectes, crustacis, mol·luscs i cucs. Els deutoròstoms formen primer l’anus, equinoderms i tots els vertebrats amb esquelet]

Cucs: els cucs de terra que em remouen la terra a la terrassa. No he tingut contacte amb cucs plans o nematodes.

Mol·luscs, cargols a la terrassa i al camp (aquàtic a la bassa), petxines al mar i la peixateria, pops i calamars a la peixateria i una vegada a la platja.

Crustacis, crancs, els petits que corrien a Cala Rovira, els “porquets de Sant Antoni” que fan una bola quan se senten amenaçats. Els que compro, gambes i llagostins.

Aranyes, algun escorpí que havia caçat,  les fines de potes llargues que corrien als baixos de Solius, les peludes, petites que corren per Aymà.
Insectes que caçava quan era un noi i volia classificar, les formigues, mosques i mosquits que tinc a casa, les abelles, abella fustera i papallones que visiten la terrassa. (concurs fotos bbc).
Miriàpodes (cent peus).

GUIES: Invertebrats marins. Mol·luscs. Libèl·lules i espiadimonis.


Equinoderms: Estrelles i eriçons de mar, que he vist a la costa brava.

[Adquisició d’un eix de suport o notocorda, un crani per acollir el cervell i un esquelet amb columna vertebral, mandíbula] [reproducció per ous]

Peixos: els que tinc a la bassa de la terrassa, els que trobo al Bogatell  i la Costa Brava, més exòtics a les aigües càlides del Mar roig i Tailàndia. Els que compro a la peixateria: verat, salmó, sardina, orada, llobarro, llenguado, rap, turbot, bacallà.

[peixos pulmonats, pas a la vida terrestre, metamorfosi dels amfibis, encara depenen d’un medi aquàtic per reproduir-se, passen a terra quan són més grans]

Amfibis: Gripaus i caps grossos que pretenia tenir a casa als dotze anys, alguna salamandra preciosa, a Solius. Més granotes i gripaus a les excursions.

[Amniotes (rèptils, aus  mamífers), amb una membrana al voltant de l’embrió que permet reproducció sense dependre de l’aigua, apareixen al carbonífer. Els sinàpsids, antecessors dels mamífers, tenen un sol forat rere l’ull per acollir un múscul de la mandíbula, els diàpsids (rèptils, dinosaures, aus) en tenen dos.][ en passar a terra es desenvolupa més l’olfacte]

Rèptils: Quan era un noi, sargantanes i serps (una que vaig dur a casa), una vegada un llargandaix de 40 cm, a Aymà, dragons. A Etiòpia cocodrils, al zoo, serps i cocodrils.

Aus: les orenetes que arriben cada any a mitjans d’abril, els visitants de la terrassa (pardals, garses, coloms, gavines, merla, ànecs en formació, estornells), els corbs marins. Els ànecs i cignes en les travesses en caiac als rius. Agrons i flamencs al delta de l’Ebre. Voltors a l’Ebre. Àguiles al Caussanel. Ibis a Etiòpia. Còndors al Perú.

[Els mamífers tenen sang calenta que permet viure a entorns més freds) , especialització de dents segons si són hervíbors o carnívors, cervell més gran per processar sentits de la vista i olfacte. Els teris pareixen les cries sense estar protegides dins d’un ou [hauran de mamar un temps abans de poder alimentar-se soles]

Mamífers

  • Rosegadors: Un ratolí blanc que vaig comprar a la rambla de petit, rates, esquirols, marmotes a la cabana de l’esparver al Pirineu. Ratpenat a cova de la Mancha.
    Lagomorfs: conills i llebres
    Eulipotiflers: L’eriçó raspall que vam tenir a Castellar
  • Artiodactyla : vaques a la vaqueria, a pagès, porcs i ovelles, a la muntanya, cavalls i vaques. Cérvols. Isards. Cabres a Montserrat. Als viatges, camells, elefants, hipopòtams, girafes, zebres, búfals. (balena?) Dofins?
  • Carnivora: gats, gossos, lleons i lleopards a Tanzània, felins al zoo.
  • Primats: micos al zoo, jo mateix al mirall, micos a la Índia i Etiòpia [ Desenvolupen habilitat a les mans en enfilar-se als arbres, i quan tornen a terra seran capaços de fer servir eines]

GUIES.
Peixos marins. Peixos de riu. Cetacis. Amfibis i rèptils.
Ocells de Lleida. Rapinyaires. 50 ocells comuns. Ocells nedadors. Cigonyes i agrons. Mallerengues i picots. Aviram autòcton.
Mamífers. Bestiar autòcton. Gran fauna prehistòrica.


Ampliació

A partir del microscopi de Hooke i Leeuvenhoek podem començar a explorar els microorganismes. (Vídeos A journey to the microcosmos )

(il·lustració del llibre del Dr.Acorta que llegia quan era un noi)

Al s19, expedicions com les del Beagle   (1831-1836) o el Challenger (1872-1876). A la segona meitat del s20 i s21, a més de seguir aprofundint a la jungla, es descobreixen moltes espècies a les profunditats del mar. (BBC)


MATERIALS:

Guies d’identificació:

Fotos viatges:

[ muntar Galeria]

Vídeos:


Treball de Naturalista

  • terrassa: ocells, dragons, insectes
  • la bassa, cargols i microscopi
  • identificar les flors als pins i gingko
  • els temps de la terrassa: molsa, falgueres, setembre octubre: lletereses
  • herbari bàsic dels paisatges de Catalunya

La naturalesa i la vida. Contemplació

La terra i la vida  44 la vida  [esborrany]


PERSONAL Quins llocs he conegut? Quins paisatges i animals he vist? Els cérvols a les excursions, els grans animals a Àfrica

Què m’ha fascinat de la naturalesa [experiències filosòfiques, massa general]? les col·leccions d’insectes, herbari, els llibres, els musuets de Castellar i Ayma,  estudi inventari, museus de ciències naturals,   els jardins a Castellar i Ayma.  / [ quina part m’he fet meva, el meu món? ]  els meus paisatges preferits, el que veig cada any: ametllers, tipuanes, orenetes, experiències


estudi

els insectes i llibres Uteha, treball origen de la vida, pprocesos irreversibles+ inventari als 90


exp. “místiques”: les caminades i excursions en solitari a Solius, després al Pirineu ,   gr11 saludant els rierols i els animals, el vel d’Irati

Saludant la naturalesa

la naturalesa salvatge:  tempestes pluja, distància i llocs inaccessibles a la muntanya, el mar

la naturalesa amable: els jardins, disseny castellar, solius, ayma


la naturalesa ne mi, els avantpassats

Abella fustera

La vida  |   Llista d’espècies


L’abella fustera, abella de la fusta o borinot negre (Xylocopa violacea) comuna als Països Catalans i a gran part d’Europa. El seu nom comú al·ludeix al fet que fa els seus nius en la fusta en descomposició.
Malgrat no alimentar-se de fusta, les seves mandíbules els permeten construir un niu amb diverses galeries paral·leles que desemboquen en una obertura única. En les galeries es desenvolupen les larves. A la primavera ponen vàries dotzenes d’ous i després de l’eclosió, les larves s’alimenten d’una barreja de pol·len i nèctar posat per les femelles. La femella té un fibló però no és gens agressiva. Sembla que aquesta espècie podria estar en augment degut a l’escalfament global.

Visiten l’espígol de la terrassa a l’hivern

Marmota

Les marmotes (Marmota) són un gènere de mamífers de la família dels esciúrids. Viuen a l’alta muntanya a l’hemisferi nord. Són rosegadors de mida mitjana, una mica més grans que els gats domèstics, de potes curtes i cos ample que els proporcionen un aspecte força rabassut.

Cabana de l’esparver, 2009

 

Fura

Fura. Mustela putorius

Negra, uns 50 cm. Els egipcis les van domesticar.

 

 

 

Olot. Desembre 2022

Al costat del Fluvià, hens poruga i gairebé xafardera, feia dues passes i es girava per observar-me.

Eriçó

Erinaceus europaeus, Eriçó comú

N’havíem tingut un a Castellar, que havia recollit al seu jardí un company de feina. Li dèiem “Raspall”, i a vegades li rascàvem la panxa. Un dia se’ns va escapar i vam comprar-ne una parella. Al cap d’uns mesos van agafar una malaltia i es van morir.

És remarcable que almenys dos poetes anglesos fan sortir l’eriçó com a animal vulnerable:

Thomas Hardy, Afterwards

Philip Larkin. The Mower

 

 

Bedoll

Vida  |   Llista Espècies


Betula pendula

[tinc dos bonsais] són els boscos que vaig veure a la taiga de Finlàndia.

Durant un mes vaig estar polint, vernissant, passant la ma pels taulers de bedoll quan feia la lllibreria.

Gustav Klimt, Buchenwald. Vist el 2014 a Dresden

 

 

Ernst Haeckel. Kunstformen der Natur

Vida  |   Arbre de la vida   |   Taxonomia    df


(Seguint la classificació de Shipunov 2007)

Regnum Monera

Superphylum Archebacteria
Phylum 1. Archebacteria [ 6Methanobacterium ]
Superphylum Bacteria [ 6.2Bacillus ]3
Phylum 2. Firmicutes [ 6Bacillus ]4
Phylum 3. Actinobacteria [ 6Actynomyces ]]
Phylum 4. Hadobacteria [ 6Deinococcus ]
Phylum 5. Chlorobacteria [ 6Chloroflexus ]7
Phylum 6. Cyanobacteria [ 6Nostoc ]
Phylum 7. Bacteroidetes [ 6Bacteroides ]10
Phylum 8. Spirochaetes [ 6Spirochaeta ]]
Phylum 9. Planctobacteria [ 6Planctomyces ]12
Phylum 10. Proteobacteria [ 6Rhodospirillum ]
Phylum 11. Endomicrobia [ 6Endomicrobium ]

Regnum Protista

Superphylum Opistokontha [ 6.2Agaricus ]
Phylum 12. Choanozoa [ 6Sphaeroeca ]
Phylum 13. Eomycota* [ 6Mucor ]
Phylum 14. Microsporidia [ 6Microsporidium ]
[Bolets 15 i 16]
Phylum 15. Basidiomycetes [ 6Agaricus ]

(KFN 63)
Phylum 16. Ascomycetes [ 6Ascomyces ]
Phylum 17. Amoebozoa sed.m. [ 6Amoeba ]33
Phylum 18. Apusozoa sed.m. [ 6Apusomonas ]39
Phylum 19. Cercozoa [Subphylum Retaria [ 5.8Gromia ]/Classis 6(89). Plasmodiophorea [ 5Plasmodiophora ]48/7(90). Gromiea [ 5Gromia ]49/8(91). Foraminifera

(KFN 2, 12)
Subphylum Radiolaria

(KFN 1, 11, 21, 22, 31, 41, 51, 61)
Superphylum Excavata [ 6.2Euglena ]
Phylum 20. Metamonada [ 6Trichomonas ]
Phylum 21. Euglenozoa [ 6Euglena ]
Superphylum Alveolata [ 6.2Paramecium ]
Phylum 22. Dinozoa [ 6Peridinium ]

(KFN 14)
Phylum 23. Ciliophora [ 6Paramecium ]

(KFN 3, 13)
Superphylum Chromista [ 6.2Fucus ]
Phylum 24. Labyrinthomorpha [ 6Labyrinthula ]
Phylum 25. Bicoecea [ 6Bicosoeca ] ]72
Phylum 26. Opalozoa [ 6Opalina ]
Phylum 27. Oomycota [ 6Saprolegnia ]
Phylum 28. Chromophyta [ 6Fucus ]/Classis 1(131). Bacillariophyceae s.l. [ 5Diatoma ]76/2(132). Chrysophyceae s.l. [ 5Chrysococcus ]77/3(133). Hypogyrophyceae stat.m. [ 5Pedinella ]78/4(134). Raphidophyceae [ 5Rhaphidomonas ]/5(135). Phaeophyceae s.l. [ 5Fucus ]79

(KFN 4 Diatomees)

(KFN 15 algues marrons)
Superphylum Chloronta [ 6.2Volvox ] 64, 65
Phylum 29. Haptophyta [ 6Prymnesium ]
Phylum 30. Centrohelida [ 6Raphidiophrys ]
Phylum 31. Cryptista [ 6Crypromonas ]
Phylum 32. Glaucophyta [ 6Glaucocystis ]
Phylum 33. Rhodophyta [ 6Bangia ]

(KFN 65)
Phylum 34. Chlorophyta* [ 6Volvox ](algues verdes)

(KFN 24, 34,64)

Regnum Vegetabilia [ 7Magnolia ]

Phylum 35. Bryophyta* [ 6Bryum ]

(KFN 72)
Phylum 36. Pteridophyta* [ 6Pteris ]
Phylum 37. Spermatophyta [ 6Magnolia ]

    • Classis 1(170). Cycadopsida [ 5Cycas ]
    • 2(171). Ginkgoopsida [ 5Ginkgo ]
    • 3(172). Gnetopsida [ 5Gnetum ]
    • 4(173). Pinopsida [ 5Pinus ]97
    • 5(174). Angiospermae [ 5Magnolia

(KFN 61)

Regnum Animalia [ 7Felis ]
Subregnum Parazoa
Phylum 39. Spongia

(KFN 5,35)

Subregnum Eumetazoa
Infraregnum Anephrozoa* [ 6.5Felis ]
Phylum 40. Ctenophora

(KFN 27)
Phylum 41. Cnidaria

(KFN (6, 7, 8, 9, 16, 17, 18, 19, 21, 25, 26, 28, 29, 38, 36, 37, 39, 45, 46, 48, 49, 59, 69)
Phylum 42. Acoelomorpha [ 6Convoluta ]
Infraregnum Deuterostomia
Phylum 43. Xenoturbellida [ 6Xenoturbella ]
Phylum 44. Echinodermata [ 6Echinus ] ( Haeckel )/Classis 1(192). Crinoidea [ 5Metacrinus ] / 2(193). Ophiuroidea [ 5Ophiura ] / 3(194). Asteroidea [ 5Asterias ]101 / 4(195). Echinoidea [ 5Echinus ]

(KFN 40, Asteroidea, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70)
Phylum 45. Hemichordata [ 6Balanoglossus ]102
Phylum 46. Chordata [ 6Felis ]

    • Subphylum Cephalochordata [ 5.8Branchiostoma ] / Classis 1(199).
      • Cephalochordata [ 5Branchiostoma ]
    • Subphylum Vertebrata [ 5.8Felis ]
      • Classis 2(200). Cyclostomata stat.m. [ 5Myxine ]
      • 3(201). Chondrichtyes [ 5Squalus ]
      • 4(202). Actinopterygii [ 5Perca ]

(KFN 42)

      • 5(203). Dipnoi [ 5Peripatus ]103
      • 6(204). Amphibia [ 5Rana ] (KFN 68)
      • 7(205). Reptilia* [ 5Gecko ]
      • 8(206). Aves [ 5Gallus ]
      • 9(207). Mammalia [ 5Felis ] (KFN 69)
    • Subphylum Tunicata [ 5.8Ciona ]/ Classis 10(208). Ascidiacea [ 5Ciona ]104

Infraregnum Protostomia [ 6.5Araneus ]
Superphylum Chaetognatha [ 6.2Sagitta ]
Phylum 47. Chaetognatha sed.m. [ 6Sagitta ]
Superphylum Spiralia [ 6.2Scarabaeus ]
Phylum 48. Gastrotricha [ 6Macrodasys ]
Phylum 49. Gnathifera [ 6Rotifer ]

(KFN 32)

Phylum 50. Platyhelminthes [ 6Planaria ]
Phylum 51. Dicyemida sed.m. [ 6Dicyema ]
Phylum 52. Nemertini [ 6Nemertes ]
Phylum 53. Bryozoa [ 6Plumatella ]

(KFN 23, 33)
Phylum 54. Mollusca [ 6Trochus ]
Classis 1(223). Aplacophora [ 5Neomenia ]110/2(224). Polyplacophora [ 5Chiton ]/3(225). Monoplacophora stat.m. [ 5Neopilina ]/4(226). Bivalvia [ 5Mytilus ]/5(227). Gastropoda [ 5Trochus ]/6(228). Scaphopoda [ 5Dentalium ]
7(229). Cephalopoda [ 5Octopus ]

(KFN 43, Nudibranquis, gasteròpods, (altres mol·luscs 44, 53, 55, 54, 57))

Phylum 55. Brachiopoda [ 6Lingula ]
Phylum 56. Annelida [ 6Nereis ]
Phylum 57. Orthonecta sed.m. [ 6Rhopalura ]
Superphylum Ecdysozoa [ 6.2Scarabaeus ]
Phylum 58. Cycloneuralia*
Phylum 59. Tardigrada [ 6Macrobiotus ]s ]
Phylum 60. Arthropoda [ 6Araneus ]

(KFN 47)

    • Subphylum Onychophora [ 5.8Peripatus ]
      • Classis 1(242). Onychophora [ 5Peripatus ]
    • Subphylum Cheliceromorpha [ 5.8Araneus ]
      • Classis 2(243). Chelicerata [ 5Araneus ]115

(KFN 66)

      • 3(244). Pantopoda [ 5Pycnogonum ]
    • Subphylum Myriapoda [ 5.8Lithobius ]
      • Classis 4(245). Chilopoda [ 5Scolopendra ]
      • 5(246). Progoneata stat.m. [ 5Julus ]116
    • Subphylum Pancrustacea [ 5.8Scarabaeus ] agrupa crustacis i insectes
      • Classis 6(247). Ichthyostraca [ 5Argulus ]117
      • 7(248). Ostracoda stat.m. [ 5Cypris ]
      • 8(249). Maxillopoda [ 5Balanus ]118

(KFN 56, 57)

      • 9(250). Malacostraca [ 5Cancer ]119
      • 10(251). Remipedia [ 5Speleonectes ]
      • 11(252). Cephalocarida [ 5Hutchinsoniella ]
      • 12(253). Branchiopoda [ 5Daphnia ]
      • 13(254). Hexapoda [ 5Scarabaeus ]120 ( KFN 58)

Taxonomia, clades

Vida    |    Arbre de la vida   |  Llista espècies  |


Linneu va proposar el Systema naturae (1758), basant-se en les semblances i diferències morfològiques. A partir de la teoria de l’evolució de Darwin (1859), tenia més sentit ordenar la vida segons la diversificació al llarg de l’evolució, com les branques d’un arbre.  Així, per exemple, es va assenyalar que les aus procedien dels dinosaures. Haeckel (1834-1919), que va fer tants estudis sobre protistes, els proposà com a tercer reialme. (Kunstformen der Natur ). El 1957 Julian Huxley proposà els cladogrames (del grec klados=branca). (El concepte també s’aplica a l’evolució de les llengües). Abans de la teoria de l’evolució, en una concepció “estàtica” de les espècies, es pensava en termes d’una escala, amb l’home dalt de tot. El 1969 els fongs se separen de les plantes.

Arbre de la vida de Darwin (1859)

Arbre de la vida de Haeckel (1879)

SI podem definir un grup que inclogui tots els descendents d’un mateix antecessor comú, aquest és monofilètic . Si fem una agrupació on s’exclouen algun dels grups descents, aquesta és parafilètica. Per exemple els rèptils no inclouen les aus. (El grup verd no inclou el blau que té el mateix antecessor).

Inicialment els criteris per dibuixar el cladograma eren morfològics (el crani sinàpsid, sang freda o calenta, notocorda). Amb la possibilitat de les seqüències de DNA, es poden tenir en compte les semblances de codi, que poden arribar a ser sorprenents: el DNA que compartim amb altres espècies).

Del punt de vista dels gens, la diversitat més gran és en les formes de vida més bàsiques:


Open Tree of Life: web navegable per nodes

Catalogue of Life : projecte d’aplegar totes les espècies conegudes


Una visió general seguint la Encyclopedia of life (Smithsonian):

[Procariotes]

[Eucariotes]


Proposta de Shipunov (2007), 11 phylums de Monera, 23 de Protista (inclouen bolets i algues),

Regnum Monera
Superphylum Archebacteria
Phylum 1. Archebacteria [ 6Methanobacterium ]
Superphylum Bacteria [ 6.2Bacillus ]3
Phylum 2. Firmicutes [ 6Bacillus ]4
Phylum 3. Actinobacteria [ 6Actynomyces ]]
Phylum 4. Hadobacteria [ 6Deinococcus ]
Phylum 5. Chlorobacteria [ 6Chloroflexus ]7
Phylum 6. Cyanobacteria [ 6Nostoc ]
Phylum 7. Bacteroidetes [ 6Bacteroides ]10
Phylum 8. Spirochaetes [ 6Spirochaeta ]]
Phylum 9. Planctobacteria [ 6Planctomyces ]12
Phylum 10. Proteobacteria [ 6Rhodospirillum ]
Phylum 11. Endomicrobia [ 6Endomicrobium ]

Regnum Protista

Superphylum Opistokontha [ 6.2Agaricus ]
Phylum 12. Choanozoa [ 6Sphaeroeca ]
Phylum 13. Eomycota* [ 6Mucor ]
Phylum 14. Microsporidia [ 6Microsporidium ]
[Bolets 15 i 16]
Phylum 15. Basidiomycetes [ 6Agaricus ]
Phylum 16. Ascomycetes [ 6Ascomyces ]
Phylum 17. Amoebozoa sed.m. [ 6Amoeba ]33
Phylum 18. Apusozoa sed.m. [ 6Apusomonas ]39
Phylum 19. Cercozoa [Subphylum Retaria amb Foraminifera, i Radiolaria Superphylum Excavata [ 6.2Euglena ]
Phylum 20. Metamonada [ 6Trichomonas ]
Phylum 21. Euglenozoa [ 6Euglena ]
Superphylum Alveolata [ 6.2Paramecium ]
Phylum 22. Dinozoa [ 6Peridinium ]
Phylum 23. Ciliophora [ 6Paramecium ] (3, 13, 14)
Superphylum Chromista [ 6.2Fucus ]
Phylum 24. Labyrinthomorpha [ 6Labyrinthula ]
Phylum 25. Bicoecea [ 6Bicosoeca ] ]72
Phylum 26. Opalozoa [ 6Opalina ]
Phylum 27. Oomycota [ 6Saprolegnia ]
Phylum 28. Chromophyta [ 6Fucus ]
Superphylum Chloronta [ 6.2Volvox ] algues
Phylum 29. Haptophyta [ 6Prymnesium ]
Phylum 30. Centrohelida [ 6Raphidiophrys ]
Phylum 31. Cryptista [ 6Crypromonas ]
Phylum 32. Glaucophyta [ 6Glaucocystis ]
Phylum 33. Rhodophyta [ 6Bangia ]
Phylum 34. Chlorophyta* [ 6Volvox ]

Regnum Vegetabilia [ 7Magnolia ]

Phylum 35. Bryophyta* [ 6Bryum ]
Phylum 36. Pteridophyta* [ 6Pteris ]
Phylum 37. Spermatophyta [ 6Magnolia ]

    • Classis 1(170). Cycadopsida [ 5Cycas ]
    • 2(171). Ginkgoopsida [ 5Ginkgo ]
    • 3(172). Gnetopsida [ 5Gnetum ]
    • 4(173). Pinopsida [ 5Pinus ]97
    • 5(174). Angiospermae [ 5Magnolia

Regnum Animalia [ 7Felis ]
Subregnum Parazoa
Phylum 39. Spongia, esponges
Subregnum Eumetazoa
Infraregnum Anephrozoa* [ 6.5Felis ]
Phylum 40. Ctenophora
Phylum 41. Cnidaria, meduses
Phylum 42. Acoelomorpha [ 6Convoluta ]
Phylum 42. Acoelomorpha [ 6Convoluta ]
Infraregnum Deuterostomia
Phylum 43. Xenoturbellida [ 6Xenoturbella ]
Phylum 44. Echinodermata [ 6Echinus ] /Classis 1(192). Crinoidea [ 5Metacrinus ]/2(193). Ophiuroidea [ 5Ophiura ]/3(194). Asteroidea [ 5Asterias ]101/4(195). Echinoidea [ 5Echinus ]
Phylum 45. Hemichordata [ 6Balanoglossus ]102

Phylum 46. Chordata [ 6Felis ]

    • Subphylum Cephalochordata [ 5.8Branchiostoma ] / Classis 1(199).
      • Cephalochordata [ 5Branchiostoma ]
    • Subphylum Vertebrata [ 5.8Felis ]
      • Classis 2(200). Cyclostomata stat.m. [ 5Myxine ]
      • 3(201). Chondrichtyes [ 5Squalus ]
      • 4(202). Actinopterygii [ 5Perca ]
      • 5(203). Dipnoi [ 5Peripatus ]103
      • 6(204). Amphibia [ 5Rana ]
      • 7(205). Reptilia* [ 5Gecko ]
      • 8(206). Aves [ 5Gallus ]
      • 9(207). Mammalia [ 5Felis ]
    • Subphylum Tunicata [ 5.8Ciona ]/ Classis 10(208). Ascidiacea [ 5Ciona ]104

Infraregnum Protostomia [ 6.5Araneus ]
Superphylum Chaetognatha [ 6.2Sagitta ]
Phylum 47. Chaetognatha sed.m. [ 6Sagitta ]
Superphylum Spiralia [ 6.2Scarabaeus ]
Phylum 48. Gastrotricha [ 6Macrodasys ]
Phylum 49. Gnathifera [ 6Rotifer ]
Phylum 50. Platyhelminthes [ 6Planaria ]
Phylum 51. Dicyemida sed.m. [ 6Dicyema ]
Phylum 52. Nemertini [ 6Nemertes ]
Phylum 53. Bryozoa [ 6Plumatella ]
Phylum 54. Mollusca [ 6Trochus ]
Phylum 55. Brachiopoda [ 6Lingula ]
Phylum 56. Annelida [ 6Nereis ]
Phylum 57. Orthonecta sed.m. [ 6Rhopalura ]
Superphylum Ecdysozoa [ 6.2Scarabaeus ]
Phylum 58. Cycloneuralia*
Phylum 59. Tardigrada [ 6Macrobiotus ]s ]
Phylum 60. Arthropoda [ 6Araneus ]

    • Subphylum Onychophora [ 5.8Peripatus ]
      • Classis 1(242). Onychophora [ 5Peripatus ]
    • Subphylum Cheliceromorpha [ 5.8Araneus ]
      • Classis 2(243). Chelicerata [ 5Araneus ]115 (Haeckel 66)
      • 3(244). Pantopoda [ 5Pycnogonum ]
    • Subphylum Myriapoda [ 5.8Lithobius ]
      • Classis 4(245). Chilopoda [ 5Scolopendra ]
      • 5(246). Progoneata stat.m. [ 5Julus ]116
    • Subphylum Pancrustacea [ 5.8Scarabaeus ] agrupa crustacis i insectes
      • Classis 6(247). Ichthyostraca [ 5Argulus ]117
      • 7(248). Ostracoda stat.m. [ 5Cypris ] haeckel 47, 56)
      • 8(249). Maxillopoda [ 5Balanus ]118
      • 9(250). Malacostraca [ 5Cancer ]119
      • 10(251). Remipedia [ 5Speleonectes ]
      • 11(252). Cephalocarida [ 5Hutchinsoniella ]
      • 12(253). Branchiopoda [ 5Daphnia ]
      • 13(254). Hexapoda [ 5Scarabaeus ]120 haeckel 58

Dificultats

la classificació segueix essent discutida: contested world taxonomy (link)

 

Fòssils

L’evolució    |   arbre de la vida    |


Com reconstruïm l’evolució?  Cronologia de la terra   

Tenim una sèrie d’estrats amb unes característiques geològiques i amb uns fòssils determinats.


Una mostra de diferents tipus de fòssils:


ELS HOMÍNIDS AL QUATERNARI

Homo sàpiens trobat al Marroc, 250 ma

Lucy, 3.2 Ma


ELS MAMÍFERS AL CENOZOIC

Jaciment de fòssil de mamut a South Dakota

Darwinius massillae


ELS DINOSAURES AL MESOZOIC


AMFIBIS, PEIXOS I MOL·LUSCS AL PALEOZOIC

libèl·lula gegant

Fòssil i reconstrucció de Tiktaalik

Archaeropteris  (Devonià)

Eusthenopteron

Nautiloid Treptoceras

Trilobites de le meva col·lecció


ESTROMATOLITS AL PRECÀMBRIC

Stromatolites, evidències de cianobactèries


La Paleodb permet navegar per tots els jaciments i col·leccions, filtrar per època i amb els botons de l’equerra, reconstruir la posició dels continents, o explorar per taxa. A la dreta mostra el percentatge de cada tipus de fòssil.

[ la navegació per arbre és una mica confosa per classificacions que se superposen. Provo a posar les principals]

ANIMALIA

  • Cnidaria (10503)
  • Porifera (5084)
  • Bilateria (249893)
    • Dickinsoniomorpha (16) , Acoelomorpha (4) , Siphusauctum (3) , Ikaria (2)
    • Eubilateria (249867)
      • Protostomia (175241)
        • Mollusca
        • Annelida
        • Pancrustacea
          • Insecta
          • Crustacea
      • Deuterostomia (74625)
        • Chordata (64295)
          • Vertebrata (63885)
            • Sarcopterytya
            • Osteichtya
              • amphibia
              • Amniota
              • Reptilia
                • Dinosauria
                • Aves
              • mammalia

PLANTAE

  • Embryophyta (5295)
    • Polypodiophyta (1988)
    • Pteridophyta (1988)
    • Angiospermae (1097)
    • Coniferophyta (725)
    • Cycadophyta (489)
    • Ginkgophyta (256)
    • Bryophyta (189)
    • Pteridospermophyta (183)
    • Sphenophyta (167)
    • Trimerophytophyta (95)
  • Spermatophyta (3100)
  • Tracheophyta (1579)
  • Rhodoplantae (579) (algues)
  • Lycopodophyta (193)

-66 Extinció K – Pg

Cretaceous–Paleogene extinction event (End Cretaceous, K–Pg extinction, or formerly K–T extinction): 66 Ma at the Cretaceous (Maastrichtian) – Paleogene (Danian) transition interval. The event formerly called the Cretaceous-Tertiary or K–T extinction or K–T boundary is now officially named the Cretaceous–Paleogene (or K–Pg) extinction event. About 17% of all families, 50% of all genera and 75% of all species became extinct. In the seas all the ammonites, plesiosaurs and mosasaurs disappeared and the percentage of sessile animals (those unable to move about) was reduced to about 33%. All non-avian dinosaurs became extinct during that time. The boundary event was severe with a significant amount of variability in the rate of extinction between and among different clades. Mammals and birds, the latter descended from theropod dinosaurs, emerged as dominant large land animals.

Un estrat d’iridi seria l’indici que l’extinció va ser causada per l’impacte d’un meteorit.

https://www.bbc.com/future/article/20210713-the-dinosaurs-may-have-been-in-trouble-before-the-asteroid Podrien estar ja en declivi

-201 Extinció Triàssic – Juràssic

asd   |   Cronologia Evolució


Triassic–Jurassic extinction event (End Triassic): 201.3 Ma at the TriassicJurassic transition. About 23% of all families, 48% of all genera (20% of marine families and 55% of marine genera) and 70% to 75% of all species became extinct. Most non-dinosaurian archosaurs, most therapsids, and most of the large amphibians were eliminated, leaving dinosaurs with little terrestrial competition. Non-dinosaurian archosaurs continued to dominate aquatic environments, while non-archosaurian diapsids continued to dominate marine environments. The Temnospondyl lineage of large amphibians also survived until the Cretaceous in Australia.

 

-252 Extinció Permià – Triàssic

terra   |    Cronologia evolució


Permian–Triassic extinction event (End Permian): 252 Ma at the PermianTriassic transition Earth’s largest extinction killed 57% of all families, 83% of all genera and 90% to 96% of all species (53% of marine families, 84% of marine genera, about 96% of all marine species and an estimated 70% of land species including insects). The highly successful marine arthropod, the trilobite, became extinct. The evidence regarding plants is less clear, but new taxa became dominant after the extinction. The “Great Dying” had enormous evolutionary significance: on land, it ended the primacy of mammal-like reptiles. The recovery of vertebrates took 30 million years, but the vacant niches created the opportunity for archosaurs to become ascendant. In the seas, the percentage of animals that were sessile dropped from 67% to 50%. The whole late Permian was a difficult time for at least marine life, even before the “Great Dying”.

Mesozoa. Parazoa. Porifera (esponges)

[Dins dels Eucariotes multicel·lulars primitius tenim, colònies de cèl·lules sense organs]]

  • Mesozoa. (A.563) Grup aïllat, 7mm, paràsits
  • Parazoa (A.75,563) 3000e., generalment marines, fins a 2m de diàmetre. Són una associació de cèlules poc cohesionada que consta d’ameboides (fagocitosi i digestió). Es formen a partir d’una associació d’ameboides dèbilment cohesionades, escleroblastos que produeixen l’esquelet amb espícules de diversos tipus i els coanocitos que capturen l’aliment. Estructures Ascon, Sycon i Leucon. Es classifiquen en tres classes segons l’esquelet sigui calcari, silici o d’espongina (Esponja de bany).

Esponges


Calcarea

Keratosa

Angiospermes

Arbre de la vida    La vida al voltant

[plantes amb flor, òrgans masculins, estams, i femenins, pistil carpels, envoltats de pètals i sèpals que els protegeixen. Així hi pot haver reproducció sexual al mateix lloc alhora que en col·laboració amb els insectes s’optimitza la difusió]

A la terrassa, xicoies, malves, espígol, roselles, llimoner, ametller.

Apareixen al Cretàcic, 145Ma. Arbre de la vida

  • Angiospermes basals, nenúfars
  • Altres famílies: Clorantacees, Ceratofilàcies
  • Magnòlides
  • Dicotiledònies (Magnoliòpsida) Eudicots
  • Monocotiledònies (Liliòpsides), Monocots lliris,gramínies

[la classificació va canviant des de la Guia de Camp a la que proposa la wikipedia el 2023] [La Bxxx es refereix a la Flora de Catalunya d’Oriol de Bolós, amb 149 famílies] [ PDF amb poster de tots els ordres i famílies]. Ordres amb característiques.

Terrassa Ayma, flor ametller amb abella

Nimfàcies B19: nenúfars


Angiospermes basals

Terrassa Aymà

(branca primitiva de les plantes amb flor)


Altres famílies: Chloranthales (tropicals sense pètals), Ceratophyllales (aquàtiques)


Magnòlides: Les angiospermes més antigues. (plantes llenyoses tropicals, flors amb carpels lliures): Magnolia, llorer, canyella.

  • Lauraceae: 2.000 espècies d’arbres i arbusts aromàtics, procedents de Gondwana. B15 Llorer.
  • Magnoliaceae: 225 espècies, les angiospermes més primitives. Magnòlia.
  • Piperals: pebre (Aristoloquiàcies B21)
  • Canel·lals: arbres aromàtics

Dicotiledònies: Vascular amb dues fulles o cotiledons a la llavor.

Basals

  • Buxales: Buxàcies B80: boix Cal.litricàcies B81
  • Proteales: plataners, plantes d’Àfrica del sud
  • Ranunculales: GC1: part important de la flora d’europa, carpels poc soldats, molts estams. Papaverals roselles . B16: ++ herba fetgera. Berberiscàcies B18: coralet, arbust, Papaveràcies B39: roselles, cascall (depenent de Roedals a la GC)
  • Trochodendrales

Clades

    • Berberidopsidales: ?
    • Santalales: tropicals Santalals paràsits Santalàcies B82 Lorantàcies B83: vesc (bola ). Balanophorals. paràsits. Balanoforàcies B84
    • Caryophyllales Carophylals. Aizoàcies B87. Nictaginàcies B89. Portulacàcies B90: verdolaga. Basel.làcies B91. Cariofil.làcies B92: clavells. Quenopodiàcies B93: bleda. Amarantàcies B94. Cactals Cactàcies B88: figuera de moro. Plumbaginals Plumbaginàcies B99: malvesc. Poligonals  (família obsoleta?) Poligonàcies B85 [?] Fitolacàcies B86
    • Asterids
      • Cornales Hortènsies Corniàcies B68
      • Ericales te, brucs Teàcies: planta del te. Ericals Pirolàcies B95 Ericàcies B96: neret, arboç, bruc Empetràcies B97 Ebenals Ebenàcies B99-100: èban Sapotàcies B99-100: goma. Primulals Primulàcies B98: morró
      •  Euasterids: 80000 espècies
  • Superrosids
    • Saxifragales (Peonàcies B17), Hammamelidàcies Platanàcies B26 -> rosals. Peonàcies,
    • Eurosids
      • Vitàcies: vinya, Heura Vitàcies B67: vinya
      • Rosids
        • Fabids: 80.000espècies.
          • Zygophyllales,
          • Celastrales, Celastrals Aquifoliàcies B64: grèvol Celastràcies B65: Ebònim jap. JARDI
          • Oxalidales,
          • Malpighiales  (Raffesilàcies B22), Salicals Salicàcies B74 Salze, om. Violaceals Cistàcies B23 Tamaricàcies B44: Tamariu Frankeniàcies B45 Elatinàcies B46 Droseràcies B47 Violàcies B48: violeta. Euforbials Euforbiàcies B79: lleteresa
          • Fabales (Leguminosae Mimosàcies B27: mimosa, Papilionàcies o fabàcies B28: Mongetera, pèsols),
          • Rosales Rosaceae, Rosals (GC2 (carpels variables, units o no, molts estams), Crasulàcies B23, Saxifragàcies B24, Rosàcies B25 ++, B 69-90, Prunus : ametller, presseguer, cirerer, albercoquer, prunera.) Ulmàcies B75: Om, lledoner Moràcies B76: Figuera, mora. Cannabàcies B77: llúpol Urticàcies B78: Ortiga Rhammals Ramnàcies B66: ginjoler
          • Cucurbitales, Cucurbitals Cucurbitàcies B122: carabassa
          • Fagales Fagals  GC 13 Betulàcies B71: bedoll Fagàcies B72: Faig, Castany, Roure, Alzina. Casuarinals (Australia ?) Juglandals Juglandàcies B73: Noguera. Myricals mirto a l’Atlàntic Europeu
        • Malvids:
          • Geraniales, Geranials Oxalidàcies B52: Pa de cucut Geraniàcies B53: geranis Linàcies B54: lli Tropeloàcies B54-55 Balsaminàcies B55 Zigofilàcies B56 Cneoràcies B57
          • Myrtales   (Mirtals GC3 Litràcies B29 Mirtàcies B30: murta Punicàcies B31: magraner, Onagràcies B32, Trapàcies B33 (aquàtica), Haloragàcies B34, Hippuridàcies B35, Teligonàcies B36, Timeleàcies B37: Dafne, Eleagnàcies B38),
          • Crossosomatales,
          • Picramniales,
          • Sapindales (Anacardiae festucs). Rutals Rutàcies B58: ruda Aceràcies B59: Auró Hippocastanàcies B59-60 Coriariàcies B60 Poligalàcies B61 Meliàcies: caoba Simarubàcies B62 Anacardiàcies B63  Sapindals : castanyer d’Indies ornamental
          • Huerteales
          • Malvales Malvals Malvàcies B50: malva, cotoner Tiliàcies B51: tell
          • Brassicales Capparals Agrupades amb Papaveràcies B39 a la GC com a Roedals Capparàcies B40 Crucíferes B41: o brasicàcies, cols Resedàcies B42

Ordres

[Grup obsolet]

B5431.40 Tubiflores Convolvulàcies B106: corretjola Boraginàcies B107: llengua de bou, miosotis Labiades B108: menta, espígol, tarongina Verbenàcies B109: verbena Solanàcies B110: patata, nicotiana Escrofulàcies B111: ++ conillets, didalera Orobancàcies B112: frare Lentiburariàcies B113: viola d’aigua Gesneriàcies B114 Acantàcies B115: Acant Globulariàcies B116

1. Magnolials (llorer), 2. Ranunculals, 3. Piperals (pebrot), 4. Aristoloquials, 5. Papaverals (rosella), 6. Rosals, 7. Leguminosae (pèsol), 8. Mirtals, 9. Hammamelidals, 10. Fagals (faig, roure, alzina), 11. Casuarinals, 12. Urticals (Figuera, Om), 13. Salicals (salze), 14. Juglandals (Noguera), 15. Myricals, 16. Santalals, 17. Balanoforals, 18. Carophylals (clavell, bleda), 19. Cactals, 20. Plumbaginals, 21. Poligonals, 22. Dilenials, 23. Violaceals (violeta), 24. Cucurbitals (carabassa), 25. Capparals (cols), 26. Ericals (bruc), 27. Ebenals, 28. Primulals, 29. Geranials (geranis), 30. Rutals, 31. Sapindals, 32. Euforbials (boix), 33. Malvals, 34. Celastrals (Ebònim), 35. Rhammals (vinya),  36. Umbel.líferals (pastanaga), 37. Oleals, 38. Gencianals (baladre), 39. Dipsacals (cafè), 40. Tubiflores (corretjola), 41. Plantaginals, 42. Campanulals (campaneta, margarida).


Monocotiledònies o Liliòpsides. Vascular amb una fulla a la llavor, herbácees de nervis paralels, sense creixement secundari en gruix). Unes 60.000 espècies, aproximadament la quarta part.

Dürer Das grose rasenstück 1503

  • Acorales
  • Alismatales (Helobial aquàtiques, Alismatàcies B125: sagitària, Butomàcies B126, Hidrocaritàcies B127, Juncaginàcies B128: joncs, Potamogetonàcies B129: Espiga d’aigua, Ruppiàcies .
  • B130…B133,Naiadàcies B134: All)
  • Arals Aràcees B146: rapa Lemnàcies B147: llentia d’aigua
  • Asparagales Orquidals, Orquidàcies B144: 20.000 esp
  • Dioscoreales
  • Liliales Liliflores, Liliàcies B135: All, ceba, lliris. Agavàcies B136. Amarilidàcies B137: campaneta, narcís. Iridàcies B138: Iris. (B139-140)
  • Pandanales Esparganàcies B148 Tifàcies B149: boga per fer cistells
  • Petrosaviales
  • Arecales PalmalsArecàcies B145: palmera datilera,
  • Commelinales
  • Poales (JuncalsJuncàcies B141: joncs,  Graminals, Gramínies B143: Blat, ordi. Ciperals,Ciperàcies B142: 1600 esp. Bromelials () plantes ornamentals, pinya
  • Zingiberales

B5432.1.DE 13 ordres: 1. Helobials, 2. Liliflores (all, narcís), 3. Juncals (jonc), 4. Ciperals, 5. Bromelials, 6. Commelinals, 7. Graminals (blat), 8. Pandanals, 9. Palmals (palmera), 10. Ciclantals, 11. Arals, 12. Zingiberals, 13. Orquidals (Orquídees).


Febrer 2024

Observo les flors i miro d’identificar els òrgans masculins i femenins. No m’aclareixo amb els papirus. A les lletereses hi ha una agrupació i veig el fruit com una minúscula castanya verda. Al romaní, difícil de veure el pistil. El marfull i l’espígol tenen una agrupació de múltiples flors petites, es veuen els estams però costa el pistil. De prop, la flor del bruc és com una copa blanca finíssima dins de la qual es veuen els pistils.

Gimnospermes

Arbre de la vida,    La vida al voltant
Apareixen al Devonià 400mA i predominen al Carbonífer 330mA. 1000 espècies.


L’arbre que veiem normalment és l’esporofit, diploide (23 parelles de cromosomes), en el qual creixen [ a la mateixa planta, no a terra] els gametofits mascle i femella, haploides que en fusionar-se donaran lloc a un embrió [el pinyó] diploide.

(llavors nues) /B Flors sense pistil, òvuls situats damunt les fulles carpelars (esquames fent pinya), sense periant (flor nua).

En un pi veiem el con del pol·len (gàmeta haploide), groc, i la pinya que protegeix els òvuls (gàmeta haploide). En ser fecundats pels grans de pol·len que transporta el vent es forma un embrió diploide, que sovint està protegit per una closca i té una reserva d’aliment (el pinyó), d’on creixerà un nou esporòfit (arbre). [no tenim doncs organismes mascle i femella adults i independents]


Gnetatae: (restes de fòsils) , Efedràcies B14 (arbust, liana)

Cycatadae: [semblants a palmeres]

Ginkgoatae: (xina, japó) 1e.

Coniferals

    • Araucaria ()
    • Pinàcies, B12 Fulles esparses o en grups de branques curtes: avet, pícea, pi blanc, pi pinyer, pinastre, pi roig, pi negre, cedre. Taxodium, Sequoia ()
    • Cupressàcies. B13 (fulles oposades o en verticils) Xiprers, ginebró.
    • Taxàcies: B11: (Teix)

wiki

Fongs

Arbre de la vida | La vida que trobem al voltant

P.Devonià 400Ma 100.000 espècies


Haeckel, Basydiomicetes

Camí de taula amb rovellons, reig, pebràs i rossinyol

Bolets al contenidor del bedoll, a la terrassa d’Ayma.


Bolets a Solius: Rovellons, pebrassos, ous de reig, rossinyols. Acabat de ploure, la percepció que tot el sòl és ple de vida sota terra i que emergeix amb força a la superfície.A la fruita i menjar apareixen unes taques a la pell, floridures. El llevat (la massa mare)  que fem servir per fer pujar el pa.

[Diferents d’animals i de plantes, organismes que han desenvolupat la capacitat de processar matèria orgànica no viva, components sobres de processos d’altres organismes, com les arrels dels pins,  fermentació] Arbre de la vida

Són coneguts des de l’antiguitat per menjar i propietats al·lucinògenes. Es van començar a estudiar sistemàticament al s17 amb el microscopi.  Pier Antonio Micheli  Nova plantarum genera (1729). Christiaan Hendrik Persoon (1761–1836) els classificarà.

Fins el 1969 els bolets es classificaven juntament amb les plantes, seguint la bàsica de Linneu que les plantes “creixen i viuen, els animals creixen, viuen i senten. Però els bolet no tenen fulles verdes per dur a terme la fotosíntesi com les plantes. Basant-se en això Robert Harding Whittaker va proposar classificar-los a banda de les plantes, que fabriquen aliments, i dels animals, que mengen aliments ja elaborats, ja sia plantes o altres animals. Els fongs segreguen uns enzims que descomponen matèria orgànica del voltant i ingereixen el resultat [com fer la digestió fora][Per això no podem “plantar” rovellons a un test, és un organisme que viu en simbiosi amb les arrels dels pins o les alzines]. Quan es tracta d’organismes morts parlem de sapròfits. Més endavant l’anàlisi molecular confirmaria que estan més a prop dels animals que no pas de les plantes.

Són heteròtrofs però tenen en comú amb les plantes la paret cel·lular i vacúols. Es reprodueixen per espores, com les falgueres i les molses. Alguns són unicel·lulars. Creixen en forma d’hifes, com uns fils. La seva paret cel·lular té glicans com les plantes i quitina, com a l’exoesquelet dels artròpodes.

Els òrgans de reproducció sexual poden ser molt grans, és la part visible que anomenem bolets. El cicle reproductiu és complex i en una mateixa espècie pot decantar-se per un o altre segons les condicions.
Dos fongs haploides poden unir les hifes dels micelis sense arribar a fusionar cromosomes (dicariota), produint un bolet on es fusionen els nuclis (diploide) que per meiosi fan una espora haploide. Aquesta germinarà i donarà lloc a un miceli haploide. Esquema


Mycobionta. Fongs

La classificació no és definitiva

Les famílies més importants són:

  • Ascomycetes. 64.000e. (20.000 quan ho vaig preparar als anys 90). Paràsits de les plantes. Entre ells hi ha les llevadures, d’importància comercial (l.cervesa), que en solució de glucosa i oxígen es multipliquen ràpidament mentre que sense aire pot variar a un procés de fermentació no oxidativa produïnt CO2 i alcohol. Els penicillium que inhibeixen el creixement de bacteris. També les múrgules i les tòfones.
  • B5223 Basidiomycetes. 15.000e. Espores, Bolets: ou de reig, sureny (F100), rossinyol, rovelló, pebràs (F ), múrgula (F ), gírgola, peu de rata, Farinera Borda, Llenega, carlet, Fredolic (F131, cama-sec o moixernons, camperol (F135), reig bord (F142).

Abans s’hi afegia un tercer grup, els Phycomicetes, amb les hifes seguides sense que les cèl·lules quedin separades per septums. Englobava els actuals Zygomycetes, Chytridiomycetes, Trichomycetes i els Plasmodiophoromycetes, Hyphochytridiomycetes,  Oomycetes que ara no es consideren fongs.  Són paràsits o sapròfits.

Hi ha dos tipus d’organismes que havien estat classificats juntament amb els fongs:

  • Myxomycota: Floridures. Es consideren més propers a protistes com les amebes.600espècies. (hèrnia de la col)).
  • Els líquens o Deuteromycetes. Simbiosi entre alga i fong: Barbes de caputxí. El líquen és com una crosta verda, grisa o groga, simbiosi d’alga i fong: entre els filaments del miceli hi ha una alga que fabrica aliments dels quals se n’aprofita el líquen. Aquest s’amara d’aigua que permet viure a l’alga.

* Guia de Camp: Mixomicetes, Deuteromicetes, Fongs {Ficomicetes, Ascomicetes, Basisiomicetes}, Líquens.  Boscs.44-48

Fongs wikipedia

The Secret lives of fungi, New Yorker, 2020/05/18

Falgueres. Pteridòfits

Devònic, 400Ma, 13.000 espècies.  Arbre de la vida    |    La vida al voltant


Les primeres plantes vasculars van ser les Licopsides (Silúric), i després les falgueres  juntament amb les Cues de cavall . No tenen llavors i es reprodueixen per espores. Van ser importants al Carbonífer quan van assolir alçades entre 20 i 40 metres.

La planta que veiem normalment és un esporofit diploide que fabrica espores haploides [que queden sota les fulles]. De  l’espora creix en un gametofit per mitosi, formant un protalus, d’on creixeran gametos (esperma i ous) per mitosi. L’ou fecundat donarà lloc a un nou esporofit.


Licopoliòpsides tenen un origen diferent i anterior a falgueres i equisets.

Pteridophyta
Primari, Ordovicià. Sense llavors, reproducció per espores.

Licopodials. 1000e.(semblants a les molses):

    • Licopodiàcies B1
    • Selaginel.làcies B2 GC()
    • Isoetàcies B3 (aquàtiques)

Psilòfits: Psilofitals (fòsils) , Psilotals (tropicals)

Isoetals:

Equisets:  Cua de cavall (+ fòsil gran com arbre). Equisetàcies

Filicatae: 9000e. Falgueres.

    • Eusporangis: Esporangis madurs amb paret pluriestr: Ofioglossàcies B5 llengua de serp, Maratials: falgueres tropicals
    • Falgueres: Himenofilàcies, Polipodiàcies B7: falgueres típiques, Dicksoniaciès, Osmundàcies B6
    • Hidropteridals (f.aquàtiques): Marsileàcies B8, Salviniàcies B9

Molsa

P.Devònic 400Ma. 25.000 espècies Arbre de la vida


He estimat les molses des que feia el pessebre de petit, he admirat els paisatges en miniatura en excursions al Pirineu, les vaig voler incorporar al jardí de bonsais de Castellar, les vaig admirar als jardins del Japó i he intentar que visquin al tangram de la terrassa.
[ La vida vegetal comença a colonitzar la terra. No han desenvolupat un sistema vascular i per això no es poden aixecar gaire de terra ].

Haeckel, Muscinae

Gravat Oosthoek (comprat a Amsterdam)

Molsa a la terrassa, esporòfits diploides al febrer

http://

Micropaisatges al Pirineu

Molses notables del jardí Gingaku-ji a Kyoto

Molsa als boscos de Finlàndia


En sentit ampli, són les plantes terrestres no vasculars:

Semblen tenir arrels i fulles però en realitat no tenen estructura vascular, raó per la qual són petites i necessiten l’aigua. Reproducció per alternança de generacions.
Gametòfits haploides: El tapís de falses fulles (gametòfits) equival a la generació menuda de les falgueres d’on neixen asexuadament els cossos reproductors esporogonis amb les càpsules d’espores, de fet una altra generació, que viu paràsita damunt l’anterior [Ara es creu que totes les plantes superiors són així] (GC p.6) . Cada espora dóna lloc a una gametòfit masculí o femení, que veiem com a tapís de fulletes. [les plantes vasculars tenen la forma diploide, amb gametòfits que duren menys]. L’esperma baixa per l’aigua humida fins a fecundar l’arquegònia i comença a créixer un esporòfit (que tarda mig any).
Esporòfits diploides. El cos de l’esporòfit consta d’una llarga tija, anomenada seta, i una càpsula anomenada opèrcul. L’opèrcul és protegit per una caliptra haploide, que és el que queda de l’arquegònia. La caliptra, usualment, cau quan la càpsula madura. Dins la càpsula, té lloc la meiosi, que dóna lloc a espores haploides. La boca de la càpsula és vorejada per una sèrie de dents anomenades peristomes.

Entre les més comunes a Catalunya hi  ha la “molsa de Nadal”, Pseudoscleropodium purum, i Archidium alternifolium. El Catàleg de les molses de Catalunya [còpia a llibres PDFs] en llista 670.

Hepàtiques: (10.000 esp.) Els talos tenen forma de cinta o estrella (plans, freqüents al fons dels rius [diapositiva Monestir de Pedra])

    • Jungermanials
    • Marcantials

Molses: (16.000 esp.) El talo té un tronc i unes falses fulles (molsa verda, [la verda-grisa és molsa o líquen?]. La  GC classifica:

    • Sfagnals
    • Brials (Eubrials i Isobrials)

Algues

Arbre de la vida | La vida que trobem al voltant


6000 espècies. 1600 Ma. Precàmbric.

El verdet de la bassa a la terrassa. Les llargues que trobo a les platges més sanes a la costa brava, amb la seva olor. El verdet de les roques a l’aigua. Les de l’estany de Banyoles. Algues seques que faig servir per cuinar .
[ Molt properes als prototozous, amb qui formen els grup dels Protists, són les primeres agrupacions de cèl·lules que poden dur a terme la fotosíntesi]. Els seus antecessors, les cianofícees també anomenades algues blaves, van canviar la composició de l’atmosfera.

Haeckel. algues marrons

Haeckel. Algues vermelles

Haeckel, algues verdes

2014. Algues Laguna Negra Sória

2017. Algues Noruega Atlàntic


Inclou diferents tipus i la classificació va canviant. S’haurien originat a partir de les cianobactèries. A vegades es prefereix el terme arqueaplàstida. Totes les cèl·lules són iguals, sense formar teixits. S’uneixen en un tal·lus. Potser són més pròximes als protozous que a les plantes. (protists)
Apareixen al Precàmbric. Duen a terme la fotosíntesi i es classifiquen segons el pigment.
Reproducció per espores, asexual i sexual alternadament. Els més primitius són els fitoflagelats, cromatòfers (fotosíntesi) amb flagel (mòbils) com l’euglena, les volvovocals i els dinoflagelats. D’ells deriven les algues que no tindran flagel i seran immòbils amb forma esfèrica. Es classifiquen pel pigment de la fotosíntesi? Reproducció asexual per despreniment d’una part (A.145).

  • Algues flagel·lades. Euglenophyta. Formen part del fitoplàncton. Apareixen en grans quantitats en aigües dolces, com les euglenes, o al mar, com les dinoflagel·lades. Unicel·lulars.
  • Algues verdes. Chlorophyta  (GC3) 11.000 espècies, aigua dolça. Algunes són unicelulars i d’altres formen colònies. (A. 65, 549). Charophyta/Streptophyta de les quals apareixeran les plantes terrestres.
  • Dinophyta. (GC-) 1000 espècies de dinoflagelats, part important del fitoplancton marí (A. 65, 549)
  • Cromophyta o Cromista. Algues grogues o diatomees. (GC2) 13.000 espècies amb pigments [fotosíntesi emmascarats per xantòfiles] Entre elles hi ha les diatomees, unicel.lulars amb closca de sílex.
  • Algues brunes. Phaeophyceace, les algues pardes són algues marines amb un talo que pot arribar als 70 m. (A. 161, 551).
  • Algues vermelles. Rhodophyta. (GC1) 4000 esp., marines, pigment vermell (algues vermelles). Des dels organismes polienèrgides (varis nuclis) s’arriba a talos pluricelulars filamentosos amb uns substància intercelular.

Les que s’havien anomenat “algues blaves” o cianofícees, que duen a terme fotosíntesi es classifiquen com a Protists. Elles van canviar la composició de l’atomesfera: -2400 Ma. Catàstrofe de l’oxígen

* La guia de camp (p. 2) parla de 7 grups: cianofícees (algues blaves), clorofícees (algues verdes, volvox, ¯ Clorophyta), conjugades (sense cèl. repro. flagelades, filamentoses, ¯ Clorophyta), Carofícees (talo semblant als cormòfits, complexe ¯ Clorophyta), Diatomees (Unicelulars, closca de sílex, ¯ Cromòfites, la terra de diatomees té importants aplicacions), Feofícees (Cromòfites) i Rodòfites. Ampliació a GC p.6.

Cnidaria

Llista Espècies


Meduses, pòlips, coralls, simetria radial. 9000 espècies.

Se suposa que apareixen a l’Edicarià (precàmbric), 580Ma tot i que en tenir un cos tou el registre fòssil és pràcticament inexistent. Sovint amb òrgans defensius, agullons verinosos.

Simetria radial, tub (procedent de dos fulls embrionaris) amb endoderma de cèl·lules digestives, glandulars i musculars, ectoderma de cèl·lules, epitelials i nervioses. El tub té un orifici d’entrada i sortida envoltat de tentacles [són una bossa amb un forat]. Les cèl·lules reproductores estan distribuïdes per les dues capes. Sovint hi ha alternança de generacions. Viuen al mar. Sense cavitat general, només una doble paret amb un únic orifici. Sistema nerviós reticulat formant una xarxa homogènia on les parts conserven una independència total (AB 102, Pinillos 24).

 

Hydrozoa: pòlips, hidres i meduses, a vegades amb alternança de generacions.

  • Scyphozoa: meduses i pòlips amb 4 parets gàstriques, algunes molt grans i verinoses. AG. Haeckel p.236
  • Antozoa: Només pòlips, a vegades formant colònies, mà de mort, corall (closca calcària), recifes.  Anèmones. Tomàquet de mar.

Cnetophora [2]: Sense Cnidoblastos, animals pelàgics de vida lliure.

Reproducció: Pot ser asexual, dividint-se per la meitat, o bé amb un cicle que alterna estadis de pòlip i medusa. Una larva es desplaça fins que troba un lloc adequat i forma un pòlip. Arriba un moment que el pòlip absorbeix els seus tentacles i forma uns discos que el final es desprenen i es converteixen en meduses (reproducció sexual). Aquestes meduses faran gàmetes que es fecunden i donen lloc a larves.

Siphonophorae

Medusae


Cnidaria

Protista. -2100 Ma

Arbre de la vidaLlista espècies   |


Els eucariotes són cèl·lules amb una membrana que envolta el nucli, incorporen  mitocondries amb capacitat de descomposar sucre per obtenir energia, i cloroplastos que poden dur a terme la fotosíntesi. Una de les hipòtesis és que els van adquirir per endosimbiosi. S’originen en el precàmbric (més info).

Eucariotes unicel·lulars: 65.000 espècies.


Algues: Euglenòfits (algues flagel·lades), Cromòfits. Algues grogues o diatomees del fitoplàncton.

[Protozous en les agrupacions tradicionals que no reflecteixen el que sabem de l’evolució]

  • Flagellata, que tenen flagels. Es troben en tots els lllinatges indicant que l’ancestre comú de tots els eucariotes seria un flagelat heteròtrof. (A. 65, 561) Per la mobilitat s’inclouen a vegades flagelats “plantes” (autòtrofs) com els dinoflagelats. Els altres acostumen a ser paràsits intestinals com tripanosomes que viuen de la sang dels vertebrats, el tricomona o el Trichonympha que és un simbiont dels termites, tot vivint al seu estómac i transformant la fusta que s’empassen.
  • Amoebae, (A. 69, 561) sense flagels, es poden deformar per desplaçar-se formant com psudòpods. S’adapten al substrat (sarro de les dents, disenteria). Grups: Amebozoa, Rhizaria, Excavata, Heterokonta, alveolata (dinoflagelats paràsits), Ophistokonta, Heliozoa, micetozoa. Dins dels Rhizaria hi ha els foraminífers (nummulites) i els radiolaria que tenen un esquelet de SiO2. Els foraminífers són marins que van segregant closques calcàries fins a formar moltes capes. Entre ells hi ha els nummulits que van formar gruixudes capes de sediment durant l’era terciària. Els Heliozous suren a l’aigua.
  • Sporozoa. (A. 69, 158, 561) Són paràsits agents de greus epidèmies que es reprodueixen per espores. El Plasmodium és l’agent de la malària, reproduïnt-se a l’estómac del mosquit anòfeles i passant a l’home per picadura.
  • Cnidosporidia, Quistes, espores, paràsits
  • Ciliata. (A. 71, 152, 561) Evolucionaren a partir dels flagelats i tenen una estructura amb dos nuclis, reproducció per conjugació (2 o 3 al dia ->) i cilis que els donen mobilitat i poden conduir aliments fins a la boca. El parameci viu a l’aigua dolça, amida 0.3 mm, té forma de sabatilla i 2500 cilis que pot moure coordinadament (s.nerviós). La capacitat de dur-se aliments a la boca i de moure’s segons estímuls de rebuig, acolliment o l’estat intern de gana, el fan semblant als animals superiors. [Quina diferència tan enorme que hi ha entre aquest unicelular i un virus!]. Dins d’aquests hi hauria els Sessilida als quals pertanyeria la família dels Vorticellidae que vaig observar al microscopi.

Els radiolaria il·ustrats per Haeckel en la seva monografia (llibre Taschen p. 78)

foraminíferes (rhizaria, Haeckel KFN 2) dinoflagelats, diatomees, amebes, nummulits


Classificació moderna:


A partir d’aquí evolucionaran els eucariotes multicel·lulars.

Fongs: Paleozoic (Devònic) [ el metabolisme requereix parasitar o simbiosi amb altres organismes]

Plantes: Algues verdes i vermelles cap el 1600, evolucionaran a plantes terrestres al Paleozoic (Ordovicià),

Metazous: Al Edicarià, al final del Precàmbric apareixen esponges i cnidaris i Nephorozoa


Procariotes

La vida  Llista d’espècies    Arbre de la vida


Els procariotes són cèl·lules simples sense un nucli diferenciat per una membrana. Són les formes més primitives de vida i s’estima que van aparèixer fa 3.500 Ma al Precambrià. 5000 bacteris, 209 arquebacteris.
Cèl·lules més simples que els eucariotes, de 10-12g, unes 1000 vegades menor, sense nucli diferenciat, menys DNA, duplicació més ràpida (20 min.), sense plàstids ni mitocondries).
Ara es distingeix entre bacteris i arquebacteris. Els bacteris tenen parets cel·lulars amb peptidoglycan i mebranes amb àcids grassos, mentre que els arquea no. Això els fa menys vulnerables a antibiòtics. Defireixen també quant als mecanismes de replicació. Els arquea tenen rutes metabòliques que els permet sobreviure en entorns extrems, altes temperatures, nivells de ph o salinitat.

En la classificació de Shipunov tenim 11 phylums (regnum Monera), 1 Arquea i 10 de bacteris.


Superphylum Archebacteria
Phylum 1. Archebacteria [ 6Methanobacterium ] Archea: En general, els arqueobacteris i bacteris són bastant semblants en forma i en mida, tot i que alguns arqueobacteris tenen formes molt inusuals, com ara les cèl·lules planes i quadrades de Haloquadra walsbyi. No tenen nucli. Malgrat aquesta semblança visual amb els bacteris, els arqueobacteris tenen gens i diverses rutes metabòliques que són més properes a les dels eucariotes; notablement, els enzims implicats en la transcripció i la traducció. El 1977 Woese (article scientific american) i Fox els classifiquen separadament dels bacteris. Semblen especialment adaptats a les condicions de la terra primitiva.  209 espècies tot i que és difícil aplicar el concepte ja que es poden barrejar.
Metanobacteris. Redueixen el CO2 a metà, viuen al fons del mar, al fang podrit i a l’intestí. Podrien ser els precursors del procariotes. (L’antibiòtic estreptomicina és ineficaç).
Halobactèris, viuen en aigues molt salades.
Sulfolobus i thermoplasma. Metabolisme sofre.


Superphylum Bacteria [ 6.2Bacillus ] wiki: Els bacteris (Bacteria) són un gran grup de microorganismes unicel·lulars. Tenen una mida de l’ordre de micròmetres i presenten una gran varietat de formes, que van des d’esferes fins a barres i espirals. El seu nom prové de l’ètim grec baktērion (‘bastonet’). Els bacteris són omnipresents a tots els hàbitats de la Terra, on viuen al sòl, en aigües termals àcides, residus radioactius, l’aigua i les profunditats de l’escorça terrestre, a més de la matèria orgànica i els cossos vivents de plantes i animals. Generalment hi ha 40 milions de cèl·lules bacterianes en un gram de sòl i un milió en un mil·lilitre d’aigua dolça; en total, hi ha aproximadament cinc nonilions (5×1030) de bacteris a la Terra, que representen gran part de la biomassa del planeta.

Tenen la capacitat de passar-se material de DNA, plàsmids, modificant els veïns, cosa que explica com desenvolupen resistència als antibiòtics.
(A61) Amiden uns 0.001 mm. Tenen els àcids nucleics en cromosomes, manquen orgànuls i els cromatòfors per a la fotosíntesi així com la funció de respiració es troben localitzats a la membrana. Tenen paret celular. Les bactèries poden sobreviure en condicions molt primàries i temperatures diverses. Es poden dividir cada 30 min [quan temps viuen?] i per això existeixen en gran nombre. En un cc de llet n’hi poden haver 25 106. N’hi ha d’autòtrofes amb fotosíntesi o quimiosíntesi d’àcid sulfhídric en aigües podrides i d’heteròtrofes que s’alimenten de matèria orgànica morta tot transformant-la per que es pugui tornar a aprofitar. D’altres (simbiontes) viuen en matèria viva tot col.laborant-hi com les b.nitrificants de les lleguminoses o la flora b. dels intestins. D’altres són paràsits patògens provocant infeccions com la disenteria, la pesta o el tifus (estan adaptats per atacar específicament una proteïna de l’amfitrió).

Una primera divisió són Eubacteris i cianobacteris.

Del punt de vista del metabolisme, en funció de la font d’energia, qui dóna electrons (oxidant-se) i qui els rep (reduint-se). Els aeròbics tenen oxigen com a receptor i necessiten un medi amb oxigen. Els anaeròbics fixen els electrons en nitrats, sulfats o CO2.

Segons la forma es classifiquen en cocos (esfèrics) com l’streptococo, bacils (bastonets) com el de la peste o la cèlebre Escherichia Coli que es troba a la flora intestinal, vibrios i espirilos. Els bacteris filamentosos són cèl·lules formant filaments. Actomicetes tenen o flagels que surten d’un cos unicel·lular bacilo. (-> Atlas p.549). Classificació de Cohn: bacils, cocos, espirils i vibrios.

Bacils (bastonet). Escheria Coli

Coco (esfera). A parells diplococos, cadenes estreptococos, grups estafilococos.

Espirils (helicoidal)

Vibrions (coma)

Algues Blaves: (Cianofícees) Unicelulars autòtrofes per fotosíntesi sense cloroplastos mitjantçant làmines de pigment blavós o vermell. (A.63) [van canviar l’atmosfera Catàstrofe de l’oxigen].  aspecte similar a les algues.

Classificació de Shipunov (Phylum 1 Arquea)

  • Phylum 2. Firmicutes [ 6Bacillus ]4
  • Phylum 3. Actinobacteria [ 6Actynomyces ]] Presents al sòl, aigua dolça i salada. Tenen un paper important en el cicle del carboni ja que descomponen detritus,
  • Phylum 4. Hadobacteria [ 6Deinococcus ]
  • Phylum 5. Chlorobacteria [ 6Chloroflexus ]7
  • Phylum 6. Cyanobacteria [ 6Nostoc ] Cianobacteris : bacteris blaus que són capaços de dur a terme la fotosíntesi alliberant oxígen. Els seus components es trobaran en les algues i les plantes. Van causar el canvi d’atmosfera de reductora a oxidant. També poden fixar nitrogen.
  • Phylum 7. Bacteroidetes [ 6Bacteroides ]10 Present als sòls, intestins i cavitats orals, també al desert de l’Antàrtica. Tenen un paper important al cicle del carboni descomponent detritus.
  • Phylum 8. Spirochaetes [ 6Spirochaeta ]]
  • Phylum 9. Planctobacteria [ 6Planctomyces ]12
  • Phylum 10. Proteobacteria [ 6Rhodospirillum ]:  Una colla de patògens com  Escherichia, Salmonella, Vibrio, Helicobacter Moltes espècies són esponsables de fixar nitrogen. Algunes es poden moure amb flagels. Els mixobacteris es poden agregar.
  • Phylum 11. Endomicrobia [ 6Endomicrobium ]

Auden: On this day tradition allots to taking stock of our lives, my greetings to all of you, Yeasts, Bacteria, Viruses, Aerobics and Anaerobics: A Very Happy New Year to all for whom my ectoderm is as Middle-Earth to me.

Micropia museu protozous a Amsterdam


 

Arbre de la vida

La Terra  |   Evolució geològica   | Vida |   Llista d’Espècies  |  Taxonomia i Clades  |   Els avantpassats  |    Arbre javascript   |   Haeckel Kunstformen der Natur

1 Eucariotes2 Plantes  |   3 Metazous  |   4 Protostomes   |   5 Deuterostomes
| 6 Tetrapodes7 Sauris    Avials8 Mamifers  |  9 Teris  |  10 Primats


cronologia de la vida

[ (0) vida bactèries |  (1) 2100 Eucariotes cloroplastos i mitocondries |  (2) milticelulars animals i  plantes  |  (P1)  400mA pas a terra, molsa, falgueres, 330 Ma coníferes , 250Ma llavors | (A1) Edicaria 635 Simetria radial i bilateral, protostomos i deuterostomos



p.252 Aparició de la vida amb entitats que s’alimenten i es reprodueixen. Fotosíntesi per les cianobactèries. [ Es defineix l’hipercicle de codificació proteïna DNA. Es defineix la “maquinària química de la vida: les mitocondries i els cloroplastos]. Eucariotes. Organismes plucel·lulars: les algues ( precursors de les plantes), esponges, meduses, simetria bilateral, protostomos i deuterostomos. Als 1100 Ma apareix la reproducció sexual, combinant material genètic.

S’estima que el last universal common ancestor hauria existit 3.500 o 3800 Ma.


Embriofites (Plantes) Les primeres apareixen a P. Ordovicià, 450 mA, 270.000 espècies

  • briofites (molses) P. Devònic, 400 Ma, 15.000 espècies i Hepàtiques (Marchantiofita) sense estomes, Devònic 400mA
  • plantes vasculars
    • Esfenòpsides (cua de cavall) Devònic 400mA, al carbonífer van arribar a 20 metres d’alçada
    • Licopsides Devònic 400mA, 1200 espècies actuals però al carbonifer van arribar a 40m. Devònic.
    • Falgueres (Flicòpsides) P.Devònic 400mA, 9.500 espècies
    • Espermatòfites (plantes amb llavor)
      • Gimnospermes: Coníferes P. Carbonífer 330Ma, Cicadals P. Pèrmic  270mA, Gingkoidals P.Pèrmic 270mA, Gnetals P.Pèrmic. 270mA
      • Angiospermes M. Cretàcic 100mA, 233.000 espècies.

p.254. Les plantes arriben a terra al Devònic, desenvolupen estomes, per intercanviar aire,  reproducció per espores en les briofites i briofites i plantes vasculars. Reproducció per llavors.  Al Mesozoic apareixen les plantes amb flor. Aparició de les arrels fa 407Ma BBC


Angiospermes

  • Nenúfars
  • g
    • Liliòpsides (monocotiledònies)
      • Aràcees 3.700 espècies
      • Arecàcees, palmeres [com el meu margalló] 2.600 espècies
      • Tifàcies
      • gramínees 9.000 espècies, el blat, l’arròs, el bambú
    • Magnoliòpsides (dicotiledònies)
      • Lauràcies.2.000
      • Magnoliàcies
      • Rosàcees
      • Moràcees
      • Anacardiàcies

p.256 plantes en flor [en lloc de tenir els gametos nus en una part de l’esporofit, en distribució més o menys irregular com en les gimnospermes, els òvuls són al centre amb un receptor que és l’estigma, els estams que fabriquen el polen, els gametros masculins, són al voltant] [ la fecundació depèn molt de la col·laboració dels insectes que haurien evolucionat en paral·lel] Haurien començat al final del Paleozoic, al Pèrmic, fa 250Ma, es desenvolupen al llag del mesozoic i al Cenozoic colonitzen tot el món, amb 234.000 espècies. [ jo tinc 40 famílies de dicotiledònies i 13 de monocotiledònies ]

Darwin deia que el cas de les angiospermes eren un “misteri abominable” perquè semblaven aparèixer del no res, sense registre fòssil previ. Una investigadora a Suècia a trobat petits fragments (New Yorker). ”

Benton has argued, along with the botanists Hervé Sauquet and Peter Wilf, that the Cretaceous was the start of an “Angiosperm Terrestrial Revolution.” For the first time in history, plants and animals on land started to outnumber aquatic life-forms. Angiosperms suffered with the rest of life during the end-Cretaceous mass extinction, but they bounced back quickly. / The relationship between plants and animals that evolved in the past sixty million years is unique, and more interdependent than anything that existed in the past,” Tiffney told me. More than eighty-five per cent of animal and plant species now live on land, even though the oceans cover seventy per cent of the Earth. “Angiosperms never ceased to revolutionize ecosystems,” Sauquet said.


  • Metazous: Esponges (Demosponges 8.000 espècies, Hexactinellida 1.000, espècies, Calcarea   i Placozous
  • eumetazous
    • cnidaris i ctnetofors (meduses) P. Edicarià 635 Ma
    • bilaterals  P. Edicarià primers antecessors
      • protostomos: (l’embrió fa primer la boca i després l’anus), artròpodes, mol·luscs,  platelmintos, mol·luscs, artròpodes.
      • deuterostomos: (l’embrió primer fa l’anus i després la boca), Equinoderms i Cordats.

p.258 Al Edicarià, 635 mA enrera, la vida s’organitza en formes multicel·lulars, metazous, primer en simetria radial, les esponges i després les meduses. Al final del període apareixerien els essers amb simetria bilateral com la Kimberella (que surt als avantpassats) i els dos tipus de desenvolupament de l’embrió, protostomes i deuterostomes.


Protostomes    p.260 Amb 1.140.000 espècies son la majoria dels animals vius. Totes les formes apareixen al Càmbric, 540Ma i es van diversificant [ mosques i abelles al mesozoic]
  • lofotrocos [tous]
    • Rotífers
    • Platelmintos (14.000) ordovicià
    • Mol·luscs (120.000 espècies) Càmbric, al  Paleozoic (Devònic i Carbonífer) s’adapten a l’aigua dolça i els hàbitats terrestres. p.262
      • Caudofoveats, Poliplacofòrs, Monoplacofors
      • Gasteròpodes, 103.000 espècies de cargols
      • Cefalòpodes: 900 espècies, calamars, pops
      • Bivalves: 12.000 espècies de petxines
      • Escafopodes
    • Anèlids (14.000)  apareixen al càmbric 450Ma cuc de terra Olligocarta al 230Ma Triàssic.
    • Braquiòpodes (350)
  • Ecdisozous (amb coberta de quitina)
    • Onicofors 80 espècies
    •  nematodes (20.000 espècies Precàmbric), Piriapúlids (26 espècies)
    • euartròpodes p.265 escorpins, aranyes, miriàpodes, hexàpodes o insectes (900.000 espècies)-Euartròpodes. p. 265. (5 famílies extingides com els artiopoda dels trilobites, càmbric, Permià)
      • Quelicerats (sadd ), Aracnida 75.000 espècies, P.Silúric 430mA,
      • Miriàpodes 16.000 espècies, Silúric 430 Ma
      • Crustacis 67.000 espècies, Càmbric 541 Ma
      • Hexapoda Insectes 900.000 espècies, Devonià 400Ma [ són els primers animals que volen]

Deuterostomos (p.266)

-Equinoderms – 6.000 espècies (estrelles i eriçons de mar) P. Câmbric 500Ma i Hemicordats

-cordats 52.000 espècies:

  • Urocordats. 1.300 esp, Càmbric 500Ma
  • Cefalocordats (fòssil Pikaia), 12 esp, Càmbric 500Ma
  • Amb crani i esquelet amb columna vertebral
    • Agnatha lamprea (sense mandíbula) 40 esp, Càmbric 500Ma
    • amb mandíbula (Gnathostomata)
      • Placoderms X (mig Sil·lúric a finals Devonià)
      • Condrictos (cartilaginosos, taurons i rajades) 850 esp. P. Silúric 430 Ma
      • Ostíctis [ amb ossos]
        • Sarcopterigis (amb aletes a parelles, peixos pulmonats, rèptils i aus, amfibis, mamífers) 26.000 esp. Silúric  430 Ma
        • Actinopterigis (peixos d’aletes radials) 24.000 esp. Silúric 430 Ma

Adquisició d’un eix de suport o notocorda, un crani per acollir el cervell i un esquelet amb columna vertebral, mandíbula


Sarcopterigis p.268

  • Celacanto, fòssil vivent, Devonià 400Ma
  • Dipnoos, 6 esp de peixos pulmonats, 2 metres, Devonià 400Ma
  • Tetràpodes
    • Extints: Tiktaalik, Ictiostega, Devònic tardà 370Ma
    • lisamfibis: granotes i salamandres, 5.000 espècies, Triàssic 240Ma, que van evolucionar a partir de formes més grans de 1 a 2 m. p.270
      • Gimnofiones sense potes 160 espècies,
      • Urodelos, salamandres 400 espècies, fins a 2m, Juràssic 170Ma
      • Anuros, granotes i gripaus, 4.300 espècies, Juràssic 170 Ma
    • amniotas, (rèptils, ocells, mamífers) (membrana al voltant de l’embrió que permet reproducció sense dependre de l’aigua),  21.000 espècies. Carbonífer 300Ma.
      • sinàpsides (mamífers), un sol forat rera l’ull per múscul mandíbula, 4.500 espècies, predominaven al final del Pèrmic però després de l’extinció del Pèrmic els rèptils van passar a dominar. S’extenen al Cenozoic.
      • sauròpids (rèptils) Diàpsids, 17.000 esp, dos forats
        • Quelonis, (tortugues) , 300 espècies, Triàssic, 240Ma
        • Escamosos (llargandaixos i serps -quehan perdut les potes), 7.000 espècies, Juràssic 170Ma
        • Arcosauris (dinosaures extingits, 10.000 ocells, 25 cocodrils), Pèrmic 270Ma

[pas a la vida terrestre] A partir de les aletes es formen extremitats que serviran per passar a la vida terrestre. La membrana dels amniotes al voltant de l’embrió. [en passar a terra es desenvolupa l’olfacte][inicialment no es veu més diferència entre sinàpsids i Arcosauris que el forat al crani?]

[els mudskippers són peixos mig amfibis, amb potes]

 


Arcosauris (p.288) [A més del forat per la mandíbula, un forat davant dels ulls -per l’olfacte?- els permetia allargar la mandíbula] Apareixen al Pèrmic juntament amb els Sinàpsids. 270Ma

  • Grups reduits: Prolacertaris X, Euparkeria X
  • Cocodrilomorfs: Sphenosuchia X Triàssic 230Ma, Cocodrils, 23 espècies actuals caçadors semiaquàtics, Cretàcic 130Ma
  • Ictiosaures: aquàtics
  • [Sauropterigis] no surt al llibre, aquàtics, Triàssic 250Ma
  • Pterosauris X, 100 espècies de rèptils voladors, Juràssic 200Ma
  • Dinosaures (postura més erecta) [establert per Owen 1842, Marsh, en sobreviuen els ocells]
    • Ornitisquis X p.290, Triàssic tardà, 220Ma, amb cadera semblant als ocells
      • Herrerasauri X, Pisanosauri X, Heterodontosauris X
      • Tirèfors X herbívor cuirassat de fins a 9m
      • Ornitopodes X, com l’Iguanodon, hervívors, inicialment petits i després fins a 15m
      • Ceratopsids com Triceratops X, herbívors de fins a 9m, amb bec i banyes complicades, Juràssic tardà 150Ma
      • Stegoceras X
    • Sauròpomorfes X, grans herbívors quadrúpedes de fins a 28m de coll llarg.. Triàssic tardà 220Ma
    • Teròpodes p.292, carnívors bípedes, Triàssic tardà 220Ma, antecessors dels ocells
      • Ceratosaures X , varnívors bípedes de fins a 7m, Juràssic 170Ma
      • Megalosaures X, carnívors bípedes, Juràssic, 170Ma
      • Spinosaures X, carnívors bípedes fins a 7m, Juràssic, 170Ma
      • Alosaures X, carnívors bípedes fins a 14m, Juràssic, 170Ma
      • Carcarodont X, carnívors bípedes fins a 14m, Cretàcic, 170Ma
      • Celurosaures (predadors, antecessors dels ocells), Juràssic, 170Ma p. 294 (les extremoitats
          • Composognatus X , 1 a 2 m, Sinosauropters a 2m amb possibles plomes
          • Tiranosaures X, fins a 12m
          • Ornitomisaura X [que imiten els ocells], herbívors
          • Therizinosaures X, herbívors amb de fins a 10m, amb urpes de 60cm
          • Oviraptors X, crani amb bec, alguns petits i altres fins a 8m
          • Alvarezsauris X, petits raptors
          • Troodontids, bípedes fns a 2m
          • Dromeosauris X, entre ells el Velociraptor, amb extremitats amb plomes, petits i fins a 5m
          • Avials, 9.700 espècies, apareixen al Cretàcic, 120Ma, Archaopterix, l’au més antiga

[Les extremitats superiors es van convertint en ales i apareixen plomes. Per què sobreviuen els ocells a l’extinció?]


Sinàpsids p.272 , s’assemblen als llargandaixos, rèptils mamaliformes, es caracteritzen per un forat temporal inferior [quina rellevància té?]. Apareixen al Carbonífer tardà, 320Ma i la majoria desapareixen a l’extinció del Pèrmic. sobreviuran els Cinodonts al llarg del Mesozoic.

  • Caseasauris X, Varanòpsids X , Ofiacodonts X, Edafosauris X herbívors amb una creta dorsal, Esfenacodonts X desapareixen al Pèrmic.
  • Teràpsids:
    • Dinocèfals X, Dicincotonts X herbívors que van sobreviure fins al Mesozoic, Gorgonòpsids X carnívors de fins a 4m, Terocèfals X, van arribar fins a mig Triàssic
    • Cinodonts p.274: Especialització de les dents, postura més vertical, sang calenta que permetrà colonitzar llocs fred i calents del planeta, finals del Pèrmic,  252Ma
      • Procinosúquids X Trinaxodontids X, Cinognatus X, Diademontids X, Traversodòntids X
      • Mamaliformes
        • Trilodòntids, herbívors del Triàssic i Juràssic, 256 a 170Ma
        • Mamífers p.276, sang calenta, dents especialitzades i cervell més gran, es van tornant més petits. Apareixen a mig Juràssic 170Ma i han de competir amb els dinosaures. Alguns sobreviuran l’extinció. [petits rosegadors], per poc temps, queden Monotremes i Teris
          • Sinocodontids X, Morganucodontids X, Docodòntids X
          • Teriformes:
            • Monotremes , han sobreviscut L’ornitorrinc i les equidnes, mamífers que posen ous.
            • Eutriconodont X, Multituberculats X, Symetrodonts X, Driolestida X,
            • Teris, 4.500 espècies de mamífers actuals, que crien sense ous, mig Juràsic, 170Ma

Especialització de les dents per a hervíbors i carnívors, sang calenta o endotèrmia, que permet viure a entorns amb  (però obliga a consumir més calories), cervell més gran per processar sentits de la vista i olfacte. teris pareixen les cries sense estar protegides dins d’un ou [hauran de mamar un temps abans de poder alilmentar-se soles]


Teris p.278, tots els que tenen cries sense ous, apareixen a mig Juràssic 170Ma

  • T Deltateris X
  • T Marsupials: les cries acaben de madurar en una bossa, Ameridelfs Opòssums o sarigues, 100 esp a Amèrica, i Australidelfs (cangurs), apareixen al Paleocè
  • T Euteris  que pareixen ja formades tot i que hauran de mamar durant un temps,  les  amb l’antecessor Juramaia   es remunten a mig Juràssic
    • T E Afroteris T E p. 280: apareixen a Àfrica al Paleocè 60Ma, o potser abans al Cretàcic, i es propaguen a Àsia, només en queden 75 espècies.
      • T E A [insectívors petits] Tubulidentata (porc formiguer) , Afrosoricids (Tenrecs), Musaranyes elefant, Hiracoides (Damans) semblants als conills d’Índies,
      • T E A Embritròpodes X, herbívor semblant als rinoceronts
      • T E A Proboscidis: Elefant africà, elefant asiàtic
      • T E A Sirènids, manatí [“Els manatís són animals afables i lents. La major part del seu temps es dediquen a menjar, descansar i viatjar”]fins a 4m de llargada.
    • T E Xenartros,  articulació amb la cua, apareixen al Paleocè 60Ma: Pilosos amb 10 espècies, entre els quals hi ha els Peresosos, que a l’Oligocè van arribar als 6m, i l’ós formiguer. Cingulats amb 20 espècies d’armadillos.
    • T  E Boreo: 4.500 espècies, Cretàcic 100Ma
      • T E B Euarcontoglires: [ majoria rosegadors?] musaranyes,  rosegadors, primats 2300 espècies, Paleocè 50Ma
        • T E B E Glires [rosegadors], 2.300 espècies
          • T E B E G lagomorfs, comencen al Paleocè 60Ma
            • Lepòrids: conills i llebres, 50 espècies, Eocè 40Ma
            • Ochotona, Picas, 40 espècies, semblants als hàmters però amb incisius com els conills, Oligocè 30Ma
          • T E B E G Rosegadors
            • Esciuromorfes, 300 espècies d’esquirols i marmotes, Eocè 40Ma
            • Castoriformes, Castors (van arribar a fer 2.5 m), Eocè 40Ma
            • Miomorfes, 1.140 espècies de rates, ratolins i hàmsters, Paleocè 50Ma
            • Hystricomorfa, 200 espècies, porcespins, conills d’índies i capibares, apaeixen a Amèrica del sud, Oligocè 30Ma
        • T E B E Euarcontos
          • T E B E E Dermòpters, 2 espècies de lèmurs voladors Paleocè 50Ma
          • T E B E E Scadentia 20 espècies de tupaies, semblants als esquirols eocè 40Ma
          • T E B E E Primats, 201 espècies Paleocè 50Ma, cervell més gran, polze oposat
      • T E Laurasiaterius 1.800 espècies, ratpenats, carnívors, balenes Cretàcic 100Ma
        • T E L Eulipotyphila [ insectívors que s’hi veuen poc] eriçons, talps, musaranyes, 300 espècies, Paleocè 60Ma
        • T E L Quiròpters, 1.000 espècies de ratpenats, Eocè 40Ma
        • T E L Perissodactyla, 18 espècies, cavalls, zebres i rinoceronts, Paleocè 50Ma
        • T E L Feres 290
          • T E L F Carnívors, 280 espècies, morses, ossos, hienes, gats, Paleocè 50Ma
          • T E L F Pholidota 10 espècies de Pangolins, Eocè 40Ma
        • T E L Certiodàctils [ 300 ungulats]
          • T E L C Tylopoda 10 espècies camells, llames, eocè 40Ma
          • T E L C Suina, 20 espècies porcs, senglars, pecarís, Eocè 40Ma
          • T E L C Ruminantia, 200 espècies, bisons, cérvols, vaques amb estómac per digerir herba, Eocè 40Ma
          • T E L C Hippopotamidae, 2 espècies, Eocè 40Ma
          • T E L C Cetacis, 80 espècies , Paleocè 50Ma [ com van tornar al mar?]

[ diversificació dels mamífers al llarg del Paleogen després de sobreviure a l’extinció]


PRIMATS p.284, inicis al Paleocè 50Ma i s’escampen al Miocè 20Ma [el sufix “rins” es refereix al nas, que classifiquen per la forma del nas]

  • P Estrepsirins (es distingeixen per la forma de les dents de davant i membrana als narius)
    • P E Lorisifomes: 10 espècies de loris i potos, animals nocturns amb grans ulls, Eocè, 40Ma
    • P E Lemuriformes, 20 espècies localitzades a Madagascar, abans més extens, Eocè, 40Ma.
  • P Haplorins:
    • P H Tarsis, 3 espècies al suedst asiàtic, Paleocè 50Ma, Tarsius, petits d’ulls rodons.
    • P H Simiformes, els simis se separen dels Tarsis al Paleocè, 60Ma
      • P H S Platirins, els simis del Nou Món, narius que apunten al costat, que van evolucionar a partir dels Africans fa 40Ma, registre fòssil Oligocè, 50 espècies.
      • P H S Catirrinos , narius que apunten cap avall,  Aegyptopithecus p.202 20Ma 34Ma, 5 famílies extingides.
        • P H S C Cercotipecoideus: o micos del vell món, babuins, macacos, 80 espècies, Miocè 20Ma
        • P H S C Hominoideus: 4 famílies extingides (20.4 Ma)
          • P H S C H Hylobatidae gibons, 9 espècies, llargs braços sense cua 7Ma
          • P H S C H Homínids: (Hominidae), els grans simis, ancestre més remot fa 14Ma al Miocè
            • P H S C H H pòngids, Orangutans, Miocè 15.7Ma
            • P H S C H H Homininae: simis africans, fa 10Ma darrer ancestre comú
              • P H S C H H Goriles, se separen fa uns 8.8Ma
              • P H S C H H Homininos: 1 espècie extingides
                • P H S C H H H Pan troglodites Ximpanzé (separats fa 6.3 Ma)
                • P H S C H H H Homo, 20 espècies extingides

[ desenvolupen habitat a les mans en enfilar-se als arbres, i quan tornen a terra seran capaços de fer servir eines]


Nombre d’Espècies

El resum del llibre de Ciència de DK dóna:

  • Bacteris: 5000 (incloent 209 Arquebacteris)
    Protistes: 65.000 (Amebes, ciliats, fongs, algues vermelles i marrons)
  • Bolets: 100.000
  • Plantes: 350.000
    • Algues 6m, molses 25m, falgueres i equisets 13m
    • Coníferes: 550
    • Angiospermes: 275.000
  • Animals
    • Invertebrats no articulats: 150.000
      • Cnidaria i Porifera 14.5m
      • Platelmintos, anèlids, nematodes altres 40m
      • Mol·luscs: 90m
      • Equinoderms 6m
    • Artròpodes: 1120.000
      • Insectes 1000m
      • Crustacis 40m
      • Aràcnids 70m
      • Miràpodes i centípedes 9m
    • Vertebrats 49.000
      • Peixos: 26m
      • amfibis: 4m
      • rèptils: 6m
      • aus: 9m
      • mamífers: 4m

[Recollint la mirada general de Cuvier de 4 grans tipus d’animals: 49m vertebrats, 150m mol·luscs i similars, 1120m articulats i 70m zoòfits.


Arbre de la vida simplificat (esborrany)

Nou arbre de la vida (wikipedia) basat en els ribosomes de les proteines assenyalant la diversitat en la mecànica de la vida, les bactèries vs els eucariotes.


 


Arbre filogenètic    |     Cladograma    |      ITOL, eina per crear arbres de la vida

Sobre l’aparició dels sons a la terra: David George Haskell, Sounds Wild and Broken: Sonic Marvels, Evolution’s Creativity, and the Crisis of Sensory Extinction. Durant un temps a la terra només se sentien pedres que rodolaven, aigua, llamps i vent. Durant 3000 anys la vida va ser silenciosa. Problement el primer animal a emetre sons va ser un grill. En els vertebrats, les granotes, capaces de fugir amb un salt de le seves potents cames, les salamandres són silencioses.  [ L’univers, una exposició sonora ]

Blauet

 

Alcedo Atthis

El blauet comú (o simplement blauet o blavet al País Valencià), blavenca,[1] arner,[2] dormissó,[1] martinet,[3] terrola[4][5] a les Balears (reiet en solsoní) (Alcedo atthis) és un moixó no passeriforme que és el més acolorit d’entre els ocells aquàtics, presenta una dieta principalment ictiòfaga, nidifica en forats excavats en talussos terrosos vora l’aigua i és força sensible a l’estat dels corrents fluvials i masses d’aigua. És un moixó de l’ordre dels coraciformes i de la família dels alcedínids. La subespècie dita martí pescaire, martí pescador, martinet al País Valencià, reiet (Urgell, País Valencià) o botiguer[6] (Alcedo Atthis Ispida) és molt coneguda.


23/10/2020 al pantà d’Ulldecona, un punt blau brillant volant veloç

Xicoia

Xicoia. O lletsó, s’anomenen “dent de lleó” per la forma dentada de les fulles. Aquesta m’ha crescut al balcó. Passa que les fulles tenen una forma molt particular que no he sabut trobar en els llibres ni a internet.

Virus

La vida  Llista d’espècies    Arbre de la vida


Material genètic, seqüències curtes de DNA o proteïnes que només es reprodueixen dins d’un hoste. [Penetren la membrana i alliberen el seu material genètic que es desplaça fins al nucli on es replicarà. Després torna a la membrana on surt fora de la cèl·lula morta]

Origen al precàmbric. [ Com que depenen d’altres cèl·lules per viure suposo que van aparèixer més tard] Podrien haver evolucionat a partir de plàsmids, fragments de DNA que es mouen entre les cèl·lules, o a partir de bacteris.

Se n’han descrit uns 6.000.


Els virus vegetals només contenen RNA, amiden entre 20 i 500 nm, pe. virus del mosaic del tabac, civada, etc.

Virus del tabac sota microscopi electrònic, 160m augments.


La major part dels virus que afecten animals solen ser icosaèdrics, altres espirals.

En la majoria de casos no són perjudicials i conviuen amb l’hoste. Quan salten d’una espècie a l’altra tenen efectes imprevistos. Els antibiòtics no funcionen [perquè pròpiament no són vida ]. El sistema immune els ataca i els símptomes de malaltia sovint són la sobrereacció del sistema immune.

Com que el sistema immune es debilita poden aparèixer infeccions secundàries [ que si són per bactèris aquestes sí que es tracten amb antibiòtics]

D’altres virus RNA són el de la ràbia (transmès per mossegada, 6 setmanes d’incubació i mort), mixovirus (causen grip, xarampió, rubeola=varicela), reovirus, arbovirus (encefalitis), picornavirus (poliomelitis, meningitis, encostipat de nas i coll).

Són virus de DNA els poxvirus (verola), virus de l’herpes, adenovirus (encostipat d’hivern), papovavirus (verrugues), bacteriòfags)


viqui |   wiki |  Vida no cel·lular  |  sobre els virus

Tora blava

https://ca.wikipedia.org/wiki/Tora_blava

La Tora Blava (Aconitum Napellus), ja llueix ben florida al Parc natural del Cadí-Moixeró. Ara bé, no us deixeu enganyar per la seva bellesa, ja que estem parlant de la planta més tòxica d’Europa!

Tota la planta, des de l’arrel fins a les fulles i les flors, conté una substància altament tòxica (només calen 2 mg d’aquesta substància per matar a un ésser humà adult).

Es diu que en el passat es fregaven les puntes de les fletxes amb aquesta planta per fer-les més mortíferes.

 

Efemeròpters

(efemeròpters)

Els estadis juvenils, denominats nimfes, són totalment aquàtics, habitant especialment els cursos d’aigua, però també llacs, llacunes, basses tant d’aigua dolça com salobre. El desenvolupament nimfal és molt més llarg que la vida de l’adult. Sol durar un any, encara que en algun cas (Ephemera danica) dura dos anys, i en uns altres (en zones tropicals) es tenen dues generacions en un any, registrant-se en algun cas 27 mudes.

La vida dels adults és molt curta; moltes espècies viuen menys d’un dia: emergeixen al capvespre i al matí han mort; la seva única missió és l’aparellament i la posta dels ous; unes altres viuen fins a una setmana. L’aparellament té lloc a l’aire; els mascles realitzen vol nupcial formant eixams que es desplacen verticalment a dalt i a baix, i horitzontalment al llarg del riu; les femelles s’apropen a l’eixam i aconsegueixen que un o diversos mascles l’abandonin per a seguir-la i aparellar-se. Les femelles dipositen els ous a l’aigua, d’un en un o en tandes; algunes espècies els deixen caure mentre la sobrevolen, i unes altres penetren a l’interior, morint després de la posta. Són voladores mediocres que s’allunyen poc de l’aigua.

Al riu Tisza, a Hongria i Sèrbia, (Kanjiža cap a Horgoš), cada juny al capvespre hi ha l’espectacle de les Palingenia longicauda (fins a 12 cm) que semblen florir de les aigües. L’exemplar que vaig trobar el maig de 2019 deu ser un cosí petit.

The brief lives of mayfly adults have been noted by naturalists and encyclopaedists since Aristotle and Pliny the Elder in classical times.

Pinsà

El pinsà comú, pinsà o pardal d’ala blanca (Fringilla coelebs, del llatí vulgar pincio i aquest de pinc, onomatopeia del crit) és un ocell de l’ordre dels passeriformes i de la família dels fringíl·lids. És una de les espècies més comunes de Catalunya on es reuneixen estols de centenars d’exemplars, repartits entre conreus, pastures, boscos i arbredes.

Durant anys he sentit el seu cant a les excursions, sense poder-lo identificar. El juliol de 2019 a Núria vaig poder fer-li una foto i en sentir-lo cantar, per fi en vaig poder saber el nom.

Núria, juliol 2019

 

 

Colom

Columba livia

Seria un ocell agradable si no s’hagués convertit en una plaga que m’oblida a tenir les basses tapades a la terrassa.

Xatrac

Sterna hirundo

El veig sovint en caiac a Barcelona. Més fi que les gavines

Orenetes

Hirundo rustica

Cada any les espero, a mitjans d’abril, i m’alegren l’estiu quan les veig volar veloces fent curses al pati de veïns, o quan estic assegut a la terrassa.

Miró. Oiseau dans l’espace 1976. Reina Sofía


Llavors Diotima i jo ens envolàvem; corríem d’ací d’allà com orenetes, d’una primavera del món a l’altra, per l’ample domini del sol i més enllà, cap a les altres illes del firmament, per les ribes daurades de Sírius, per les valls d’Arctur plenes d’esperits… [ Hölderlin, Hiperió, p.76]

Merla

Turdus merula

Em saluda els matins i m’acompanya les tardes a la terrassa.

Roure reboll

Quercus Pyrenaica (tot i que no n’hi ha Pirineu), a Catalunya només al bosc de Poblet a les muntantes de Prades. Es diu reboll perquè rebrota després de tallar-lo.

juny 2019

Rajada

Rajada, família rajidae

20/06/2019, platja Bogatell

En la nedada després de córrer, i després d’esquivar meduses marrons, he vist una rajada d’uns 40 cm al fons a la sorra.